MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 34479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018644	TTAAA	2	10	1	10	60 %	40 %	0 %	0 %	406707030
2	NC_018644	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	406707030
3	NC_018644	A	6	6	28	33	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
4	NC_018644	GAAA	2	8	43	50	75 %	0 %	25 %	0 %	406707030
5	NC_018644	ATTT	2	8	72	79	25 %	75 %	0 %	0 %	406707030
6	NC_018644	T	6	6	99	104	0 %	100 %	0 %	0 %	406707030
7	NC_018644	ATA	2	6	208	213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707030
8	NC_018644	AAT	2	6	293	298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707030
9	NC_018644	T	6	6	309	314	0 %	100 %	0 %	0 %	406707030
10	NC_018644	GA	3	6	321	326	50 %	0 %	50 %	0 %	406707030
11	NC_018644	AGA	2	6	331	336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707030
12	NC_018644	CAAAT	2	10	338	347	60 %	20 %	0 %	20 %	406707030
13	NC_018644	TAG	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707030
14	NC_018644	CGA	2	6	382	387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707030
15	NC_018644	A	7	7	409	415	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
16	NC_018644	A	6	6	424	429	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
17	NC_018644	ATC	2	6	448	453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707030
18	NC_018644	AAT	2	6	471	476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707030
19	NC_018644	ATT	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707030
20	NC_018644	TG	3	6	561	566	0 %	50 %	50 %	0 %	406707030
21	NC_018644	A	6	6	572	577	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
22	NC_018644	AAAT	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	406707030
23	NC_018644	A	6	6	592	597	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
24	NC_018644	T	8	8	738	745	0 %	100 %	0 %	0 %	406707030
25	NC_018644	ATC	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707030
26	NC_018644	AG	3	6	782	787	50 %	0 %	50 %	0 %	406707030
27	NC_018644	T	7	7	828	834	0 %	100 %	0 %	0 %	406707030
28	NC_018644	TAT	2	6	885	890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707030
29	NC_018644	ATTAA	2	10	899	908	60 %	40 %	0 %	0 %	406707030
30	NC_018644	A	7	7	934	940	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
31	NC_018644	GAT	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707030
32	NC_018644	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
33	NC_018644	AACT	2	8	1011	1018	50 %	25 %	0 %	25 %	406707030
34	NC_018644	TCA	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707030
35	NC_018644	CAG	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707030
36	NC_018644	TAA	3	9	1096	1104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707030
37	NC_018644	CAAG	2	8	1134	1141	50 %	0 %	25 %	25 %	406707030
38	NC_018644	A	6	6	1178	1183	100 %	0 %	0 %	0 %	406707030
39	NC_018644	ATT	2	6	1213	1218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707030
40	NC_018644	TTC	2	6	1297	1302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707030
41	NC_018644	AATT	2	8	1384	1391	50 %	50 %	0 %	0 %	406707031
42	NC_018644	GT	3	6	1416	1421	0 %	50 %	50 %	0 %	406707031
43	NC_018644	AAT	2	6	1423	1428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
44	NC_018644	ATG	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707031
45	NC_018644	ATT	2	6	1564	1569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707031
46	NC_018644	ATCA	2	8	1600	1607	50 %	25 %	0 %	25 %	406707031
47	NC_018644	TTTTAA	2	12	1672	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707031
48	NC_018644	AATAA	2	10	1723	1732	80 %	20 %	0 %	0 %	406707031
49	NC_018644	T	6	6	1753	1758	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
50	NC_018644	AAT	2	6	1762	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
51	NC_018644	TAA	2	6	1791	1796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
52	NC_018644	TGT	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707031
53	NC_018644	TTC	2	6	1875	1880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707031
54	NC_018644	TTG	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707031
55	NC_018644	CTT	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707031
56	NC_018644	CT	3	6	1987	1992	0 %	50 %	0 %	50 %	406707031
57	NC_018644	CT	3	6	2003	2008	0 %	50 %	0 %	50 %	406707031
58	NC_018644	TAA	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
59	NC_018644	T	8	8	2043	2050	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
60	NC_018644	ATAAAA	2	12	2099	2110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	406707031
61	NC_018644	TTTG	2	8	2115	2122	0 %	75 %	25 %	0 %	406707031
62	NC_018644	T	7	7	2133	2139	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
63	NC_018644	TACT	2	8	2166	2173	25 %	50 %	0 %	25 %	406707031
64	NC_018644	ATA	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
65	NC_018644	CCA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707031
66	NC_018644	CAA	2	6	2295	2300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707031
67	NC_018644	TTTG	2	8	2318	2325	0 %	75 %	25 %	0 %	406707031
68	NC_018644	TTTC	2	8	2358	2365	0 %	75 %	0 %	25 %	406707031
69	NC_018644	T	7	7	2417	2423	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
70	NC_018644	T	9	9	2439	2447	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
71	NC_018644	ATG	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707031
72	NC_018644	AG	3	6	2524	2529	50 %	0 %	50 %	0 %	406707031
73	NC_018644	TGA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707031
74	NC_018644	GATA	2	8	2575	2582	50 %	25 %	25 %	0 %	406707031
75	NC_018644	ATA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707031
76	NC_018644	TAC	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707031
77	NC_018644	T	6	6	2930	2935	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
