MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii D1279779 plasmid pD1279779

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020525	ATTA	2	8	177	184	50 %	50 %	0 %	0 %	469820174
2	NC_020525	TTC	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469820174
3	NC_020525	ATCA	2	8	307	314	50 %	25 %	0 %	25 %	469820174
4	NC_020525	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
5	NC_020525	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820174
6	NC_020525	GTGA	2	8	442	449	25 %	25 %	50 %	0 %	469820174
7	NC_020525	GTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820174
8	NC_020525	AGA	2	6	525	530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820174
9	NC_020525	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820174
10	NC_020525	ATTG	2	8	603	610	25 %	50 %	25 %	0 %	469820174
11	NC_020525	GTA	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
12	NC_020525	A	6	6	662	667	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
13	NC_020525	A	6	6	709	714	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
14	NC_020525	A	8	8	827	834	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
15	NC_020525	A	6	6	1139	1144	100 %	0 %	0 %	0 %	469820175
16	NC_020525	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	469820175
17	NC_020525	AAAG	2	8	1285	1292	75 %	0 %	25 %	0 %	469820175
18	NC_020525	TCAA	2	8	1302	1309	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
19	NC_020525	TCAA	2	8	1312	1319	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
20	NC_020525	ATCA	2	8	1410	1417	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
21	NC_020525	AGATC	2	10	1441	1450	40 %	20 %	20 %	20 %	469820175
22	NC_020525	TGA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820175
23	NC_020525	ACT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820175
24	NC_020525	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	469820175
25	NC_020525	ATC	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820176
26	NC_020525	T	6	6	2039	2044	0 %	100 %	0 %	0 %	469820176
27	NC_020525	A	7	7	2045	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
28	NC_020525	TGC	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820176
29	NC_020525	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
30	NC_020525	CTCG	2	8	2089	2096	0 %	25 %	25 %	50 %	469820176
31	NC_020525	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	469820176
32	NC_020525	ATTG	2	8	2147	2154	25 %	50 %	25 %	0 %	469820176
33	NC_020525	CAGT	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	469820176
34	NC_020525	ACTT	2	8	2186	2193	25 %	50 %	0 %	25 %	469820176
35	NC_020525	AG	3	6	2211	2216	50 %	0 %	50 %	0 %	469820176
36	NC_020525	CAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820176
37	NC_020525	A	6	6	2226	2231	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
38	NC_020525	A	7	7	2255	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
39	NC_020525	AACTT	2	10	2263	2272	40 %	40 %	0 %	20 %	469820176
40	NC_020525	T	6	6	2271	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	469820176
41	NC_020525	CAAA	2	8	2293	2300	75 %	0 %	0 %	25 %	469820176
42	NC_020525	AATG	2	8	2894	2901	50 %	25 %	25 %	0 %	469820177
43	NC_020525	GTT	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820177
44	NC_020525	ACA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820177
45	NC_020525	GTC	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820177
46	NC_020525	TAG	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820177
47	NC_020525	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	469820177
48	NC_020525	TAA	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820177
49	NC_020525	TC	3	6	3187	3192	0 %	50 %	0 %	50 %	469820177
50	NC_020525	ATT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820178
51	NC_020525	AG	3	6	3254	3259	50 %	0 %	50 %	0 %	469820178
52	NC_020525	A	6	6	3274	3279	100 %	0 %	0 %	0 %	469820178
53	NC_020525	TGA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820178
54	NC_020525	AGAA	2	8	3343	3350	75 %	0 %	25 %	0 %	469820178
55	NC_020525	TAA	3	9	3513	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820178
56	NC_020525	T	6	6	3914	3919	0 %	100 %	0 %	0 %	469820179
57	NC_020525	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820179
58	NC_020525	AGC	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820179
59	NC_020525	GAT	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820179
60	NC_020525	TA	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	469820179
61	NC_020525	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820179
62	NC_020525	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820179
63	NC_020525	AATT	2	8	4405	4412	50 %	50 %	0 %	0 %	469820179
64	NC_020525	A	6	6	4474	4479	100 %	0 %	0 %	0 %	469820180
65	NC_020525	AATG	2	8	4485	4492	50 %	25 %	25 %	0 %	469820180
66	NC_020525	AG	3	6	4519	4524	50 %	0 %	50 %	0 %	469820180
67	NC_020525	CCTTT	2	10	4537	4546	0 %	60 %	0 %	40 %	469820180
68	NC_020525	TAA	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820180
69	NC_020525	ATT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820180
70	NC_020525	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820180
71	NC_020525	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
72	NC_020525	TTG	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
73	NC_020525	T	6	6	5262	5267	0 %	100 %	0 %	0 %	469820181
74	NC_020525	CATT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	0 %	25 %	469820181
75	NC_020525	AGA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
76	NC_020525	AT	3	6	5393	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	469820181
77	NC_020525	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
78	NC_020525	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
79	NC_020525	GCA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820181
80	NC_020525	AG	3	6	5496	5501	50 %	0 %	50 %	0 %	469820181
81	NC_020525	AGA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
82	NC_020525	A	7	7	5625	5631	100 %	0 %	0 %	0 %	469820181
83	NC_020525	AGA	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
84	NC_020525	A	6	6	5714	5719	100 %	0 %	0 %	0 %	469820181
85	NC_020525	ATA	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
86	NC_020525	GGT	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820181
87	NC_020525	TGTC	2	8	5855	5862	0 %	50 %	25 %	25 %	469820181
88	NC_020525	TAA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
89	NC_020525	GTGGC	2	10	5918	5927	0 %	20 %	60 %	20 %	469820181

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.