MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017167	CGC	2	6	562238	562243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
11002	NC_017167	CCG	2	6	562305	562310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
11003	NC_017167	CG	4	8	562309	562316	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
11004	NC_017167	GGT	2	6	562338	562343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
11005	NC_017167	CGG	2	6	562356	562361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
11006	NC_017167	GGA	2	6	562371	562376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
11007	NC_017167	GAG	2	6	562510	562515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
11008	NC_017167	GTT	2	6	562649	562654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134318
11009	NC_017167	GCG	2	6	562681	562686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
11010	NC_017167	GC	3	6	562690	562695	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
11011	NC_017167	CGC	2	6	562738	562743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
11012	NC_017167	TGG	2	6	562754	562759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
11013	NC_017167	CG	3	6	562772	562777	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
11014	NC_017167	GCG	2	6	562797	562802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
11015	NC_017167	GAGG	2	8	562807	562814	25 %	0 %	75 %	0 %	384134318
11016	NC_017167	TGCC	2	8	562838	562845	0 %	25 %	25 %	50 %	384134318
11017	NC_017167	CGA	2	6	562854	562859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134318
11018	NC_017167	TCG	2	6	562861	562866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134318
11019	NC_017167	CA	3	6	562922	562927	50 %	0 %	0 %	50 %	384134318
11020	NC_017167	GGT	2	6	562956	562961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
11021	NC_017167	TGGAC	2	10	563003	563012	20 %	20 %	40 %	20 %	384134318
11022	NC_017167	GTGG	2	8	563091	563098	0 %	25 %	75 %	0 %	384134318
11023	NC_017167	GAG	2	6	563104	563109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
11024	NC_017167	TG	3	6	563121	563126	0 %	50 %	50 %	0 %	384134318
11025	NC_017167	AACAGG	2	12	563195	563206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384134318
11026	NC_017167	GCA	2	6	563234	563239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
11027	NC_017167	GT	3	6	563275	563280	0 %	50 %	50 %	0 %	384134319
11028	NC_017167	CTCG	2	8	563297	563304	0 %	25 %	25 %	50 %	384134319
11029	NC_017167	GGCCGG	2	12	563309	563320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
11030	NC_017167	TGG	2	6	563326	563331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
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11032	NC_017167	AC	3	6	563413	563418	50 %	0 %	0 %	50 %	384134319
11033	NC_017167	GTTCAC	2	12	563441	563452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384134319
11034	NC_017167	CGG	2	6	563542	563547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
11035	NC_017167	TGG	2	6	563557	563562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
11036	NC_017167	CGG	2	6	563606	563611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
11037	NC_017167	TGA	2	6	563617	563622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134319
11038	NC_017167	GCT	2	6	563636	563641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134319
11039	NC_017167	TGG	2	6	563653	563658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
11040	NC_017167	GCA	2	6	563682	563687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
11041	NC_017167	AGC	2	6	563776	563781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
11042	NC_017167	TCA	2	6	563818	563823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134319
11043	NC_017167	CCTGTT	2	12	563825	563836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384134319
11044	NC_017167	GCG	2	6	563863	563868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
11045	NC_017167	AAG	2	6	564246	564251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134320
11046	NC_017167	TTC	2	6	564268	564273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134320
11047	NC_017167	GCCG	2	8	564302	564309	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
11048	NC_017167	ACGGA	2	10	564351	564360	40 %	0 %	40 %	20 %	384134320
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11050	NC_017167	GGT	2	6	564560	564565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134320
11051	NC_017167	GCT	2	6	564571	564576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
11052	NC_017167	CGC	2	6	564603	564608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134320
11053	NC_017167	CTG	2	6	564654	564659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
11054	NC_017167	GC	3	6	564707	564712	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
11055	NC_017167	ACG	2	6	564763	564768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134320
11056	NC_017167	GGT	2	6	564935	564940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134320
11057	NC_017167	CAT	2	6	565055	565060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134320
11058	NC_017167	ACG	2	6	565075	565080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134320
11059	NC_017167	TCG	2	6	565120	565125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
11060	NC_017167	GGT	2	6	565127	565132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134320
11061	NC_017167	GAA	2	6	565226	565231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134320
11062	NC_017167	GGC	2	6	565250	565255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
11063	NC_017167	CGG	2	6	565273	565278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
11064	NC_017167	CGCC	2	8	565307	565314	0 %	0 %	25 %	75 %	384134320
11065	NC_017167	CACCGG	2	12	565427	565438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384134320
11066	NC_017167	CGC	2	6	565444	565449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134320
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11069	NC_017167	ACC	2	6	565476	565481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134320
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11072	NC_017167	CGG	2	6	565640	565645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
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11080	NC_017167	CGT	2	6	565990	565995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
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11091	NC_017167	GC	3	6	566658	566663	0 %	0 %	50 %	50 %	384134321
11092	NC_017167	TCG	2	6	566679	566684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134321
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11094	NC_017167	ACGT	2	8	566705	566712	25 %	25 %	25 %	25 %	384134321
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11099	NC_017167	CGC	2	6	566901	566906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134321
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11101	NC_017167	CGG	2	6	567105	567110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134321
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11104	NC_017167	CGA	2	6	567415	567420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134322
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11106	NC_017167	CGT	2	6	567532	567537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134322
11107	NC_017167	AGCG	2	8	567550	567557	25 %	0 %	50 %	25 %	384134322
11108	NC_017167	GC	3	6	567571	567576	0 %	0 %	50 %	50 %	384134322
11109	NC_017167	GTG	2	6	567635	567640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134322
11110	NC_017167	CG	3	6	567666	567671	0 %	0 %	50 %	50 %	384134322
11111	NC_017167	GC	3	6	567695	567700	0 %	0 %	50 %	50 %	384134322
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11115	NC_017167	ATG	2	6	567932	567937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134323
11116	NC_017167	GTCC	2	8	567994	568001	0 %	25 %	25 %	50 %	384134323
11117	NC_017167	GGC	2	6	568051	568056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134323
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11119	NC_017167	GTC	2	6	568112	568117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134323
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11237	NC_017167	GC	3	6	573411	573416	0 %	0 %	50 %	50 %	384134328
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11359	NC_017167	CTG	2	6	579859	579864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134334
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11478	NC_017167	TGG	2	6	585984	585989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134340
11479	NC_017167	AGG	2	6	585990	585995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134340
11480	NC_017167	CAT	2	6	586030	586035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134340
11481	NC_017167	AGG	2	6	586068	586073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134340
11482	NC_017167	CTT	2	6	586085	586090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134340
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