MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Amycolatopsis orientalis HCCB10007

Total Repeats: 221691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
156001	NC_021252	TGA	2	6	6314421	6314426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934120
156002	NC_021252	ACG	2	6	6314468	6314473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934120
156003	NC_021252	GCC	2	6	6314526	6314531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934120
156004	NC_021252	ATC	2	6	6314588	6314593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934120
156005	NC_021252	GCC	3	9	6314599	6314607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934120
156006	NC_021252	GCCAGC	2	12	6314700	6314711	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	506934120
156007	NC_021252	TGC	2	6	6314857	6314862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156008	NC_021252	CTG	2	6	6314874	6314879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156009	NC_021252	AC	3	6	6314883	6314888	50 %	0 %	0 %	50 %	506934121
156010	NC_021252	AGTG	2	8	6314927	6314934	25 %	25 %	50 %	0 %	506934121
156011	NC_021252	GCG	2	6	6314945	6314950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156012	NC_021252	CGG	2	6	6315008	6315013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156013	NC_021252	GCC	2	6	6315041	6315046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934121
156014	NC_021252	GCT	3	9	6315047	6315055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156015	NC_021252	GAC	2	6	6315057	6315062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156016	NC_021252	GAG	2	6	6315063	6315068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934121
156017	NC_021252	CGG	2	6	6315097	6315102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156018	NC_021252	GAG	2	6	6315126	6315131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934121
156019	NC_021252	GTC	2	6	6315156	6315161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156020	NC_021252	GCC	2	6	6315170	6315175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934121
156021	NC_021252	ACG	2	6	6315213	6315218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156022	NC_021252	CGG	2	6	6315220	6315225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156023	NC_021252	CGC	2	6	6315248	6315253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934121
156024	NC_021252	GAC	2	6	6315285	6315290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156025	NC_021252	GAG	2	6	6315327	6315332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934121
156026	NC_021252	TGG	2	6	6315388	6315393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934121
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156028	NC_021252	CG	3	6	6315478	6315483	0 %	0 %	50 %	50 %	506934121
156029	NC_021252	CGG	2	6	6315491	6315496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156030	NC_021252	TCG	2	6	6315511	6315516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156031	NC_021252	GTC	2	6	6315555	6315560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934121
156032	NC_021252	CGG	2	6	6315592	6315597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156033	NC_021252	CGG	2	6	6315608	6315613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934121
156034	NC_021252	CGA	2	6	6315629	6315634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934121
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156038	NC_021252	ACC	2	6	6315742	6315747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934121
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156040	NC_021252	GCC	2	6	6315759	6315764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934121
156041	NC_021252	ACG	2	6	6315771	6315776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934121
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156044	NC_021252	GC	3	6	6315943	6315948	0 %	0 %	50 %	50 %	506934122
156045	NC_021252	CAA	2	6	6315982	6315987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506934122
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156047	NC_021252	CGG	2	6	6316008	6316013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934122
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156049	NC_021252	TGT	2	6	6316140	6316145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506934122
156050	NC_021252	TCT	2	6	6316194	6316199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934122
156051	NC_021252	CGC	2	6	6316224	6316229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934122
156052	NC_021252	GC	3	6	6316245	6316250	0 %	0 %	50 %	50 %	506934122
156053	NC_021252	CCG	2	6	6316257	6316262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934122
156054	NC_021252	TCCGG	2	10	6316263	6316272	0 %	20 %	40 %	40 %	506934122
156055	NC_021252	CG	3	6	6316274	6316279	0 %	0 %	50 %	50 %	506934122
156056	NC_021252	TCG	2	6	6316295	6316300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934122
156057	NC_021252	TCG	2	6	6316304	6316309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934122
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156060	NC_021252	GCT	2	6	6316357	6316362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934122
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156069	NC_021252	GAA	2	6	6316726	6316731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506934122
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156072	NC_021252	GCTA	2	8	6316821	6316828	25 %	25 %	25 %	25 %	506934122
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156113	NC_021252	ACG	2	6	6318510	6318515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934124
156114	NC_021252	GTG	2	6	6318525	6318530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934124
156115	NC_021252	ACC	2	6	6318531	6318536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934124
