MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anabaena cylindrica PCC 7122 plasmid pANACY.05

Total Repeats: 408

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020056	AAG	2	6	396	401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
2	NC_020056	TCC	2	6	451	456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843264
3	NC_020056	T	6	6	556	561	0 %	100 %	0 %	0 %	436843264
4	NC_020056	A	6	6	609	614	100 %	0 %	0 %	0 %	436843264
5	NC_020056	TCG	2	6	646	651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
6	NC_020056	ATT	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
7	NC_020056	ACTC	2	8	719	726	25 %	25 %	0 %	50 %	436843264
8	NC_020056	AAG	2	6	735	740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
9	NC_020056	AGA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
10	NC_020056	ACT	2	6	803	808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843264
11	NC_020056	A	6	6	890	895	100 %	0 %	0 %	0 %	436843264
12	NC_020056	TAGA	2	8	921	928	50 %	25 %	25 %	0 %	436843264
13	NC_020056	TTA	2	6	971	976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
14	NC_020056	ATT	2	6	1098	1103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
15	NC_020056	TCAAGC	2	12	1111	1122	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436843264
16	NC_020056	GTC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
17	NC_020056	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
18	NC_020056	CAGGCT	2	12	1220	1231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436843264
19	NC_020056	ATT	2	6	1247	1252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
20	NC_020056	AAC	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843264
21	NC_020056	AT	3	6	1355	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	436843264
22	NC_020056	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	436843264
23	NC_020056	AAG	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
24	NC_020056	A	6	6	1384	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	436843264
25	NC_020056	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
26	NC_020056	CGA	2	6	1774	1779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
27	NC_020056	ATT	2	6	1809	1814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843264
28	NC_020056	TAGA	2	8	1815	1822	50 %	25 %	25 %	0 %	436843264
29	NC_020056	GA	3	6	1870	1875	50 %	0 %	50 %	0 %	436843264
30	NC_020056	AGA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843264
31	NC_020056	TAAC	2	8	1923	1930	50 %	25 %	0 %	25 %	436843264
32	NC_020056	ATCAC	2	10	1979	1988	40 %	20 %	0 %	40 %	436843264
33	NC_020056	ATTT	2	8	2037	2044	25 %	75 %	0 %	0 %	436843264
34	NC_020056	A	6	6	2068	2073	100 %	0 %	0 %	0 %	436843264
35	NC_020056	TGC	2	6	2104	2109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843264
36	NC_020056	CAG	2	6	2136	2141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
37	NC_020056	CAG	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843264
38	NC_020056	ACA	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
39	NC_020056	CAAC	2	8	2376	2383	50 %	0 %	0 %	50 %	436843265
40	NC_020056	TTCCA	2	10	2384	2393	20 %	40 %	0 %	40 %	436843265
41	NC_020056	GTT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
42	NC_020056	CTC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843265
43	NC_020056	ACA	3	9	2475	2483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
44	NC_020056	CTTC	2	8	2514	2521	0 %	50 %	0 %	50 %	436843265
45	NC_020056	AGT	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843265
46	NC_020056	GTC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
47	NC_020056	AAC	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843265
48	NC_020056	TCA	3	9	2628	2636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
49	NC_020056	TCT	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
50	NC_020056	TTG	2	6	2706	2711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
51	NC_020056	AGA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843265
52	NC_020056	AGCAGA	2	12	2755	2766	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	436843265
53	NC_020056	A	7	7	2803	2809	100 %	0 %	0 %	0 %	436843265
54	NC_020056	GGTT	2	8	2823	2830	0 %	50 %	50 %	0 %	436843265
55	NC_020056	TTGT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	436843265
56	NC_020056	TTG	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
57	NC_020056	TGC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
58	NC_020056	ATTA	2	8	2920	2927	50 %	50 %	0 %	0 %	436843265
59	NC_020056	ACT	2	6	2935	2940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
60	NC_020056	TGT	2	6	2942	2947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
61	NC_020056	TTG	2	6	2955	2960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
62	NC_020056	CTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
63	NC_020056	GT	3	6	3084	3089	0 %	50 %	50 %	0 %	436843265
64	NC_020056	TTG	2	6	3112	3117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
65	NC_020056	GTG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843265
66	NC_020056	CTGG	2	8	3189	3196	0 %	25 %	50 %	25 %	436843265
67	NC_020056	AC	3	6	3203	3208	50 %	0 %	0 %	50 %	436843265
68	NC_020056	CTG	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
69	NC_020056	GCT	2	6	3291	3296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
70	NC_020056	ATA	2	6	3305	3310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843265
71	NC_020056	CTA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
72	NC_020056	TGT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
73	NC_020056	GTTTT	2	10	3454	3463	0 %	80 %	20 %	0 %	436843265
74	NC_020056	AGT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843265
75	NC_020056	TGT	2	6	3512	3517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
76	NC_020056	TTG	2	6	3628	3633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
77	NC_020056	CTA	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
78	NC_020056	TGC	3	9	3692	3700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
79	NC_020056	ACT	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843265
80	NC_020056	TGGT	2	8	3737	3744	0 %	50 %	50 %	0 %	436843265
81	NC_020056	TAA	2	6	3771	3776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843265
82	NC_020056	GCTTG	2	10	3849	3858	0 %	40 %	40 %	20 %	436843265
83	NC_020056	GCA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843265
84	NC_020056	GTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843265
85	NC_020056	AGGC	2	8	3988	3995	25 %	0 %	50 %	25 %	436843265
86	NC_020056	T	6	6	4030	4035	0 %	100 %	0 %	0 %	436843265
87	NC_020056	AT	3	6	4045	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	436843265
88	NC_020056	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843265
89	NC_020056	CCA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843265
90	NC_020056	TCT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843265
91	NC_020056	TGTCTA	2	12	4278	4289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	436843265
