MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_017167	CG	3	6	2201465	2201470	0 %	0 %	50 %	50 %	384136010
43002	NC_017167	TCC	2	6	2201510	2201515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136010
43003	NC_017167	GCGGCT	2	12	2201535	2201546	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384136010
43004	NC_017167	TGGCC	2	10	2201568	2201577	0 %	20 %	40 %	40 %	384136010
43005	NC_017167	ACC	2	6	2201606	2201611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136010
43006	NC_017167	TCGCCA	2	12	2201661	2201672	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384136010
43007	NC_017167	CAG	2	6	2201685	2201690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136011
43008	NC_017167	CCT	2	6	2201717	2201722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136011
43009	NC_017167	GGC	2	6	2201723	2201728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136011
43010	NC_017167	CG	3	6	2201787	2201792	0 %	0 %	50 %	50 %	384136011
43011	NC_017167	CTC	2	6	2201841	2201846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136011
43012	NC_017167	GCC	2	6	2201884	2201889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136011
43013	NC_017167	CG	4	8	2201900	2201907	0 %	0 %	50 %	50 %	384136011
43014	NC_017167	CG	3	6	2201961	2201966	0 %	0 %	50 %	50 %	384136011
43015	NC_017167	GCC	2	6	2201991	2201996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136011
43016	NC_017167	AGG	2	6	2202016	2202021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136011
43017	NC_017167	CGT	2	6	2202039	2202044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136011
43018	NC_017167	AGC	2	6	2202085	2202090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136011
43019	NC_017167	AAG	2	6	2202120	2202125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136011
43020	NC_017167	GCGAA	2	10	2202139	2202148	40 %	0 %	40 %	20 %	384136011
43021	NC_017167	GCGTG	2	10	2202176	2202185	0 %	20 %	60 %	20 %	384136011
43022	NC_017167	CTTCGG	2	12	2202288	2202299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136011
43023	NC_017167	GC	3	6	2202363	2202368	0 %	0 %	50 %	50 %	384136011
43024	NC_017167	GAG	2	6	2202402	2202407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136011
43025	NC_017167	GCC	2	6	2202426	2202431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136011
43026	NC_017167	CTT	2	6	2202480	2202485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136011
43027	NC_017167	CGTCCG	2	12	2202512	2202523	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384136011
43028	NC_017167	TGA	2	6	2202617	2202622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136011
43029	NC_017167	CGA	2	6	2202626	2202631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136011
43030	NC_017167	CGC	2	6	2202738	2202743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136011
43031	NC_017167	ATCC	2	8	2202765	2202772	25 %	25 %	0 %	50 %	384136011
43032	NC_017167	GTA	2	6	2202912	2202917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136011
43033	NC_017167	ATGCG	2	10	2202956	2202965	20 %	20 %	40 %	20 %	384136011
43034	NC_017167	TC	3	6	2203236	2203241	0 %	50 %	0 %	50 %	384136012
43035	NC_017167	AGC	2	6	2203274	2203279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136012
43036	NC_017167	ACG	2	6	2203301	2203306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136012
43037	NC_017167	C	6	6	2203313	2203318	0 %	0 %	0 %	100 %	384136012
43038	NC_017167	GGT	2	6	2203345	2203350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136012
43039	NC_017167	CG	4	8	2203368	2203375	0 %	0 %	50 %	50 %	384136012
43040	NC_017167	ATC	2	6	2203376	2203381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136012
43041	NC_017167	TCGG	2	8	2203412	2203419	0 %	25 %	50 %	25 %	384136012
43042	NC_017167	AAG	2	6	2203469	2203474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136012
43043	NC_017167	GGC	2	6	2203561	2203566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136012
43044	NC_017167	GAG	2	6	2203630	2203635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136012
43045	NC_017167	CAT	2	6	2203636	2203641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136012
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43048	NC_017167	CGC	2	6	2203882	2203887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136012
43049	NC_017167	GAG	2	6	2203993	2203998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136012
43050	NC_017167	CCG	2	6	2204006	2204011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136012
43051	NC_017167	ACGCC	2	10	2204026	2204035	20 %	0 %	20 %	60 %	384136012
43052	NC_017167	GTG	2	6	2204050	2204055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136012
43053	NC_017167	ACG	2	6	2204084	2204089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136012
43054	NC_017167	GC	3	6	2204132	2204137	0 %	0 %	50 %	50 %	384136012
43055	NC_017167	CCA	2	6	2204208	2204213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136012
43056	NC_017167	ACC	2	6	2204267	2204272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136012
43057	NC_017167	CAT	2	6	2204326	2204331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136012
43058	NC_017167	CGG	2	6	2204334	2204339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136012
