MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 173646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021285	GTT	2	6	645592	645597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528982410
16003	NC_021285	GGC	2	6	645655	645660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982410
16004	NC_021285	GCC	2	6	645748	645753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982410
16005	NC_021285	AGG	2	6	645768	645773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528982410
16006	NC_021285	ATC	2	6	645782	645787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528982410
16007	NC_021285	CAG	2	6	645814	645819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982410
16008	NC_021285	GCA	2	6	645843	645848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982410
16009	NC_021285	GCG	2	6	645956	645961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982410
16010	NC_021285	TTG	2	6	646019	646024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528982410
16011	NC_021285	GTC	2	6	646165	646170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982410
16012	NC_021285	GCCATG	2	12	646229	646240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528982410
16013	NC_021285	ATGA	2	8	646259	646266	50 %	25 %	25 %	0 %	528982410
16014	NC_021285	CGT	2	6	646569	646574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16015	NC_021285	GAAT	2	8	646588	646595	50 %	25 %	25 %	0 %	528982411
16016	NC_021285	GCC	2	6	646604	646609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982411
16017	NC_021285	GCA	2	6	646626	646631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16018	NC_021285	GCA	2	6	646677	646682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16019	NC_021285	CAG	2	6	646705	646710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16020	NC_021285	GTT	2	6	646729	646734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528982411
16021	NC_021285	GCA	2	6	646735	646740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16022	NC_021285	GCCA	2	8	646769	646776	25 %	0 %	25 %	50 %	528982411
16023	NC_021285	GTC	2	6	646777	646782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16024	NC_021285	GAT	2	6	646783	646788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982411
16025	NC_021285	GTG	2	6	646793	646798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982411
16026	NC_021285	CGG	2	6	646807	646812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982411
16027	NC_021285	CGG	2	6	646875	646880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982411
16028	NC_021285	GCG	2	6	646883	646888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982411
16029	NC_021285	GCT	2	6	646989	646994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16030	NC_021285	GGC	2	6	647044	647049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982411
16031	NC_021285	GC	3	6	647048	647053	0 %	0 %	50 %	50 %	528982411
16032	NC_021285	CAG	2	6	647173	647178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
16033	NC_021285	CG	3	6	647181	647186	0 %	0 %	50 %	50 %	528982411
16034	NC_021285	GCA	2	6	647193	647198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
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16036	NC_021285	CGA	2	6	647296	647301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982411
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16040	NC_021285	GCG	2	6	647501	647506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982412
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16043	NC_021285	CAG	2	6	647584	647589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982412
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16045	NC_021285	GC	3	6	647683	647688	0 %	0 %	50 %	50 %	528982412
16046	NC_021285	GGCGT	2	10	647712	647721	0 %	20 %	60 %	20 %	528982412
16047	NC_021285	GCG	2	6	647747	647752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982412
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16049	NC_021285	GTCG	2	8	647877	647884	0 %	25 %	50 %	25 %	528982412
16050	NC_021285	TCTTGT	2	12	647948	647959	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	528982412
16051	NC_021285	TGG	2	6	648014	648019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982412
16052	NC_021285	CGG	2	6	648053	648058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982412
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16055	NC_021285	GAA	2	6	648424	648429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528982413
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16058	NC_021285	CGGC	2	8	648517	648524	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16059	NC_021285	GC	3	6	648550	648555	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16060	NC_021285	CGC	2	6	648578	648583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982413
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16062	NC_021285	GC	3	6	648608	648613	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16063	NC_021285	GATC	2	8	648631	648638	25 %	25 %	25 %	25 %	528982413
16064	NC_021285	GGC	2	6	648652	648657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982413
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16068	NC_021285	GC	4	8	648803	648810	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16069	NC_021285	GGCCAA	2	12	648823	648834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982413
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16071	NC_021285	CG	3	6	648902	648907	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16072	NC_021285	GC	3	6	648921	648926	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16073	NC_021285	TGG	2	6	648927	648932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982413
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16083	NC_021285	TGC	3	9	649206	649214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982413
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16086	NC_021285	CG	3	6	649275	649280	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16087	NC_021285	CTG	2	6	649286	649291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982413
16088	NC_021285	GC	3	6	649305	649310	0 %	0 %	50 %	50 %	528982413
16089	NC_021285	CTG	2	6	649313	649318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982413
16090	NC_021285	GGCG	2	8	649321	649328	0 %	0 %	75 %	25 %	528982413
16091	NC_021285	ACG	2	6	649329	649334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982413
16092	NC_021285	CTG	2	6	649370	649375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982413
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16097	NC_021285	A	6	6	649521	649526	100 %	0 %	0 %	0 %	528982413
