MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_017167	CTG	2	6	1280649	1280654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135033
25503	NC_017167	TCT	2	6	1280665	1280670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135033
25504	NC_017167	GTA	2	6	1280682	1280687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135033
25505	NC_017167	TAC	2	6	1281129	1281134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135034
25506	NC_017167	CCT	2	6	1281248	1281253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135034
25507	NC_017167	GCTGTG	2	12	1281360	1281371	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384135034
25508	NC_017167	CG	3	6	1281389	1281394	0 %	0 %	50 %	50 %	384135034
25509	NC_017167	TGCT	2	8	1281553	1281560	0 %	50 %	25 %	25 %	384135034
25510	NC_017167	GGC	2	6	1281603	1281608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135034
25511	NC_017167	AAC	2	6	1281633	1281638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135034
25512	NC_017167	TAC	2	6	1281648	1281653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135034
25513	NC_017167	CCG	2	6	1281771	1281776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135034
25514	NC_017167	CCG	2	6	1282120	1282125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135035
25515	NC_017167	ACCA	2	8	1282129	1282136	50 %	0 %	0 %	50 %	384135035
25516	NC_017167	CCCG	2	8	1282440	1282447	0 %	0 %	25 %	75 %	384135035
25517	NC_017167	CGC	2	6	1282495	1282500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135035
25518	NC_017167	CG	3	6	1282515	1282520	0 %	0 %	50 %	50 %	384135035
25519	NC_017167	TG	3	6	1282701	1282706	0 %	50 %	50 %	0 %	384135036
25520	NC_017167	CTG	2	6	1282710	1282715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25521	NC_017167	TTTCC	2	10	1282717	1282726	0 %	60 %	0 %	40 %	384135036
25522	NC_017167	CGT	2	6	1282930	1282935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25523	NC_017167	TGC	2	6	1282981	1282986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25524	NC_017167	TCG	3	9	1282990	1282998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25525	NC_017167	CGC	3	9	1283030	1283038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135036
25526	NC_017167	CGAA	2	8	1283161	1283168	50 %	0 %	25 %	25 %	384135036
25527	NC_017167	TCA	2	6	1283200	1283205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135036
25528	NC_017167	AAT	2	6	1283243	1283248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384135036
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25531	NC_017167	TACA	2	8	1283291	1283298	50 %	25 %	0 %	25 %	384135036
25532	NC_017167	TGG	2	6	1283338	1283343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25533	NC_017167	GTG	2	6	1283373	1283378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25534	NC_017167	TCC	2	6	1283404	1283409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135036
25535	NC_017167	C	7	7	1283408	1283414	0 %	0 %	0 %	100 %	384135036
25536	NC_017167	TCA	2	6	1283417	1283422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135036
25537	NC_017167	GTC	2	6	1283462	1283467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25538	NC_017167	CGG	2	6	1283552	1283557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135036
25539	NC_017167	TAC	2	6	1283601	1283606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135036
25540	NC_017167	TCG	2	6	1283632	1283637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
25541	NC_017167	TGG	2	6	1283674	1283679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25542	NC_017167	GTG	2	6	1283682	1283687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25543	NC_017167	GGT	2	6	1283693	1283698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25544	NC_017167	GCGCC	2	10	1283699	1283708	0 %	0 %	40 %	60 %	384135036
25545	NC_017167	GGGC	2	8	1283735	1283742	0 %	0 %	75 %	25 %	384135036
25546	NC_017167	TGG	2	6	1283776	1283781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135036
25547	NC_017167	ACT	2	6	1283815	1283820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135036
25548	NC_017167	TGC	2	6	1283836	1283841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135036
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25551	NC_017167	CGA	2	6	1283979	1283984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135037
25552	NC_017167	ATC	2	6	1284019	1284024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135037
25553	NC_017167	CTG	2	6	1284025	1284030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135037
25554	NC_017167	GGT	2	6	1284065	1284070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135037
25555	NC_017167	TGG	2	6	1284095	1284100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135037
25556	NC_017167	TCG	2	6	1284194	1284199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135037
25557	NC_017167	GAGC	2	8	1284233	1284240	25 %	0 %	50 %	25 %	384135037
25558	NC_017167	CAT	2	6	1284387	1284392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135037
25559	NC_017167	AGC	2	6	1284431	1284436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135037
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25561	NC_017167	GAA	2	6	1284540	1284545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135037
25562	NC_017167	CG	3	6	1284598	1284603	0 %	0 %	50 %	50 %	384135037
25563	NC_017167	T	6	6	1284604	1284609	0 %	100 %	0 %	0 %	384135037
25564	NC_017167	AGG	2	6	1284683	1284688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135037
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25567	NC_017167	TGG	2	6	1284845	1284850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135037
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25569	NC_017167	TCG	2	6	1284947	1284952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135037
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25572	NC_017167	GGCG	2	8	1285066	1285073	0 %	0 %	75 %	25 %	384135037
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25574	NC_017167	TCCT	2	8	1285227	1285234	0 %	50 %	0 %	50 %	384135037
25575	NC_017167	GGAG	2	8	1285365	1285372	25 %	0 %	75 %	0 %	384135037
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25584	NC_017167	CAC	2	6	1285965	1285970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135038
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25587	NC_017167	TGGG	2	8	1286071	1286078	0 %	25 %	75 %	0 %	384135038
25588	NC_017167	CGT	2	6	1286192	1286197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135038
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25598	NC_017167	GGGC	2	8	1286961	1286968	0 %	0 %	75 %	25 %	384135041
25599	NC_017167	GTG	2	6	1286995	1287000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135041
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25601	NC_017167	AGC	2	6	1287177	1287182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135041
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25603	NC_017167	AAGCG	2	10	1287311	1287320	40 %	0 %	40 %	20 %	384135042
25604	NC_017167	CGA	2	6	1287408	1287413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135042
25605	NC_017167	CG	3	6	1287417	1287422	0 %	0 %	50 %	50 %	384135042
25606	NC_017167	GATC	2	8	1287453	1287460	25 %	25 %	25 %	25 %	384135042
25607	NC_017167	GC	3	6	1287567	1287572	0 %	0 %	50 %	50 %	384135042
25608	NC_017167	CGA	2	6	1287576	1287581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135042
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25611	NC_017167	GCGG	2	8	1287627	1287634	0 %	0 %	75 %	25 %	384135042
25612	NC_017167	GAT	2	6	1287645	1287650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135042
25613	NC_017167	AC	3	6	1287768	1287773	50 %	0 %	0 %	50 %	384135042
25614	NC_017167	ATG	2	6	1287818	1287823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135042
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