MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 42332

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018690	TAA	2	6	235582	235587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691814
4002	NC_018690	AAT	2	6	235692	235697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691815
4003	NC_018690	T	6	6	235697	235702	0 %	100 %	0 %	0 %	407691815
4004	NC_018690	TCT	2	6	235717	235722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691815
4005	NC_018690	TG	3	6	235778	235783	0 %	50 %	50 %	0 %	407691815
4006	NC_018690	ATC	4	12	235866	235877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691815
4007	NC_018690	ACA	3	9	235891	235899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691815
4008	NC_018690	TTTA	2	8	235917	235924	25 %	75 %	0 %	0 %	407691815
4009	NC_018690	TGG	2	6	235984	235989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691815
4010	NC_018690	TCA	2	6	235993	235998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691815
4011	NC_018690	CGA	2	6	236051	236056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691815
4012	NC_018690	CCA	2	6	236167	236172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691815
4013	NC_018690	CGC	3	9	236183	236191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691815
4014	NC_018690	CTT	2	6	236225	236230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691815
4015	NC_018690	TCA	2	6	236231	236236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691815
4016	NC_018690	AT	3	6	236398	236403	50 %	50 %	0 %	0 %	407691815
4017	NC_018690	TTG	2	6	236568	236573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4018	NC_018690	TAA	2	6	236661	236666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691816
4019	NC_018690	TACGTT	2	12	236682	236693	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	407691816
4020	NC_018690	GTG	2	6	236724	236729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691816
4021	NC_018690	ATG	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691816
4022	NC_018690	ACG	2	6	236937	236942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4023	NC_018690	ACTG	2	8	237001	237008	25 %	25 %	25 %	25 %	407691816
4024	NC_018690	TG	3	6	237035	237040	0 %	50 %	50 %	0 %	407691816
4025	NC_018690	TTC	2	6	237049	237054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691816
4026	NC_018690	GTT	2	6	237102	237107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4027	NC_018690	CTA	2	6	237161	237166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691816
4028	NC_018690	ATCTTT	2	12	237174	237185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407691816
4029	NC_018690	CAC	2	6	237191	237196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691816
4030	NC_018690	CCG	2	6	237239	237244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691816
4031	NC_018690	TGC	2	6	237312	237317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4032	NC_018690	GAT	2	6	237348	237353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691816
4033	NC_018690	TCG	2	6	237418	237423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4034	NC_018690	TCA	2	6	237484	237489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691816
4035	NC_018690	ACC	2	6	237492	237497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691816
4036	NC_018690	ATTG	2	8	237498	237505	25 %	50 %	25 %	0 %	407691816
4037	NC_018690	GAA	2	6	237543	237548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691816
4038	NC_018690	CAA	2	6	237563	237568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407691816
4039	NC_018690	TGA	2	6	237651	237656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691816
4040	NC_018690	AAT	2	6	237859	237864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691816
4041	NC_018690	CTT	3	9	237938	237946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691816
4042	NC_018690	GCA	2	6	238045	238050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4043	NC_018690	AAGT	2	8	238060	238067	50 %	25 %	25 %	0 %	407691816
4044	NC_018690	CTT	2	6	238079	238084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691816
4045	NC_018690	ATG	2	6	238121	238126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691816
4046	NC_018690	TTTG	2	8	238133	238140	0 %	75 %	25 %	0 %	407691816
4047	NC_018690	GTT	2	6	238160	238165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4048	NC_018690	TTC	2	6	238173	238178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691816
4049	NC_018690	TTG	2	6	238190	238195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4050	NC_018690	ACG	2	6	238290	238295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4051	NC_018690	ATA	2	6	238306	238311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691816
4052	NC_018690	T	6	6	238433	238438	0 %	100 %	0 %	0 %	407691816
4053	NC_018690	ACG	2	6	238458	238463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4054	NC_018690	ACC	2	6	238497	238502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691816
4055	NC_018690	TTG	2	6	238598	238603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4056	NC_018690	CAAT	2	8	238615	238622	50 %	25 %	0 %	25 %	407691816
4057	NC_018690	T	6	6	238658	238663	0 %	100 %	0 %	0 %	407691816
4058	NC_018690	CTT	2	6	238670	238675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691816
4059	NC_018690	AAGA	2	8	238711	238718	75 %	0 %	25 %	0 %	407691816
4060	NC_018690	TCG	2	6	238720	238725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691816
4061	NC_018690	T	7	7	238744	238750	0 %	100 %	0 %	0 %	407691816
4062	NC_018690	ACGT	2	8	238761	238768	25 %	25 %	25 %	25 %	407691816