43059	NC_017167	ATC	2	6	2204342	2204347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136012
43060	NC_017167	CGT	2	6	2204425	2204430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136012
43061	NC_017167	CGAG	2	8	2204478	2204485	25 %	0 %	50 %	25 %	384136012
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43065	NC_017167	TCACG	2	10	2204550	2204559	20 %	20 %	20 %	40 %	384136012
43066	NC_017167	TCA	2	6	2204596	2204601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136013
43067	NC_017167	CTGA	2	8	2204652	2204659	25 %	25 %	25 %	25 %	384136013
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43071	NC_017167	TCA	2	6	2204853	2204858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136013
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43078	NC_017167	GCG	2	6	2205201	2205206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136013
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43085	NC_017167	TAC	2	6	2206012	2206017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136014
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43087	NC_017167	CG	3	6	2206031	2206036	0 %	0 %	50 %	50 %	384136014
43088	NC_017167	GCC	2	6	2206062	2206067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136014
43089	NC_017167	GTG	2	6	2206077	2206082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136014
43090	NC_017167	GGCC	2	8	2206113	2206120	0 %	0 %	50 %	50 %	384136014
43091	NC_017167	CATT	2	8	2206253	2206260	25 %	50 %	0 %	25 %	384136014
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43098	NC_017167	TCGA	2	8	2206742	2206749	25 %	25 %	25 %	25 %	384136015
43099	NC_017167	TC	3	6	2206765	2206770	0 %	50 %	0 %	50 %	384136015
43100	NC_017167	CGCC	2	8	2206786	2206793	0 %	0 %	25 %	75 %	384136015
43101	NC_017167	GC	3	6	2206875	2206880	0 %	0 %	50 %	50 %	384136015
43102	NC_017167	ACG	2	6	2206914	2206919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136015
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43104	NC_017167	ACG	2	6	2207011	2207016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136015
43105	NC_017167	GTG	2	6	2207067	2207072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136015
43106	NC_017167	ACG	2	6	2207073	2207078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136015
43107	NC_017167	GGA	2	6	2207164	2207169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136016
43108	NC_017167	CG	3	6	2207170	2207175	0 %	0 %	50 %	50 %	384136016
43109	NC_017167	GCG	2	6	2207195	2207200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136016
43110	NC_017167	CGA	2	6	2207250	2207255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136016
43111	NC_017167	GCTGC	2	10	2207275	2207284	0 %	20 %	40 %	40 %	384136016
43112	NC_017167	GAC	2	6	2207352	2207357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136016
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43115	NC_017167	TGA	2	6	2207426	2207431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136016
43116	NC_017167	GAT	2	6	2207454	2207459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136016
43117	NC_017167	GCC	2	6	2207866	2207871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136017
43118	NC_017167	GCC	2	6	2207909	2207914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136017
43119	NC_017167	CAA	2	6	2207949	2207954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136017
43120	NC_017167	GGA	2	6	2207997	2208002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136017
43121	NC_017167	CAT	2	6	2208012	2208017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136017
43122	NC_017167	CTG	2	6	2208028	2208033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136017
43123	NC_017167	ACGCG	2	10	2208044	2208053	20 %	0 %	40 %	40 %	384136017
43124	NC_017167	ATG	2	6	2208070	2208075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136017
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43128	NC_017167	TGC	2	6	2208362	2208367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136017
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43132	NC_017167	TTGG	2	8	2208609	2208616	0 %	50 %	50 %	0 %	384136018
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43143	NC_017167	TGTCG	2	10	2209177	2209186	0 %	40 %	40 %	20 %	384136019
43144	NC_017167	CGA	2	6	2209206	2209211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136019
43145	NC_017167	CG	3	6	2209296	2209301	0 %	0 %	50 %	50 %	384136019
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43150	NC_017167	CG	3	6	2209542	2209547	0 %	0 %	50 %	50 %	384136019
43151	NC_017167	CGG	2	6	2209609	2209614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136019
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43216	NC_017167	AAGA	2	8	2213535	2213542	75 %	0 %	25 %	0 %	384136023
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43218	NC_017167	AGG	2	6	2213632	2213637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136023
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43232	NC_017167	GCC	2	6	2214340	2214345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136023
43233	NC_017167	GAT	2	6	2214378	2214383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136023
43234	NC_017167	AG	3	6	2214395	2214400	50 %	0 %	50 %	0 %	384136024
