MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_017167	GCA	2	6	2385047	2385052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136229
46003	NC_017167	TTC	2	6	2385104	2385109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136229
46004	NC_017167	CGC	2	6	2385130	2385135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136229
46005	NC_017167	CCG	2	6	2385142	2385147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136229
46006	NC_017167	CG	3	6	2385160	2385165	0 %	0 %	50 %	50 %	384136229
46007	NC_017167	CCGG	2	8	2385313	2385320	0 %	0 %	50 %	50 %	384136229
46008	NC_017167	CGG	2	6	2385324	2385329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136229
46009	NC_017167	AGCGC	2	10	2385330	2385339	20 %	0 %	40 %	40 %	384136229
46010	NC_017167	CCT	2	6	2385426	2385431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136230
46011	NC_017167	CGT	2	6	2385437	2385442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136230
46012	NC_017167	GTT	2	6	2385503	2385508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136230
46013	NC_017167	CGT	2	6	2385518	2385523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136230
46014	NC_017167	GCA	2	6	2385571	2385576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136230
46015	NC_017167	AGAT	2	8	2385639	2385646	50 %	25 %	25 %	0 %	384136230
46016	NC_017167	C	6	6	2385695	2385700	0 %	0 %	0 %	100 %	384136230
46017	NC_017167	CAG	2	6	2385716	2385721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136230
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46019	NC_017167	CGAAG	2	10	2385868	2385877	40 %	0 %	40 %	20 %	384136230
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46021	NC_017167	GTGC	2	8	2386038	2386045	0 %	25 %	50 %	25 %	384136230
46022	NC_017167	CGA	2	6	2386051	2386056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136230
46023	NC_017167	GTA	2	6	2386094	2386099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136230
46024	NC_017167	TTG	2	6	2386155	2386160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136230
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46027	NC_017167	ATC	2	6	2386326	2386331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136230
46028	NC_017167	CGC	2	6	2386502	2386507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136230
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46034	NC_017167	AGC	2	6	2386830	2386835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136230
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46039	NC_017167	CGA	2	6	2387083	2387088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136231
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46050	NC_017167	CGAG	2	8	2387479	2387486	25 %	0 %	50 %	25 %	384136231
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46054	NC_017167	TGA	2	6	2387629	2387634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136231
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46056	NC_017167	CGAG	2	8	2387656	2387663	25 %	0 %	50 %	25 %	384136231
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46102	NC_017167	TGG	2	6	2389456	2389461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136232
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46105	NC_017167	GAT	2	6	2389748	2389753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136233
46106	NC_017167	AGGATG	2	12	2389884	2389895	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384136233
46107	NC_017167	CG	5	10	2389913	2389922	0 %	0 %	50 %	50 %	384136233
46108	NC_017167	CCGCTG	2	12	2389931	2389942	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384136233
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46112	NC_017167	CGTC	2	8	2390053	2390060	0 %	25 %	25 %	50 %	384136233
46113	NC_017167	CGT	2	6	2390096	2390101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136233
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46348	NC_017167	AAC	2	6	2402004	2402009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136242
46349	NC_017167	ACG	2	6	2402046	2402051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136242
46350	NC_017167	CAT	2	6	2402107	2402112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136242
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46352	NC_017167	CTG	2	6	2402180	2402185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136242
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46355	NC_017167	GCGG	2	8	2402321	2402328	0 %	0 %	75 %	25 %	384136242
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46383	NC_017167	CG	3	6	2403402	2403407	0 %	0 %	50 %	50 %	384136243
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46454	NC_017167	AACA	2	8	2406092	2406099	75 %	0 %	0 %	25 %	384136245
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46458	NC_017167	ACC	2	6	2406174	2406179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136245
46459	NC_017167	CCTCGA	2	12	2406188	2406199	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384136246
46460	NC_017167	CGC	2	6	2406235	2406240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136246
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46462	NC_017167	GCA	2	6	2406365	2406370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136246
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