MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017167	CGT	2	6	685470	685475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134441
13503	NC_017167	TGGT	2	8	685489	685496	0 %	50 %	50 %	0 %	384134441
13504	NC_017167	AAG	2	6	685543	685548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134441
13505	NC_017167	GTG	2	6	685579	685584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134441
13506	NC_017167	TCTGG	2	10	685632	685641	0 %	40 %	40 %	20 %	384134441
13507	NC_017167	GA	3	6	685702	685707	50 %	0 %	50 %	0 %	384134441
13508	NC_017167	CTT	2	6	685851	685856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134441
13509	NC_017167	ATG	2	6	685891	685896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134441
13510	NC_017167	CCA	2	6	685930	685935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134441
13511	NC_017167	ATCA	2	8	685953	685960	50 %	25 %	0 %	25 %	384134441
13512	NC_017167	AACC	2	8	686050	686057	50 %	0 %	0 %	50 %	384134441
13513	NC_017167	GTA	2	6	686070	686075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134441
13514	NC_017167	TAA	2	6	686102	686107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384134441
13515	NC_017167	TTG	2	6	686134	686139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134441
13516	NC_017167	GTC	2	6	686141	686146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134441
13517	NC_017167	CAT	2	6	686981	686986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134442
13518	NC_017167	TGG	2	6	687205	687210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134442
13519	NC_017167	TCG	2	6	687216	687221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134442
13520	NC_017167	TCG	2	6	687247	687252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134442
13521	NC_017167	GGC	2	6	687283	687288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134442
13522	NC_017167	GGC	2	6	687290	687295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134442
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13526	NC_017167	GTC	2	6	687896	687901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134443
13527	NC_017167	CTT	2	6	687940	687945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134443
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13534	NC_017167	CTG	2	6	688149	688154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134443
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13536	NC_017167	TGC	2	6	688339	688344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134443
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13539	NC_017167	GCA	2	6	688411	688416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134443
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13541	NC_017167	GCT	2	6	688689	688694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134444
13542	NC_017167	CGCA	2	8	688696	688703	25 %	0 %	25 %	50 %	384134444
13543	NC_017167	TGC	2	6	688947	688952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134444
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13548	NC_017167	CGA	2	6	689148	689153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134444
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13553	NC_017167	TCA	2	6	689741	689746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134444
13554	NC_017167	CGAT	2	8	690005	690012	25 %	25 %	25 %	25 %	384134444
13555	NC_017167	CGA	2	6	690039	690044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134444
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13572	NC_017167	CGAA	2	8	691202	691209	50 %	0 %	25 %	25 %	384134445
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13590	NC_017167	GAAC	2	8	693016	693023	50 %	0 %	25 %	25 %	384134447
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13598	NC_017167	TC	4	8	693419	693426	0 %	50 %	0 %	50 %	384134447
13599	NC_017167	TC	3	6	693484	693489	0 %	50 %	0 %	50 %	384134447
13600	NC_017167	GATC	2	8	693649	693656	25 %	25 %	25 %	25 %	384134447
13601	NC_017167	TCA	2	6	693660	693665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134447
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13604	NC_017167	CGGG	2	8	693839	693846	0 %	0 %	75 %	25 %	384134448
13605	NC_017167	TGA	2	6	693903	693908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134448
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13609	NC_017167	CCG	2	6	694052	694057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134448
13610	NC_017167	ACG	2	6	694064	694069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134448
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13613	NC_017167	CCT	2	6	694200	694205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134448
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13615	NC_017167	GCC	2	6	694271	694276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134448
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