MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45502	NC_017167	GAC	2	6	2350894	2350899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136182
45503	NC_017167	GCTG	2	8	2350964	2350971	0 %	25 %	50 %	25 %	384136182
45504	NC_017167	ACCA	2	8	2350976	2350983	50 %	0 %	0 %	50 %	384136182
45505	NC_017167	TGCG	2	8	2351097	2351104	0 %	25 %	50 %	25 %	384136182
45506	NC_017167	ACCC	2	8	2351128	2351135	25 %	0 %	0 %	75 %	384136182
45507	NC_017167	TC	3	6	2351273	2351278	0 %	50 %	0 %	50 %	384136183
45508	NC_017167	CCAT	2	8	2351282	2351289	25 %	25 %	0 %	50 %	384136183
45509	NC_017167	A	6	6	2351341	2351346	100 %	0 %	0 %	0 %	384136183
45510	NC_017167	ACG	2	6	2351455	2351460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136183
45511	NC_017167	CTT	2	6	2351609	2351614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136183
45512	NC_017167	TTTTG	2	10	2351626	2351635	0 %	80 %	20 %	0 %	384136183
45513	NC_017167	GGA	2	6	2351740	2351745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136183
45514	NC_017167	CAT	2	6	2351786	2351791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136183
45515	NC_017167	AAT	2	6	2351818	2351823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384136183
45516	NC_017167	GAAA	2	8	2351958	2351965	75 %	0 %	25 %	0 %	384136183
45517	NC_017167	AAT	2	6	2351968	2351973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384136183
45518	NC_017167	CATT	2	8	2352040	2352047	25 %	50 %	0 %	25 %	384136183
45519	NC_017167	CAT	2	6	2352074	2352079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136183
45520	NC_017167	TGA	2	6	2352260	2352265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136183
45521	NC_017167	TTG	2	6	2352268	2352273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136183
45522	NC_017167	CAA	2	6	2352302	2352307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136183
45523	NC_017167	TGA	3	9	2352437	2352445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136183
45524	NC_017167	CAT	2	6	2354056	2354061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136184
45525	NC_017167	TGC	2	6	2354223	2354228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136184
45526	NC_017167	GCA	2	6	2354269	2354274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136184
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45529	NC_017167	GGGA	2	8	2354411	2354418	25 %	0 %	75 %	0 %	384136184
45530	NC_017167	CGA	2	6	2354497	2354502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136184
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45532	NC_017167	CG	3	6	2354654	2354659	0 %	0 %	50 %	50 %	384136185
45533	NC_017167	TC	3	6	2354798	2354803	0 %	50 %	0 %	50 %	384136186
45534	NC_017167	CA	3	6	2354845	2354850	50 %	0 %	0 %	50 %	384136186
45535	NC_017167	CATCT	2	10	2354861	2354870	20 %	40 %	0 %	40 %	384136186
45536	NC_017167	CG	3	6	2354902	2354907	0 %	0 %	50 %	50 %	384136186
45537	NC_017167	TGC	2	6	2354910	2354915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136186
45538	NC_017167	CTG	2	6	2354918	2354923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136186
45539	NC_017167	CGTC	3	12	2354942	2354953	0 %	25 %	25 %	50 %	384136186
45540	NC_017167	CGC	2	6	2354985	2354990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136186
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45542	NC_017167	GAT	2	6	2355014	2355019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136186
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45544	NC_017167	TCG	2	6	2355072	2355077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136186
45545	NC_017167	CCT	2	6	2355109	2355114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136186
45546	NC_017167	GCA	2	6	2355117	2355122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136186
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45550	NC_017167	GCA	2	6	2355462	2355467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136187
45551	NC_017167	CACC	2	8	2355529	2355536	25 %	0 %	0 %	75 %	384136187
45552	NC_017167	TCT	2	6	2355539	2355544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136187
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45555	NC_017167	GTTG	2	8	2355982	2355989	0 %	50 %	50 %	0 %	384136188
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45557	NC_017167	TTG	2	6	2356052	2356057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136188
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45600	NC_017167	CG	3	6	2358536	2358541	0 %	0 %	50 %	50 %	384136194
45601	NC_017167	TC	3	6	2358553	2358558	0 %	50 %	0 %	50 %	384136194
45602	NC_017167	GC	3	6	2358578	2358583	0 %	0 %	50 %	50 %	384136194
45603	NC_017167	GTTC	2	8	2358614	2358621	0 %	50 %	25 %	25 %	384136194
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