MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_017167	AAG	2	6	2311847	2311852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136133
45003	NC_017167	GAA	2	6	2311869	2311874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136133
45004	NC_017167	CAT	2	6	2311969	2311974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136133
45005	NC_017167	C	6	6	2311997	2312002	0 %	0 %	0 %	100 %	384136133
45006	NC_017167	TGC	2	6	2312009	2312014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136133
45007	NC_017167	AGAT	2	8	2312117	2312124	50 %	25 %	25 %	0 %	384136133
45008	NC_017167	ACAA	2	8	2312145	2312152	75 %	0 %	0 %	25 %	384136133
45009	NC_017167	ACG	2	6	2312200	2312205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136133
45010	NC_017167	TGA	2	6	2312233	2312238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136133
45011	NC_017167	CGA	2	6	2312244	2312249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136133
45012	NC_017167	ACG	2	6	2312251	2312256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136133
45013	NC_017167	CTT	2	6	2312739	2312744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136134
45014	NC_017167	GTT	2	6	2312798	2312803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136134
45015	NC_017167	AGA	2	6	2312818	2312823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136134
45016	NC_017167	CTC	2	6	2312865	2312870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136134
45017	NC_017167	AAC	2	6	2312872	2312877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136134
45018	NC_017167	TTC	2	6	2312907	2312912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136134
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45020	NC_017167	CATC	2	8	2313068	2313075	25 %	25 %	0 %	50 %	384136134
45021	NC_017167	GTT	2	6	2313255	2313260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136135
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45023	NC_017167	TCG	2	6	2313341	2313346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136135
45024	NC_017167	TTG	2	6	2313460	2313465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136135
45025	NC_017167	AGT	3	9	2313528	2313536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136135
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45027	NC_017167	CGA	2	6	2313850	2313855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136136
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45029	NC_017167	TGA	2	6	2313963	2313968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136136
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45031	NC_017167	GGC	2	6	2314068	2314073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136136
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45033	NC_017167	TGT	2	6	2314182	2314187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136136
45034	NC_017167	CCGC	2	8	2314198	2314205	0 %	0 %	25 %	75 %	384136136
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45047	NC_017167	CGT	2	6	2314948	2314953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136136
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45049	NC_017167	TGC	2	6	2315074	2315079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136136
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45051	NC_017167	TGGG	2	8	2315135	2315142	0 %	25 %	75 %	0 %	384136136
45052	NC_017167	CCT	2	6	2315182	2315187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136137
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45092	NC_017167	CCTT	2	8	2318048	2318055	0 %	50 %	0 %	50 %	384136142
45093	NC_017167	GTT	2	6	2318100	2318105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136142
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45103	NC_017167	CT	3	6	2318666	2318671	0 %	50 %	0 %	50 %	384136142
45104	NC_017167	TCT	2	6	2318741	2318746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136142
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45114	NC_017167	AT	3	6	2319878	2319883	50 %	50 %	0 %	0 %	384136145
45115	NC_017167	TA	3	6	2320015	2320020	50 %	50 %	0 %	0 %	384136145
45116	NC_017167	CCGA	2	8	2320062	2320069	25 %	0 %	25 %	50 %	384136145
45117	NC_017167	AAG	2	6	2320079	2320084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136145
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45220	NC_017167	GCTC	2	8	2330143	2330150	0 %	25 %	25 %	50 %	384136155
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45222	NC_017167	TCGC	2	8	2330251	2330258	0 %	25 %	25 %	50 %	384136156
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45465	NC_017167	TTCA	2	8	2348300	2348307	25 %	50 %	0 %	25 %	384136179
45466	NC_017167	CCTG	2	8	2348373	2348380	0 %	25 %	25 %	50 %	384136179
45467	NC_017167	TCC	2	6	2348387	2348392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136179
45468	NC_017167	TGG	2	6	2348446	2348451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136179
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45472	NC_017167	ACCAG	2	10	2348522	2348531	40 %	0 %	20 %	40 %	384136179
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45492	NC_017167	CGC	2	6	2350015	2350020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136180
45493	NC_017167	GCC	2	6	2350021	2350026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136180
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45497	NC_017167	CGT	2	6	2350309	2350314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136181
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45499	NC_017167	GCG	2	6	2350444	2350449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136181
45500	NC_017167	TCG	2	6	2350500	2350505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136181

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