78	NC_018644	T	8	8	2938	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
79	NC_018644	T	9	9	2985	2993	0 %	100 %	0 %	0 %	406707031
80	NC_018644	CAA	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707031
81	NC_018644	CA	3	6	3102	3107	50 %	0 %	0 %	50 %	406707031
82	NC_018644	T	6	6	3111	3116	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
83	NC_018644	T	7	7	3130	3136	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
84	NC_018644	T	6	6	3175	3180	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
85	NC_018644	CTG	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707032
86	NC_018644	AAT	2	6	3234	3239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707032
87	NC_018644	TGAT	2	8	3279	3286	25 %	50 %	25 %	0 %	406707032
88	NC_018644	CAT	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707032
89	NC_018644	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
90	NC_018644	AGAT	2	8	3369	3376	50 %	25 %	25 %	0 %	406707032
91	NC_018644	T	6	6	3408	3413	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
92	NC_018644	T	6	6	3496	3501	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
93	NC_018644	T	6	6	3567	3572	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
94	NC_018644	AAC	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707032
95	NC_018644	AAT	2	6	3591	3596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707032
96	NC_018644	TTA	2	6	3668	3673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
97	NC_018644	ATT	2	6	3729	3734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
98	NC_018644	TAT	2	6	3755	3760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
99	NC_018644	T	7	7	3828	3834	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
100	NC_018644	T	9	9	3841	3849	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
101	NC_018644	T	7	7	3873	3879	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
102	NC_018644	TCA	2	6	3922	3927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707032
103	NC_018644	TCT	2	6	3943	3948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707032
104	NC_018644	TAA	2	6	3957	3962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707032
105	NC_018644	ATT	3	9	3963	3971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
106	NC_018644	A	6	6	4060	4065	100 %	0 %	0 %	0 %	406707032
107	NC_018644	TTA	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
108	NC_018644	ATA	2	6	4116	4121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707032
109	NC_018644	TTA	2	6	4132	4137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707032
110	NC_018644	AATA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	406707032
111	NC_018644	ATTT	2	8	4199	4206	25 %	75 %	0 %	0 %	406707032
112	NC_018644	ATA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707032
113	NC_018644	TGAT	2	8	4255	4262	25 %	50 %	25 %	0 %	406707032
114	NC_018644	ATTTTT	2	12	4263	4274	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	406707032
115	NC_018644	T	7	7	4270	4276	0 %	100 %	0 %	0 %	406707032
116	NC_018644	AATT	2	8	4299	4306	50 %	50 %	0 %	0 %	406707032
117	NC_018644	CTTTTA	2	12	4354	4365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	406707032
118	NC_018644	AGAA	2	8	4371	4378	75 %	0 %	25 %	0 %	406707032
119	NC_018644	A	9	9	4477	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
120	NC_018644	CT	3	6	4495	4500	0 %	50 %	0 %	50 %	406707033
121	NC_018644	AAT	2	6	4507	4512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707033
122	NC_018644	A	6	6	4603	4608	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
123	NC_018644	AG	3	6	4624	4629	50 %	0 %	50 %	0 %	406707033
124	NC_018644	AATT	2	8	4644	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	406707033
125	NC_018644	A	6	6	4679	4684	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
126	NC_018644	T	8	8	4685	4692	0 %	100 %	0 %	0 %	406707033
127	NC_018644	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
128	NC_018644	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707033
129	NC_018644	A	7	7	4849	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
130	NC_018644	CAAT	2	8	4908	4915	50 %	25 %	0 %	25 %	406707033
131	NC_018644	ATTT	2	8	4950	4957	25 %	75 %	0 %	0 %	406707033
132	NC_018644	ATT	2	6	5030	5035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707033
133	NC_018644	A	7	7	5150	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
134	NC_018644	A	7	7	5170	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
135	NC_018644	GCAA	2	8	5180	5187	50 %	0 %	25 %	25 %	406707033
136	NC_018644	A	7	7	5209	5215	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
137	NC_018644	A	6	6	5219	5224	100 %	0 %	0 %	0 %	406707033
138	NC_018644	TCATT	2	10	5281	5290	20 %	60 %	0 %	20 %	406707033
139	NC_018644	T	7	7	5289	5295	0 %	100 %	0 %	0 %	406707033
140	NC_018644	A	6	6	5416	5421	100 %	0 %	0 %	0 %	406707034
141	NC_018644	GA	3	6	5428	5433	50 %	0 %	50 %	0 %	406707034
142	NC_018644	AGA	2	6	5457	5462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707034
143	NC_018644	AGG	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707034
144	NC_018644	A	7	7	5596	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	406707034
145	NC_018644	AATAGA	2	12	5604	5615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	406707034
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173	NC_018644	A	6	6	6603	6608	100 %	0 %	0 %	0 %	406707034
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272	NC_018644	GTAT	2	8	10470	10477	25 %	50 %	25 %	0 %	406707038
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403	NC_018644	TAA	2	6	15727	15732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707043
404	NC_018644	AT	3	6	15772	15777	50 %	50 %	0 %	0 %	406707043
405	NC_018644	GA	3	6	15824	15829	50 %	0 %	50 %	0 %	406707043
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