MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017167	CTG	2	6	509011	509016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134276
10003	NC_017167	GCGTCG	2	12	509017	509028	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134276
10004	NC_017167	GAA	2	6	509230	509235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134276
10005	NC_017167	CG	3	6	509249	509254	0 %	0 %	50 %	50 %	384134276
10006	NC_017167	CTG	2	6	509314	509319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134276
10007	NC_017167	GTT	2	6	509329	509334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134276
10008	NC_017167	GGC	2	6	509370	509375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134276
10009	NC_017167	GCC	2	6	509394	509399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134276
10010	NC_017167	TCA	2	6	509574	509579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134277
10011	NC_017167	GAA	2	6	509582	509587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134277
10012	NC_017167	GCCT	2	8	509679	509686	0 %	25 %	25 %	50 %	384134277
10013	NC_017167	GCT	2	6	509740	509745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134277
10014	NC_017167	GAA	2	6	510031	510036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134277
10015	NC_017167	TACA	2	8	510052	510059	50 %	25 %	0 %	25 %	384134277
10016	NC_017167	ACG	2	6	510066	510071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134277
10017	NC_017167	GT	3	6	510266	510271	0 %	50 %	50 %	0 %	384134277
10018	NC_017167	CAG	2	6	510283	510288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134277
10019	NC_017167	TCA	3	9	510297	510305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134277
10020	NC_017167	AAG	2	6	510389	510394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134277
10021	NC_017167	AAC	2	6	510662	510667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134277
10022	NC_017167	CTG	2	6	510701	510706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134277
10023	NC_017167	ATG	2	6	510738	510743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134277
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10025	NC_017167	A	6	6	510754	510759	100 %	0 %	0 %	0 %	384134277
10026	NC_017167	TGA	2	6	510798	510803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134277
10027	NC_017167	CAGA	2	8	510832	510839	50 %	0 %	25 %	25 %	384134277
10028	NC_017167	CTTCGT	2	12	511579	511590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384134278
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10030	NC_017167	GCTC	2	8	511654	511661	0 %	25 %	25 %	50 %	384134278
10031	NC_017167	GCAG	2	8	511733	511740	25 %	0 %	50 %	25 %	384134278
10032	NC_017167	TGCG	2	8	511741	511748	0 %	25 %	50 %	25 %	384134278
10033	NC_017167	CCGTC	2	10	511764	511773	0 %	20 %	20 %	60 %	384134278
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10037	NC_017167	CG	3	6	511973	511978	0 %	0 %	50 %	50 %	384134278
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10039	NC_017167	CGG	2	6	512013	512018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134278
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10043	NC_017167	CG	3	6	512159	512164	0 %	0 %	50 %	50 %	384134278
10044	NC_017167	TGA	2	6	512182	512187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134278
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10050	NC_017167	GCA	2	6	512290	512295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134278
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10053	NC_017167	CGC	2	6	512458	512463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134278
10054	NC_017167	CTG	2	6	512468	512473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134278
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10062	NC_017167	CG	3	6	512777	512782	0 %	0 %	50 %	50 %	384134279
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10102	NC_017167	GTGCA	2	10	515578	515587	20 %	20 %	40 %	20 %	384134282
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10117	NC_017167	CCGT	2	8	516165	516172	0 %	25 %	25 %	50 %	384134282
10118	NC_017167	GGC	2	6	516215	516220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134282
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10359	NC_017167	CGAGC	2	10	527426	527435	20 %	0 %	40 %	40 %	384134292
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10483	NC_017167	CCA	2	6	532057	532062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134295
10484	NC_017167	CG	5	10	532064	532073	0 %	0 %	50 %	50 %	384134295
10485	NC_017167	AGC	2	6	532075	532080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134295
10486	NC_017167	AAC	2	6	532104	532109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134295
10487	NC_017167	GC	3	6	532126	532131	0 %	0 %	50 %	50 %	384134295
10488	NC_017167	GC	3	6	532142	532147	0 %	0 %	50 %	50 %	384134295
10489	NC_017167	CGA	2	6	532151	532156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134295
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10491	NC_017167	TTG	2	6	532282	532287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134295
10492	NC_017167	CGT	2	6	532360	532365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134295
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10496	NC_017167	GACGT	2	10	532455	532464	20 %	20 %	40 %	20 %	384134295
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