4063	NC_018690	CCA	2	6	238789	238794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691816
4064	NC_018690	TTG	2	6	238815	238820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691816
4065	NC_018690	AGTT	2	8	238827	238834	25 %	50 %	25 %	0 %	407691816
4066	NC_018690	TTA	2	6	238931	238936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691817
4067	NC_018690	GAA	2	6	238976	238981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407691817
4068	NC_018690	ATC	2	6	239115	239120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691817
4069	NC_018690	TGA	2	6	239168	239173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691817
4070	NC_018690	AAT	2	6	239178	239183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691817
4071	NC_018690	CATAAT	2	12	239192	239203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	407691817
4072	NC_018690	CCAT	2	8	239239	239246	25 %	25 %	0 %	50 %	407691817
4073	NC_018690	TCCA	2	8	239295	239302	25 %	25 %	0 %	50 %	407691817
4074	NC_018690	ATG	2	6	239306	239311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691817
4075	NC_018690	TGT	2	6	239319	239324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691817
4076	NC_018690	GCC	2	6	239361	239366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691817
4077	NC_018690	TGA	2	6	239504	239509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691817
4078	NC_018690	AAT	2	6	239514	239519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407691817
4079	NC_018690	TAC	2	6	239531	239536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407691817
4080	NC_018690	CGA	2	6	239572	239577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691817
4081	NC_018690	TGT	2	6	239618	239623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691817
4082	NC_018690	AAGC	2	8	239638	239645	50 %	0 %	25 %	25 %	407691817
4083	NC_018690	ACC	2	6	239654	239659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691817
4084	NC_018690	AATT	2	8	240072	240079	50 %	50 %	0 %	0 %	407691818
4085	NC_018690	A	6	6	240097	240102	100 %	0 %	0 %	0 %	407691818
4086	NC_018690	T	6	6	240123	240128	0 %	100 %	0 %	0 %	407691818
4087	NC_018690	ATG	2	6	240137	240142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691818
4088	NC_018690	ATT	2	6	240205	240210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691818
4089	NC_018690	CTT	2	6	240290	240295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407691818
4090	NC_018690	TTA	2	6	240378	240383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691818
4091	NC_018690	TATT	2	8	240404	240411	25 %	75 %	0 %	0 %	407691818
4092	NC_018690	GTG	2	6	240540	240545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691819
4093	NC_018690	ATAA	2	8	240554	240561	75 %	25 %	0 %	0 %	407691819
4094	NC_018690	TGC	2	6	240592	240597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407691819
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4100	NC_018690	ACC	2	6	240950	240955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691819
4101	NC_018690	TTG	2	6	241023	241028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691819
4102	NC_018690	TGCT	2	8	241093	241100	0 %	50 %	25 %	25 %	407691819
4103	NC_018690	GTT	2	6	241152	241157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691819
4104	NC_018690	ATAA	2	8	241202	241209	75 %	25 %	0 %	0 %	407691819
4105	NC_018690	AGTT	2	8	241338	241345	25 %	50 %	25 %	0 %	407691819
4106	NC_018690	ATAG	2	8	241373	241380	50 %	25 %	25 %	0 %	407691819
4107	NC_018690	GAT	2	6	241536	241541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691820
4108	NC_018690	TTG	2	6	241558	241563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691820
4109	NC_018690	GGT	2	6	241615	241620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691820
4110	NC_018690	T	6	6	241657	241662	0 %	100 %	0 %	0 %	407691820
4111	NC_018690	TAAA	2	8	241886	241893	75 %	25 %	0 %	0 %	407691820
4112	NC_018690	CGC	2	6	241917	241922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407691820
4113	NC_018690	GT	3	6	241925	241930	0 %	50 %	50 %	0 %	407691820
4114	NC_018690	TTACC	2	10	241959	241968	20 %	40 %	0 %	40 %	407691820
4115	NC_018690	T	6	6	241982	241987	0 %	100 %	0 %	0 %	407691820
4116	NC_018690	ATAA	2	8	241999	242006	75 %	25 %	0 %	0 %	407691820
4117	NC_018690	CGG	2	6	242100	242105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407691820
4118	NC_018690	GAT	2	6	242230	242235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691820
4119	NC_018690	TGA	2	6	242258	242263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407691820
4120	NC_018690	ACC	2	6	242422	242427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407691820
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4122	NC_018690	GTT	2	6	242714	242719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407691821
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4241	NC_018690	ACCG	2	8	248634	248641	25 %	0 %	25 %	50 %	407691826
4242	NC_018690	A	7	7	248675	248681	100 %	0 %	0 %	0 %	407691826
4243	NC_018690	A	8	8	248726	248733	100 %	0 %	0 %	0 %	407691826
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4492	NC_018690	AGC	2	6	260590	260595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407691836
4493	NC_018690	TTA	2	6	260668	260673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407691836
4494	NC_018690	TTTA	2	8	260768	260775	25 %	75 %	0 %	0 %	407691836
4495	NC_018690	GTG	2	6	260881	260886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407691837
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