16098	NC_021285	ATCG	2	8	649553	649560	25 %	25 %	25 %	25 %	528982414
16099	NC_021285	GCT	2	6	649585	649590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
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16101	NC_021285	CG	3	6	649619	649624	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
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16103	NC_021285	GTC	2	6	649661	649666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16104	NC_021285	GGT	2	6	649702	649707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16105	NC_021285	GAG	2	6	649709	649714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	528982414
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16108	NC_021285	CGG	2	6	649845	649850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
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16118	NC_021285	CG	3	6	650370	650375	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16119	NC_021285	ACC	2	6	650438	650443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528982414
16120	NC_021285	CGC	2	6	650444	650449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982414
16121	NC_021285	CCG	2	6	650486	650491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982414
16122	NC_021285	TCG	2	6	650529	650534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16123	NC_021285	TGA	2	6	650556	650561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982414
16124	NC_021285	GCT	2	6	650563	650568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16125	NC_021285	GC	3	6	650620	650625	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16126	NC_021285	TGG	2	6	650643	650648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16127	NC_021285	GCT	2	6	650659	650664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16128	NC_021285	GCTGGG	2	12	650683	650694	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	528982414
16129	NC_021285	TGG	2	6	650748	650753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16130	NC_021285	ACG	2	6	650754	650759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16131	NC_021285	GTG	2	6	650765	650770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16132	NC_021285	CAT	2	6	650788	650793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528982414
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16134	NC_021285	GCG	2	6	650850	650855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16135	NC_021285	TCG	2	6	650859	650864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16136	NC_021285	GGT	2	6	650872	650877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16137	NC_021285	TTC	2	6	650906	650911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528982414
16138	NC_021285	CGGC	2	8	651036	651043	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16139	NC_021285	CAC	2	6	651044	651049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528982414
16140	NC_021285	CTT	2	6	651061	651066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528982414
16141	NC_021285	CG	3	6	651088	651093	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16142	NC_021285	GC	3	6	651113	651118	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16143	NC_021285	GGC	2	6	651181	651186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16144	NC_021285	GCT	2	6	651187	651192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16145	NC_021285	CG	3	6	651196	651201	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16146	NC_021285	CGT	3	9	651207	651215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16147	NC_021285	CGA	2	6	651223	651228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16148	NC_021285	CGC	2	6	651273	651278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982414
16149	NC_021285	ATG	2	6	651320	651325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982414
16150	NC_021285	TTC	2	6	651401	651406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528982414
16151	NC_021285	GCG	2	6	651430	651435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16152	NC_021285	GGT	2	6	651460	651465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982414
16153	NC_021285	CGC	3	9	651525	651533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982414
16154	NC_021285	CGG	2	6	651583	651588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16155	NC_021285	CTG	2	6	651626	651631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16156	NC_021285	GCG	3	9	651632	651640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16157	NC_021285	GACG	2	8	651658	651665	25 %	0 %	50 %	25 %	528982414
16158	NC_021285	CGA	2	6	651748	651753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982414
16159	NC_021285	GCG	2	6	651823	651828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16160	NC_021285	CGTGGA	2	12	651859	651870	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	528982414
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16163	NC_021285	CAG	2	6	652024	652029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982414
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16165	NC_021285	GGC	2	6	652060	652065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982414
16166	NC_021285	CG	3	6	652074	652079	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16167	NC_021285	CTGGCG	2	12	652175	652186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528982414
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16175	NC_021285	CGCTGG	2	12	652479	652490	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528982414
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16177	NC_021285	GC	3	6	652509	652514	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16178	NC_021285	GCC	2	6	652517	652522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982414
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16181	NC_021285	GC	3	6	652621	652626	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
16182	NC_021285	CG	3	6	652633	652638	0 %	0 %	50 %	50 %	528982414
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16185	NC_021285	GCGCTG	2	12	652699	652710	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528982415
16186	NC_021285	GCT	2	6	652715	652720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982415
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16192	NC_021285	GCA	2	6	652932	652937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982415
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16195	NC_021285	TTC	2	6	653071	653076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528982415
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16198	NC_021285	GAA	2	6	653128	653133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	528982415