156116	NC_021252	GTC	2	6	6318539	6318544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934124
156117	NC_021252	CGC	2	6	6318589	6318594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934124
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156119	NC_021252	CG	3	6	6318645	6318650	0 %	0 %	50 %	50 %	506934124
156120	NC_021252	CCG	2	6	6318735	6318740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934124
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156125	NC_021252	CGA	2	6	6319085	6319090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934125
156126	NC_021252	CGT	2	6	6319128	6319133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934125
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156130	NC_021252	CCGG	2	8	6319224	6319231	0 %	0 %	50 %	50 %	506934125
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156228	NC_021252	CAG	2	6	6323095	6323100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934128
156229	NC_021252	GC	4	8	6323111	6323118	0 %	0 %	50 %	50 %	506934128
156230	NC_021252	CG	3	6	6323121	6323126	0 %	0 %	50 %	50 %	506934128
156231	NC_021252	CGG	2	6	6323160	6323165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934128
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156235	NC_021252	CGG	2	6	6323307	6323312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934128
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156243	NC_021252	TCG	2	6	6323477	6323482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934128
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156324	NC_021252	GC	3	6	6326343	6326348	0 %	0 %	50 %	50 %	506934132
156325	NC_021252	CG	3	6	6326374	6326379	0 %	0 %	50 %	50 %	506934132
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156332	NC_021252	GCGG	2	8	6326597	6326604	0 %	0 %	75 %	25 %	506934132
156333	NC_021252	TCT	2	6	6326697	6326702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934132
156334	NC_021252	ACC	2	6	6326815	6326820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934133
156335	NC_021252	GAT	2	6	6326832	6326837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934133
156336	NC_021252	CCG	2	6	6326859	6326864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
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156338	NC_021252	GCAG	2	8	6326904	6326911	25 %	0 %	50 %	25 %	506934133
156339	NC_021252	ACC	2	6	6326933	6326938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934133
156340	NC_021252	CGG	2	6	6326946	6326951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934133
156341	NC_021252	AGC	2	6	6326957	6326962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934133
156342	NC_021252	CGC	2	6	6326970	6326975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156343	NC_021252	CCG	2	6	6326990	6326995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156344	NC_021252	CCG	2	6	6327012	6327017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156345	NC_021252	TGG	2	6	6327058	6327063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934133
156346	NC_021252	GCC	2	6	6327088	6327093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156347	NC_021252	GAC	2	6	6327094	6327099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934133
156348	NC_021252	CGC	2	6	6327186	6327191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156349	NC_021252	GCT	2	6	6327201	6327206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934133
156350	NC_021252	CAT	2	6	6327255	6327260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934133
156351	NC_021252	AAC	2	6	6327262	6327267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506934133
156352	NC_021252	GC	3	6	6327275	6327280	0 %	0 %	50 %	50 %	506934133
156353	NC_021252	CG	3	6	6327327	6327332	0 %	0 %	50 %	50 %	506934133
156354	NC_021252	CGC	2	6	6327354	6327359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934133
156355	NC_021252	CGA	2	6	6327507	6327512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934134
156356	NC_021252	GC	3	6	6327519	6327524	0 %	0 %	50 %	50 %	506934134
156357	NC_021252	CACCGA	2	12	6327552	6327563	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	506934134
156358	NC_021252	CCTCA	2	10	6327615	6327624	20 %	20 %	0 %	60 %	506934134
156359	NC_021252	CGC	2	6	6327669	6327674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934134
156360	NC_021252	ATC	2	6	6327721	6327726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	506934134
156361	NC_021252	GAG	2	6	6327730	6327735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	506934134
156362	NC_021252	TCCG	2	8	6327757	6327764	0 %	25 %	25 %	50 %	506934134
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156364	NC_021252	GGC	2	6	6327783	6327788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934134
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156366	NC_021252	TCG	2	6	6327814	6327819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934134
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156369	NC_021252	GAA	2	6	6327900	6327905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506934134
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156371	NC_021252	CGG	2	6	6327977	6327982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934134
156372	NC_021252	CAGG	2	8	6328009	6328016	25 %	0 %	50 %	25 %	506934134
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156374	NC_021252	CG	3	6	6328054	6328059	0 %	0 %	50 %	50 %	506934134
156375	NC_021252	GGCG	2	8	6328065	6328072	0 %	0 %	75 %	25 %	506934134
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156380	NC_021252	CG	3	6	6328288	6328293	0 %	0 %	50 %	50 %	506934135
156381	NC_021252	ACCT	2	8	6328305	6328312	25 %	25 %	0 %	50 %	506934135
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156386	NC_021252	CG	4	8	6328505	6328512	0 %	0 %	50 %	50 %	506934135
