MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_017167	CGG	2	6	1550691	1550696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135313
31002	NC_017167	GC	4	8	1550724	1550731	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31003	NC_017167	CGT	2	6	1550748	1550753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31004	NC_017167	CGA	2	6	1550805	1550810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31005	NC_017167	TCGC	2	8	1550825	1550832	0 %	25 %	25 %	50 %	384135313
31006	NC_017167	ACG	2	6	1550834	1550839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31007	NC_017167	CG	3	6	1550881	1550886	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31008	NC_017167	CCTC	2	8	1550903	1550910	0 %	25 %	0 %	75 %	384135313
31009	NC_017167	TCAC	2	8	1550936	1550943	25 %	25 %	0 %	50 %	384135313
31010	NC_017167	CCAT	2	8	1550949	1550956	25 %	25 %	0 %	50 %	384135313
31011	NC_017167	GC	3	6	1550983	1550988	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31012	NC_017167	CGC	2	6	1551004	1551009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
31013	NC_017167	GC	3	6	1551057	1551062	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31014	NC_017167	CG	3	6	1551069	1551074	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31015	NC_017167	ACG	2	6	1551089	1551094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31016	NC_017167	ACG	2	6	1551165	1551170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31017	NC_017167	GC	3	6	1551179	1551184	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31018	NC_017167	CTT	2	6	1551210	1551215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135313
31019	NC_017167	CGT	2	6	1551276	1551281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31020	NC_017167	CG	3	6	1551312	1551317	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31021	NC_017167	ACGCG	2	10	1551330	1551339	20 %	0 %	40 %	40 %	384135313
31022	NC_017167	CGG	2	6	1551392	1551397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135313
31023	NC_017167	GAG	2	6	1551415	1551420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135313
31024	NC_017167	GC	3	6	1551450	1551455	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31025	NC_017167	TCG	2	6	1551560	1551565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31026	NC_017167	GTC	2	6	1551573	1551578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
31027	NC_017167	CGG	2	6	1551610	1551615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135313
31028	NC_017167	GCGA	2	8	1551625	1551632	25 %	0 %	50 %	25 %	384135313
31029	NC_017167	GCC	2	6	1551672	1551677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
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31031	NC_017167	CG	3	6	1551774	1551779	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31032	NC_017167	CCG	2	6	1551922	1551927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
31033	NC_017167	GCCT	2	8	1552094	1552101	0 %	25 %	25 %	50 %	384135313
31034	NC_017167	GC	3	6	1552186	1552191	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31035	NC_017167	CAAG	2	8	1552217	1552224	50 %	0 %	25 %	25 %	384135313
31036	NC_017167	TC	3	6	1552240	1552245	0 %	50 %	0 %	50 %	384135313
31037	NC_017167	GC	4	8	1552255	1552262	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31038	NC_017167	GCC	2	6	1552271	1552276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
31039	NC_017167	GC	3	6	1552304	1552309	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31040	NC_017167	GC	3	6	1552322	1552327	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
31041	NC_017167	CCG	2	6	1552336	1552341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
31042	NC_017167	GGC	2	6	1552413	1552418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135313
31043	NC_017167	CAA	2	6	1552427	1552432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135313
31044	NC_017167	GGCG	2	8	1552434	1552441	0 %	0 %	75 %	25 %	384135313
31045	NC_017167	GCGA	2	8	1552456	1552463	25 %	0 %	50 %	25 %	384135313
31046	NC_017167	GAAAC	2	10	1552510	1552519	60 %	0 %	20 %	20 %	384135313
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31050	NC_017167	ACG	2	6	1552838	1552843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135314
31051	NC_017167	CAG	2	6	1552852	1552857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135314
31052	NC_017167	CCA	2	6	1552932	1552937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135314
31053	NC_017167	GGC	2	6	1552965	1552970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135314
31054	NC_017167	GGT	2	6	1552971	1552976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135314
31055	NC_017167	TCG	2	6	1553027	1553032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135314
31056	NC_017167	ACG	2	6	1553090	1553095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135314
31057	NC_017167	AAG	2	6	1553131	1553136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135314
31058	NC_017167	GCA	2	6	1553244	1553249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135314
31059	NC_017167	GCCGA	2	10	1553260	1553269	20 %	0 %	40 %	40 %	384135314
31060	NC_017167	CGT	2	6	1553283	1553288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135314
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31062	NC_017167	AGG	2	6	1553455	1553460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135315
31063	NC_017167	CGT	2	6	1553504	1553509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135315
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31067	NC_017167	TCG	2	6	1553731	1553736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135316
31068	NC_017167	CGT	2	6	1553903	1553908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135317
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31072	NC_017167	CCA	2	6	1554106	1554111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135318
31073	NC_017167	CAC	2	6	1554122	1554127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135318
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31088	NC_017167	GC	3	6	1554894	1554899	0 %	0 %	50 %	50 %	384135319
31089	NC_017167	TGA	2	6	1555027	1555032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135319
31090	NC_017167	CAC	2	6	1555037	1555042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135319
31091	NC_017167	CGTC	2	8	1555048	1555055	0 %	25 %	25 %	50 %	384135319
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31098	NC_017167	CGCA	2	8	1555667	1555674	25 %	0 %	25 %	50 %	384135321
31099	NC_017167	GAT	2	6	1555749	1555754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135321
31100	NC_017167	GGC	2	6	1555764	1555769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135321
31101	NC_017167	GAGATC	2	12	1555806	1555817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384135321
31102	NC_017167	AC	3	6	1555883	1555888	50 %	0 %	0 %	50 %	384135321
31103	NC_017167	A	6	6	1555911	1555916	100 %	0 %	0 %	0 %	384135321
31104	NC_017167	CTC	2	6	1556067	1556072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135321
31105	NC_017167	A	6	6	1556166	1556171	100 %	0 %	0 %	0 %	384135321
31106	NC_017167	CCA	2	6	1556198	1556203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135321
31107	NC_017167	GATC	2	8	1556327	1556334	25 %	25 %	25 %	25 %	384135321
31108	NC_017167	TCG	2	6	1556343	1556348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135321
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31112	NC_017167	GCGT	2	8	1556735	1556742	0 %	25 %	50 %	25 %	384135322
31113	NC_017167	CCT	2	6	1556763	1556768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135322
31114	NC_017167	CCG	2	6	1556775	1556780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135322
31115	NC_017167	GAAC	2	8	1556872	1556879	50 %	0 %	25 %	25 %	384135322
31116	NC_017167	GCA	2	6	1556940	1556945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135322
31117	NC_017167	TGC	2	6	1556999	1557004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135322
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31228	NC_017167	CGT	2	6	1562901	1562906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135329
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31230	NC_017167	CTC	2	6	1562920	1562925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135329
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31232	NC_017167	CTC	2	6	1563019	1563024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135329
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