MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_017167	GCG	2	6	2284036	2284041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136106
44503	NC_017167	GA	3	6	2284049	2284054	50 %	0 %	50 %	0 %	384136106
44504	NC_017167	CCAA	2	8	2284059	2284066	50 %	0 %	0 %	50 %	384136106
44505	NC_017167	GTG	2	6	2284093	2284098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136106
44506	NC_017167	TTGTCC	2	12	2284157	2284168	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384136106
44507	NC_017167	GCG	2	6	2284187	2284192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136106
44508	NC_017167	GCC	2	6	2284208	2284213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136106
44509	NC_017167	GT	3	6	2284226	2284231	0 %	50 %	50 %	0 %	384136106
44510	NC_017167	CCT	2	6	2284255	2284260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136106
44511	NC_017167	CTT	2	6	2284331	2284336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136107
44512	NC_017167	CGGT	2	8	2284398	2284405	0 %	25 %	50 %	25 %	384136107
44513	NC_017167	CAC	2	6	2284488	2284493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136107
44514	NC_017167	GA	3	6	2284585	2284590	50 %	0 %	50 %	0 %	384136107
44515	NC_017167	ACC	2	6	2284642	2284647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136107
44516	NC_017167	CGC	2	6	2284671	2284676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136107
44517	NC_017167	CCA	2	6	2284683	2284688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136107
44518	NC_017167	CAT	2	6	2284734	2284739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136107
44519	NC_017167	CGA	3	9	2284745	2284753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136107
44520	NC_017167	CGC	2	6	2284758	2284763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136107
44521	NC_017167	AGA	2	6	2284810	2284815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136107
44522	NC_017167	CAT	2	6	2284851	2284856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136107
44523	NC_017167	GTG	2	6	2284902	2284907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136108
44524	NC_017167	CCG	2	6	2284914	2284919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136108
44525	NC_017167	ACGGTG	2	12	2284971	2284982	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384136108
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44528	NC_017167	TGC	2	6	2285070	2285075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136108
44529	NC_017167	GTC	2	6	2285109	2285114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136108
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44531	NC_017167	GCG	2	6	2285196	2285201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136108
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44534	NC_017167	AG	3	6	2285311	2285316	50 %	0 %	50 %	0 %	384136108
44535	NC_017167	CCT	2	6	2285321	2285326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136109
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44538	NC_017167	GTAA	2	8	2285533	2285540	50 %	25 %	25 %	0 %	384136109
44539	NC_017167	CCG	2	6	2285583	2285588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136109
44540	NC_017167	CGC	2	6	2285608	2285613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136109
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44542	NC_017167	GCC	2	6	2285937	2285942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136110
44543	NC_017167	GGC	2	6	2286003	2286008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136110
44544	NC_017167	CGC	2	6	2286220	2286225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136111
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44546	NC_017167	TGC	2	6	2286239	2286244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136111
44547	NC_017167	ACA	3	9	2286255	2286263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136111
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44550	NC_017167	GAA	2	6	2286537	2286542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136112
44551	NC_017167	ATCCCC	2	12	2286562	2286573	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384136112
44552	NC_017167	CCG	2	6	2286602	2286607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136112
44553	NC_017167	CAT	2	6	2286669	2286674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136112
44554	NC_017167	GCG	2	6	2286683	2286688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136112
44555	NC_017167	CCG	2	6	2286818	2286823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136112
44556	NC_017167	GC	3	6	2286911	2286916	0 %	0 %	50 %	50 %	384136112
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44559	NC_017167	CAG	2	6	2286969	2286974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136112
44560	NC_017167	TA	3	6	2286989	2286994	50 %	50 %	0 %	0 %	384136112
44561	NC_017167	A	6	6	2287020	2287025	100 %	0 %	0 %	0 %	384136112
44562	NC_017167	CGC	2	6	2287032	2287037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136112
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44566	NC_017167	CTTG	2	8	2287193	2287200	0 %	50 %	25 %	25 %	384136112
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44574	NC_017167	CGCC	2	8	2287550	2287557	0 %	0 %	25 %	75 %	384136113
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44588	NC_017167	CCA	2	6	2288421	2288426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136114
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44601	NC_017167	TCA	2	6	2289203	2289208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136115
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44606	NC_017167	CGA	2	6	2289353	2289358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136115
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44614	NC_017167	GAT	2	6	2289773	2289778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136115
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