MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52116	NC_017167	CGA	2	6	2675120	2675125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136512
52117	NC_017167	GCAC	2	8	2675141	2675148	25 %	0 %	25 %	50 %	384136512
52118	NC_017167	ACC	2	6	2675194	2675199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136512
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52120	NC_017167	ACGT	2	8	2675283	2675290	25 %	25 %	25 %	25 %	384136512
52121	NC_017167	CCG	3	9	2675291	2675299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136512
52122	NC_017167	GC	3	6	2675339	2675344	0 %	0 %	50 %	50 %	384136512
52123	NC_017167	GCCAC	2	10	2675411	2675420	20 %	0 %	20 %	60 %	384136512
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52215	NC_017167	CACT	2	8	2680192	2680199	25 %	25 %	0 %	50 %	384136516
52216	NC_017167	CTCGCT	2	12	2680215	2680226	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384136516
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52219	NC_017167	AAAG	2	8	2680308	2680315	75 %	0 %	25 %	0 %	384136516
52220	NC_017167	ATGGG	2	10	2680324	2680333	20 %	20 %	60 %	0 %	384136516
52221	NC_017167	CAG	2	6	2680383	2680388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136516
52222	NC_017167	GCCG	2	8	2680400	2680407	0 %	0 %	50 %	50 %	384136516
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52224	NC_017167	TG	3	6	2680466	2680471	0 %	50 %	50 %	0 %	384136517
52225	NC_017167	GC	3	6	2680482	2680487	0 %	0 %	50 %	50 %	384136517
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52227	NC_017167	GTCAC	2	10	2680637	2680646	20 %	20 %	20 %	40 %	384136517
52228	NC_017167	GCGG	2	8	2680656	2680663	0 %	0 %	75 %	25 %	384136517
52229	NC_017167	CTTC	2	8	2680667	2680674	0 %	50 %	0 %	50 %	384136517
52230	NC_017167	AGC	2	6	2680684	2680689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136517
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52232	NC_017167	ACC	2	6	2680742	2680747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136517
52233	NC_017167	ACC	2	6	2680762	2680767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136518
52234	NC_017167	CTGG	2	8	2680817	2680824	0 %	25 %	50 %	25 %	384136518
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52341	NC_017167	CGT	2	6	2685521	2685526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136521
52342	NC_017167	GCT	2	6	2685530	2685535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136521
52343	NC_017167	GTC	2	6	2685570	2685575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136521
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52345	NC_017167	TGGCC	2	10	2685641	2685650	0 %	20 %	40 %	40 %	384136521
52346	NC_017167	CGA	2	6	2685677	2685682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136521
52347	NC_017167	CGTGCG	2	12	2685692	2685703	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384136521
52348	NC_017167	TTC	2	6	2685840	2685845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136521
52349	NC_017167	ATGGTC	2	12	2685865	2685876	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384136521
52350	NC_017167	CAT	2	6	2686140	2686145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136522
52351	NC_017167	GCTCG	2	10	2686204	2686213	0 %	20 %	40 %	40 %	384136522
52352	NC_017167	GCG	2	6	2686214	2686219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136522
52353	NC_017167	GGA	2	6	2686228	2686233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136522
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52357	NC_017167	GGGAT	2	10	2686366	2686375	20 %	20 %	60 %	0 %	384136522
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52376	NC_017167	GGT	2	6	2687140	2687145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136522
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52444	NC_017167	GC	3	6	2690093	2690098	0 %	0 %	50 %	50 %	384136525
52445	NC_017167	CCA	2	6	2690152	2690157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136525
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52447	NC_017167	AC	3	6	2690218	2690223	50 %	0 %	0 %	50 %	384136525
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52451	NC_017167	CTT	2	6	2690526	2690531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136526
52452	NC_017167	CGG	2	6	2690599	2690604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136526
52453	NC_017167	TCA	2	6	2690642	2690647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136526
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52457	NC_017167	TCG	2	6	2690897	2690902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136526
52458	NC_017167	GC	3	6	2690944	2690949	0 %	0 %	50 %	50 %	384136526
52459	NC_017167	ACG	2	6	2691011	2691016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136526
52460	NC_017167	CG	3	6	2691050	2691055	0 %	0 %	50 %	50 %	384136526
52461	NC_017167	CGC	2	6	2691138	2691143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136526
52462	NC_017167	AAG	2	6	2691187	2691192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136526
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