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43236	NC_017167	TCA	2	6	2214482	2214487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136024
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43238	NC_017167	TGA	2	6	2214527	2214532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136024
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43243	NC_017167	AC	3	6	2214743	2214748	50 %	0 %	0 %	50 %	384136024
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43347	NC_017167	GGCC	2	8	2221288	2221295	0 %	0 %	50 %	50 %	384136031
43348	NC_017167	CGC	2	6	2221418	2221423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136032
43349	NC_017167	TCA	2	6	2221595	2221600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136032
43350	NC_017167	ACC	2	6	2221723	2221728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136032
43351	NC_017167	ACG	2	6	2221750	2221755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136032
43352	NC_017167	CGG	2	6	2221850	2221855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136032
43353	NC_017167	CAT	2	6	2221896	2221901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136032
43354	NC_017167	CCA	2	6	2221914	2221919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136032
43355	NC_017167	GCG	2	6	2222001	2222006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136032
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43358	NC_017167	GCC	2	6	2222169	2222174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136032
43359	NC_017167	ATC	2	6	2222191	2222196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136032
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43362	NC_017167	TGC	2	6	2222361	2222366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136032
43363	NC_017167	CGT	2	6	2222465	2222470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136032
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43374	NC_017167	GATC	2	8	2222944	2222951	25 %	25 %	25 %	25 %	384136033
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43383	NC_017167	GT	3	6	2223599	2223604	0 %	50 %	50 %	0 %	384136034
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43416	NC_017167	CAT	2	6	2225037	2225042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136035
43417	NC_017167	GGAT	2	8	2225195	2225202	25 %	25 %	50 %	0 %	384136035
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43421	NC_017167	CGA	2	6	2225559	2225564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136036
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43424	NC_017167	ACG	2	6	2225784	2225789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136037
43425	NC_017167	CG	3	6	2225788	2225793	0 %	0 %	50 %	50 %	384136037
43426	NC_017167	GAT	2	6	2225818	2225823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136037
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43428	NC_017167	AAG	2	6	2225945	2225950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136037
43429	NC_017167	GAA	2	6	2225959	2225964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136037
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43431	NC_017167	ATC	2	6	2226086	2226091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136037
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43434	NC_017167	CTT	2	6	2226243	2226248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136037
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43442	NC_017167	GCC	2	6	2226730	2226735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136038
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43446	NC_017167	CGA	2	6	2226987	2226992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136038
43447	NC_017167	TGA	2	6	2227053	2227058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136038
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43449	NC_017167	CGCC	2	8	2227122	2227129	0 %	0 %	25 %	75 %	384136038
43450	NC_017167	CAC	2	6	2227135	2227140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136038
43451	NC_017167	GC	5	10	2227152	2227161	0 %	0 %	50 %	50 %	384136038
43452	NC_017167	TCCG	2	8	2227177	2227184	0 %	25 %	25 %	50 %	384136038
43453	NC_017167	TGCC	2	8	2227200	2227207	0 %	25 %	25 %	50 %	384136038
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43455	NC_017167	TCG	2	6	2227277	2227282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136038
43456	NC_017167	CGG	2	6	2227315	2227320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136038
43457	NC_017167	GCA	2	6	2227359	2227364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136038
43458	NC_017167	TCG	2	6	2227367	2227372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136038
43459	NC_017167	CGCC	2	8	2227378	2227385	0 %	0 %	25 %	75 %	384136038
43460	NC_017167	TGA	2	6	2227631	2227636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136039
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43464	NC_017167	CGT	2	6	2227932	2227937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136040
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43493	NC_017167	ATG	2	6	2230808	2230813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136044
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