156387	NC_021252	CACC	2	8	6328528	6328535	25 %	0 %	0 %	75 %	506934135
156388	NC_021252	CCGGGT	2	12	6328541	6328552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	506934135
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156390	NC_021252	CGC	2	6	6328592	6328597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934135
156391	NC_021252	CGA	3	9	6328622	6328630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934135
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156395	NC_021252	CGG	2	6	6328705	6328710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934135
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156400	NC_021252	CGA	2	6	6329057	6329062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934135
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156402	NC_021252	ACG	2	6	6329206	6329211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934135
156403	NC_021252	CGC	2	6	6329273	6329278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934135
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156406	NC_021252	CGG	2	6	6329416	6329421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934135
156407	NC_021252	CGT	2	6	6329453	6329458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934135
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156416	NC_021252	TCG	2	6	6329680	6329685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934135
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156421	NC_021252	ACG	2	6	6329824	6329829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934135
156422	NC_021252	GCT	3	9	6329867	6329875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934135
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156429	NC_021252	CAA	2	6	6330131	6330136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	506934135
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156440	NC_021252	CGT	2	6	6330545	6330550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934136
156441	NC_021252	CCT	2	6	6330554	6330559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	506934136
156442	NC_021252	GC	3	6	6330590	6330595	0 %	0 %	50 %	50 %	506934136
156443	NC_021252	GTC	2	6	6330630	6330635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934136
156444	NC_021252	TCT	2	6	6330640	6330645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	506934136
156445	NC_021252	TCG	2	6	6330646	6330651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934136
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156447	NC_021252	GGC	2	6	6330726	6330731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934137
156448	NC_021252	AGC	3	9	6330778	6330786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156449	NC_021252	TGG	2	6	6330794	6330799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	506934137
156450	NC_021252	ACC	2	6	6330822	6330827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934137
156451	NC_021252	CAG	2	6	6330837	6330842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156452	NC_021252	CGA	2	6	6330851	6330856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156453	NC_021252	CGGCG	2	10	6330908	6330917	0 %	0 %	60 %	40 %	506934137
156454	NC_021252	GTC	2	6	6330960	6330965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156455	NC_021252	GCA	2	6	6331022	6331027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156456	NC_021252	AGC	2	6	6331034	6331039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156457	NC_021252	TCGCG	2	10	6331082	6331091	0 %	20 %	40 %	40 %	506934137
156458	NC_021252	TCG	2	6	6331096	6331101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156459	NC_021252	CG	3	6	6331177	6331182	0 %	0 %	50 %	50 %	506934137
156460	NC_021252	CGC	2	6	6331247	6331252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934137
156461	NC_021252	CGAGCA	2	12	6331259	6331270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156462	NC_021252	GCC	2	6	6331271	6331276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934137
156463	NC_021252	CGG	2	6	6331277	6331282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934137
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156465	NC_021252	CG	3	6	6331300	6331305	0 %	0 %	50 %	50 %	506934137
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156467	NC_021252	GAC	2	6	6331383	6331388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
156468	NC_021252	CGA	2	6	6331416	6331421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934137
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156474	NC_021252	ACC	2	6	6331609	6331614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934137
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156478	NC_021252	ACC	2	6	6331953	6331958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	506934138
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156482	NC_021252	GCTTC	2	10	6332107	6332116	0 %	40 %	20 %	40 %	506934138
156483	NC_021252	TGT	2	6	6332146	6332151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	506934138
156484	NC_021252	CG	4	8	6332164	6332171	0 %	0 %	50 %	50 %	506934138
156485	NC_021252	GCC	2	6	6332177	6332182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	506934138
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156488	NC_021252	CGA	2	6	6332257	6332262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	506934138
156489	NC_021252	GAA	2	6	6332351	6332356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	506934138
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156494	NC_021252	AGT	2	6	6332512	6332517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	506934138
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156499	NC_021252	GCG	2	6	6332593	6332598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	506934138
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