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16205	NC_021285	CG	3	6	653345	653350	0 %	0 %	50 %	50 %	528982415
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16220	NC_021285	GCCG	2	8	653698	653705	0 %	0 %	50 %	50 %	528982415
16221	NC_021285	GCA	2	6	653768	653773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982415
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16224	NC_021285	GA	3	6	653890	653895	50 %	0 %	50 %	0 %	528982415
16225	NC_021285	CG	3	6	653903	653908	0 %	0 %	50 %	50 %	528982415
16226	NC_021285	GCA	2	6	653982	653987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982415
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16230	NC_021285	CG	3	6	654107	654112	0 %	0 %	50 %	50 %	528982416
16231	NC_021285	CAG	2	6	654115	654120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982416
16232	NC_021285	GCG	3	9	654212	654220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982416
16233	NC_021285	ATC	2	6	654253	654258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528982416
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16235	NC_021285	CCG	2	6	654291	654296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982416
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16237	NC_021285	GGC	2	6	654376	654381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982416
16238	NC_021285	TCG	2	6	654413	654418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982416
16239	NC_021285	ATC	2	6	654443	654448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	528982416
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16241	NC_021285	CGG	2	6	654482	654487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982416
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16245	NC_021285	CTG	2	6	654586	654591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982416
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16251	NC_021285	GC	3	6	654932	654937	0 %	0 %	50 %	50 %	528982417
16252	NC_021285	CGCGG	2	10	654944	654953	0 %	0 %	60 %	40 %	528982417
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16338	NC_021285	CCG	2	6	657992	657997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982418
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16340	NC_021285	CG	4	8	658037	658044	0 %	0 %	50 %	50 %	528982418
16341	NC_021285	CG	3	6	658056	658061	0 %	0 %	50 %	50 %	528982418
16342	NC_021285	CTT	2	6	658076	658081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	528982418
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16344	NC_021285	CGT	2	6	658118	658123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982418
16345	NC_021285	CCA	3	9	658124	658132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	528982418
16346	NC_021285	CAG	2	6	658155	658160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982418
16347	NC_021285	CAG	2	6	658164	658169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982418
16348	NC_021285	ATG	2	6	658195	658200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982418
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16354	NC_021285	TCGA	2	8	658330	658337	25 %	25 %	25 %	25 %	528982418
16355	NC_021285	TGA	2	6	658343	658348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982418
16356	NC_021285	GC	3	6	658350	658355	0 %	0 %	50 %	50 %	528982418
16357	NC_021285	CGG	2	6	658386	658391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982418
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16359	NC_021285	GTTC	2	8	658418	658425	0 %	50 %	25 %	25 %	528982418
16360	NC_021285	GGCGT	2	10	658459	658468	0 %	20 %	60 %	20 %	528982418
16361	NC_021285	CGGC	2	8	658484	658491	0 %	0 %	50 %	50 %	528982418
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16364	NC_021285	CTGC	2	8	658679	658686	0 %	25 %	25 %	50 %	528982418
16365	NC_021285	GTT	2	6	658689	658694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528982418
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16368	NC_021285	GCC	2	6	658785	658790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982418
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16372	NC_021285	TCGCC	2	10	658916	658925	0 %	20 %	20 %	60 %	528982418
16373	NC_021285	TTG	2	6	659014	659019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	528982418
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16477	NC_021285	TCCA	2	8	663097	663104	25 %	25 %	0 %	50 %	528982421
16478	NC_021285	GTA	2	6	663141	663146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	528982421
16479	NC_021285	GCA	2	6	663149	663154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982421
16480	NC_021285	TCC	2	6	663160	663165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	528982421
16481	NC_021285	CTG	2	6	663168	663173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982421
16482	NC_021285	GC	3	6	663199	663204	0 %	0 %	50 %	50 %	528982421
16483	NC_021285	AGC	2	6	663238	663243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982421
16484	NC_021285	GGC	2	6	663330	663335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982421
16485	NC_021285	GC	3	6	663620	663625	0 %	0 %	50 %	50 %	528982422
16486	NC_021285	CGT	2	6	663627	663632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	528982422
16487	NC_021285	CG	3	6	663633	663638	0 %	0 %	50 %	50 %	528982422
16488	NC_021285	CGC	2	6	663645	663650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422
16489	NC_021285	GCC	3	9	663683	663691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422
16490	NC_021285	GCTGAC	2	12	663714	663725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	528982422
16491	NC_021285	GCTGGC	2	12	663726	663737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	528982422
16492	NC_021285	GCA	2	6	663746	663751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	528982422
16493	NC_021285	GCC	3	9	663765	663773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422
16494	NC_021285	GGT	2	6	663780	663785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982422
16495	NC_021285	CGC	2	6	663807	663812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422
16496	NC_021285	GC	3	6	663847	663852	0 %	0 %	50 %	50 %	528982422
16497	NC_021285	CGC	2	6	663860	663865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422
16498	NC_021285	GGC	2	6	663880	663885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	528982422
16499	NC_021285	GGT	2	6	663936	663941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	528982422
16500	NC_021285	CCG	2	6	663956	663961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	528982422

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