92	NC_020056	GGT	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436843265
93	NC_020056	ATGA	2	8	4435	4442	50 %	25 %	25 %	0 %	436843265
94	NC_020056	CTG	2	6	4491	4496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843265
95	NC_020056	T	6	6	4522	4527	0 %	100 %	0 %	0 %	436843265
96	NC_020056	GTT	2	6	4925	4930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843266
97	NC_020056	ATTTT	2	10	5093	5102	20 %	80 %	0 %	0 %	436843266
98	NC_020056	TTA	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843266
99	NC_020056	GTT	2	6	5470	5475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843267
100	NC_020056	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	436843267
101	NC_020056	TCT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843267
102	NC_020056	GTT	2	6	5590	5595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843267
103	NC_020056	AT	3	6	5654	5659	50 %	50 %	0 %	0 %	436843267
104	NC_020056	GAT	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843267
105	NC_020056	TCC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843268
106	NC_020056	GTA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843268
107	NC_020056	A	6	6	5916	5921	100 %	0 %	0 %	0 %	436843268
108	NC_020056	TCT	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843268
109	NC_020056	TCC	2	6	6121	6126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843268
110	NC_020056	AAC	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843268
111	NC_020056	TC	3	6	6163	6168	0 %	50 %	0 %	50 %	436843268
112	NC_020056	ATC	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843269
113	NC_020056	CCT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436843269
114	NC_020056	AGG	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843269
115	NC_020056	CTGG	2	8	6551	6558	0 %	25 %	50 %	25 %	436843269
116	NC_020056	CT	3	6	6570	6575	0 %	50 %	0 %	50 %	436843269
117	NC_020056	TGA	2	6	6591	6596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843269
118	NC_020056	TGC	2	6	6603	6608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843269
119	NC_020056	GCCAG	2	10	6652	6661	20 %	0 %	40 %	40 %	436843269
120	NC_020056	AAG	2	6	6665	6670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843269
121	NC_020056	TTA	2	6	6800	6805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843269
122	NC_020056	TTCC	2	8	6812	6819	0 %	50 %	0 %	50 %	436843269
123	NC_020056	CGG	2	6	6826	6831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843269
124	NC_020056	GAA	2	6	6838	6843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843269
125	NC_020056	CAA	2	6	6988	6993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843269
126	NC_020056	AGG	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843269
127	NC_020056	TGA	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843269
128	NC_020056	GAACCA	2	12	7056	7067	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	436843270
129	NC_020056	AGA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436843270
130	NC_020056	GGC	2	6	7152	7157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843270
131	NC_020056	AC	4	8	7221	7228	50 %	0 %	0 %	50 %	436843270
132	NC_020056	GCT	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843270
133	NC_020056	GGA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436843270
134	NC_020056	CTG	2	6	7302	7307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843270
135	NC_020056	AAT	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843271
136	NC_020056	TCG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843271
137	NC_020056	CAA	2	6	8358	8363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843271
138	NC_020056	TTTG	2	8	8372	8379	0 %	75 %	25 %	0 %	436843271
139	NC_020056	CTGGA	2	10	8448	8457	20 %	20 %	40 %	20 %	436843271
140	NC_020056	ACC	2	6	8637	8642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843272
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142	NC_020056	GGTC	2	8	8915	8922	0 %	25 %	50 %	25 %	436843272
143	NC_020056	TG	3	6	8965	8970	0 %	50 %	50 %	0 %	436843272
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149	NC_020056	GCT	2	6	9193	9198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843273
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157	NC_020056	GCA	2	6	10029	10034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436843275
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159	NC_020056	GCG	2	6	10097	10102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843275
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161	NC_020056	TGGA	2	8	10210	10217	25 %	25 %	50 %	0 %	436843275
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166	NC_020056	CGG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436843275
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174	NC_020056	GATT	2	8	10742	10749	25 %	50 %	25 %	0 %	436843275
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263	NC_020056	T	6	6	14400	14405	0 %	100 %	0 %	0 %	436843279
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265	NC_020056	CTG	2	6	14441	14446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843279
266	NC_020056	TTCT	2	8	14535	14542	0 %	75 %	0 %	25 %	436843279
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269	NC_020056	CT	3	6	14601	14606	0 %	50 %	0 %	50 %	436843279
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392	NC_020056	AG	3	6	19754	19759	50 %	0 %	50 %	0 %	436843280
393	NC_020056	TAA	2	6	19776	19781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843280
394	NC_020056	TAG	2	6	19839	19844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436843280
395	NC_020056	CTG	2	6	19861	19866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436843280
396	NC_020056	T	6	6	19888	19893	0 %	100 %	0 %	0 %	436843280
397	NC_020056	TTC	2	6	19920	19925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436843280
398	NC_020056	TCA	2	6	19961	19966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
399	NC_020056	ACA	2	6	19999	20004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436843280
400	NC_020056	CCA	2	6	20015	20020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436843280
401	NC_020056	ATC	2	6	20038	20043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843280
402	NC_020056	TAA	2	6	20128	20133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436843280
403	NC_020056	TGT	2	6	20145	20150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436843280
404	NC_020056	ATT	2	6	20165	20170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436843280
405	NC_020056	TCAGCT	2	12	20412	20423	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436843281
406	NC_020056	TCA	2	6	20484	20489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436843281
407	NC_020056	AT	3	6	20492	20497	50 %	50 %	0 %	0 %	436843281
408	NC_020056	T	7	7	20578	20584	0 %	100 %	0 %	0 %	436843281

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.