MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017167	GCA	2	6	462809	462814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134224
9003	NC_017167	CAA	2	6	462822	462827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134224
9004	NC_017167	GGA	3	9	462830	462838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134224
9005	NC_017167	GGT	2	6	463160	463165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134225
9006	NC_017167	GTC	2	6	463173	463178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134225
9007	NC_017167	GCC	2	6	463232	463237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134225
9008	NC_017167	CGGC	2	8	463360	463367	0 %	0 %	50 %	50 %	384134225
9009	NC_017167	CGA	2	6	463412	463417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134225
9010	NC_017167	CCG	2	6	463459	463464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134225
9011	NC_017167	TGA	2	6	463565	463570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134225
9012	NC_017167	GC	3	6	463578	463583	0 %	0 %	50 %	50 %	384134225
9013	NC_017167	CAT	2	6	463667	463672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134226
9014	NC_017167	GCG	2	6	463698	463703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134226
9015	NC_017167	CAT	2	6	463841	463846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134226
9016	NC_017167	CGT	2	6	463916	463921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9017	NC_017167	GCG	3	9	463961	463969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134226
9018	NC_017167	TGA	2	6	463975	463980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134226
9019	NC_017167	CGA	2	6	463981	463986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9020	NC_017167	TCA	2	6	463990	463995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134226
9021	NC_017167	TGG	2	6	464037	464042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134226
9022	NC_017167	CGT	2	6	464093	464098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9023	NC_017167	GC	4	8	464133	464140	0 %	0 %	50 %	50 %	384134226
9024	NC_017167	TCT	2	6	464164	464169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134226
9025	NC_017167	GC	3	6	464179	464184	0 %	0 %	50 %	50 %	384134226
9026	NC_017167	ACG	2	6	464214	464219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134226
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9028	NC_017167	TGG	2	6	464368	464373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134226
9029	NC_017167	CGA	2	6	464387	464392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9030	NC_017167	GC	3	6	464421	464426	0 %	0 %	50 %	50 %	384134226
9031	NC_017167	CGC	2	6	464458	464463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134226
9032	NC_017167	GCT	2	6	464609	464614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9033	NC_017167	GTC	2	6	464667	464672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134226
9034	NC_017167	CCT	2	6	464735	464740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134226
9035	NC_017167	CGG	2	6	464765	464770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134226
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9037	NC_017167	GCTG	2	8	464783	464790	0 %	25 %	50 %	25 %	384134226
9038	NC_017167	CCA	2	6	464792	464797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134226
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9040	NC_017167	TCT	2	6	464860	464865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134226
9041	NC_017167	GC	3	6	464898	464903	0 %	0 %	50 %	50 %	384134226
9042	NC_017167	CCG	2	6	464998	465003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134226
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9045	NC_017167	GAG	2	6	465084	465089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134226
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9047	NC_017167	CGG	2	6	465317	465322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134227
9048	NC_017167	TCG	2	6	465339	465344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134227
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9050	NC_017167	GGA	2	6	465466	465471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134227
9051	NC_017167	CAG	2	6	465557	465562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134227
9052	NC_017167	ATC	2	6	465572	465577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134227
9053	NC_017167	TCG	2	6	465603	465608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134227
9054	NC_017167	GTCT	2	8	465652	465659	0 %	50 %	25 %	25 %	384134227
9055	NC_017167	AC	3	6	465814	465819	50 %	0 %	0 %	50 %	384134227
9056	NC_017167	TGG	2	6	465825	465830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134227
9057	NC_017167	GATGG	2	10	465898	465907	20 %	20 %	60 %	0 %	384134228
9058	NC_017167	CGA	2	6	465920	465925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134228
9059	NC_017167	CGAG	2	8	465947	465954	25 %	0 %	50 %	25 %	384134228
9060	NC_017167	CGC	2	6	465967	465972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134228
9061	NC_017167	CGC	2	6	466019	466024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134228
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9064	NC_017167	TCA	2	6	466156	466161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134228
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9067	NC_017167	TGACG	2	10	466232	466241	20 %	20 %	40 %	20 %	384134228
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9087	NC_017167	TTC	2	6	466991	466996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134229
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9093	NC_017167	GAC	3	9	467338	467346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134229
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9111	NC_017167	ATG	2	6	468431	468436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134230
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9113	NC_017167	GAT	2	6	468463	468468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134230
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9118	NC_017167	CTCACG	2	12	468599	468610	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384134230
9119	NC_017167	CGC	2	6	468624	468629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134230
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9121	NC_017167	CGC	2	6	468676	468681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134230
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9240	NC_017167	CCT	2	6	474407	474412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134234
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9484	NC_017167	GCT	2	6	486506	486511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134248
9485	NC_017167	GC	3	6	486522	486527	0 %	0 %	50 %	50 %	384134248
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9487	NC_017167	GC	3	6	486561	486566	0 %	0 %	50 %	50 %	384134248
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