MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 61141

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_017167	CACCT	2	10	2620205	2620214	20 %	20 %	0 %	60 %	384136457
51002	NC_017167	GC	3	6	2620244	2620249	0 %	0 %	50 %	50 %	384136457
51003	NC_017167	TGC	2	6	2620252	2620257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136457
51004	NC_017167	CG	4	8	2620282	2620289	0 %	0 %	50 %	50 %	384136457
51005	NC_017167	CT	3	6	2620292	2620297	0 %	50 %	0 %	50 %	384136457
51006	NC_017167	CGG	2	6	2620336	2620341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136457
51007	NC_017167	AAGCG	2	10	2620342	2620351	40 %	0 %	40 %	20 %	384136457
51008	NC_017167	ACC	2	6	2620374	2620379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136457
51009	NC_017167	GC	3	6	2620396	2620401	0 %	0 %	50 %	50 %	384136457
51010	NC_017167	GAA	2	6	2620550	2620555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136457
51011	NC_017167	CGC	2	6	2620576	2620581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136457
51012	NC_017167	GAC	2	6	2620625	2620630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136457
51013	NC_017167	GGC	2	6	2620639	2620644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136457
51014	NC_017167	TG	3	6	2620720	2620725	0 %	50 %	50 %	0 %	384136457
51015	NC_017167	GCG	2	6	2620791	2620796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136458
51016	NC_017167	CTTC	2	8	2620896	2620903	0 %	50 %	0 %	50 %	384136458
51017	NC_017167	CGA	2	6	2620929	2620934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51018	NC_017167	AGC	2	6	2621000	2621005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51019	NC_017167	TGA	2	6	2621009	2621014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136458
51020	NC_017167	CCG	2	6	2621099	2621104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136458
51021	NC_017167	CCG	2	6	2621114	2621119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136458
51022	NC_017167	CGT	3	9	2621133	2621141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51023	NC_017167	CCA	2	6	2621189	2621194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51024	NC_017167	GCCG	2	8	2621233	2621240	0 %	0 %	50 %	50 %	384136458
51025	NC_017167	CCA	2	6	2621253	2621258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51026	NC_017167	ATC	2	6	2621324	2621329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136458
51027	NC_017167	GCA	2	6	2621339	2621344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51028	NC_017167	GCC	2	6	2621345	2621350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136458
51029	NC_017167	AGG	2	6	2621456	2621461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136458
51030	NC_017167	CG	3	6	2621506	2621511	0 %	0 %	50 %	50 %	384136458
51031	NC_017167	CAC	2	6	2621563	2621568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51032	NC_017167	C	6	6	2621573	2621578	0 %	0 %	0 %	100 %	384136458
51033	NC_017167	ACGA	2	8	2621681	2621688	50 %	0 %	25 %	25 %	384136458
51034	NC_017167	TGA	2	6	2621736	2621741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136458
51035	NC_017167	CAT	2	6	2621749	2621754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136458
51036	NC_017167	CAG	2	6	2621770	2621775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51037	NC_017167	AGTCCG	2	12	2621796	2621807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51038	NC_017167	CAT	2	6	2621827	2621832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136458
51039	NC_017167	GAT	2	6	2621851	2621856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136458
51040	NC_017167	GTG	2	6	2621857	2621862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136458
51041	NC_017167	ACC	2	6	2621915	2621920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51042	NC_017167	CCA	2	6	2621931	2621936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51043	NC_017167	GCA	2	6	2621940	2621945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51044	NC_017167	TGG	2	6	2621946	2621951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136458
51045	NC_017167	TTC	2	6	2621960	2621965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136458
51046	NC_017167	ACC	2	6	2621977	2621982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136458
51047	NC_017167	AAG	2	6	2621987	2621992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136458
51048	NC_017167	TCG	2	6	2622047	2622052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51049	NC_017167	GCA	2	6	2622080	2622085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136458
51050	NC_017167	CTTCGA	2	12	2622438	2622449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384136459
51051	NC_017167	TCG	2	6	2622458	2622463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136459
51052	NC_017167	CGAG	2	8	2622468	2622475	25 %	0 %	50 %	25 %	384136459
51053	NC_017167	ACGG	2	8	2622512	2622519	25 %	0 %	50 %	25 %	384136459
51054	NC_017167	GTG	2	6	2622634	2622639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136459
51055	NC_017167	GCT	2	6	2622657	2622662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136459
51056	NC_017167	GTC	2	6	2622693	2622698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136459
51057	NC_017167	CGG	2	6	2622712	2622717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136459
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51059	NC_017167	CGA	2	6	2622822	2622827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136459
51060	NC_017167	CGG	2	6	2622874	2622879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136459
51061	NC_017167	GC	3	6	2622929	2622934	0 %	0 %	50 %	50 %	384136459
51062	NC_017167	CGC	2	6	2622945	2622950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136459
51063	NC_017167	GATT	2	8	2623038	2623045	25 %	50 %	25 %	0 %	384136459
51064	NC_017167	CGA	2	6	2623061	2623066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136459
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51066	NC_017167	GTC	2	6	2623204	2623209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136460
51067	NC_017167	CGG	2	6	2623260	2623265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136460
51068	NC_017167	TCC	2	6	2623315	2623320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136460
51069	NC_017167	CTC	2	6	2623392	2623397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136460
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51072	NC_017167	CGA	2	6	2623439	2623444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136460
51073	NC_017167	CTG	2	6	2623509	2623514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136460
51074	NC_017167	TCG	2	6	2623576	2623581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136460
51075	NC_017167	CG	4	8	2623611	2623618	0 %	0 %	50 %	50 %	384136460
51076	NC_017167	CACTT	2	10	2623669	2623678	20 %	40 %	0 %	40 %	384136460
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51084	NC_017167	CCT	2	6	2624109	2624114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136461
51085	NC_017167	GGCCC	2	10	2624139	2624148	0 %	0 %	40 %	60 %	384136461
51086	NC_017167	AGC	2	6	2624217	2624222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136461
51087	NC_017167	GAT	2	6	2624296	2624301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136461
51088	NC_017167	GAT	2	6	2624395	2624400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136461
51089	NC_017167	CGTG	2	8	2624433	2624440	0 %	25 %	50 %	25 %	384136461
51090	NC_017167	ATG	2	6	2624441	2624446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136461
51091	NC_017167	GCT	2	6	2624472	2624477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136461
51092	NC_017167	ATCTGC	2	12	2624495	2624506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384136461
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51094	NC_017167	ATG	2	6	2624582	2624587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136461
51095	NC_017167	GCC	2	6	2624599	2624604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136461
51096	NC_017167	TGATC	2	10	2624733	2624742	20 %	40 %	20 %	20 %	384136461
51097	NC_017167	GTCC	2	8	2624848	2624855	0 %	25 %	25 %	50 %	384136461
51098	NC_017167	GCCCG	2	10	2624867	2624876	0 %	0 %	40 %	60 %	384136461
51099	NC_017167	CGC	2	6	2625021	2625026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136461
51100	NC_017167	CAT	2	6	2625076	2625081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136461
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51102	NC_017167	GCCG	2	8	2625159	2625166	0 %	0 %	50 %	50 %	384136462
51103	NC_017167	AAG	2	6	2625174	2625179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136462
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51105	NC_017167	GCGA	2	8	2625310	2625317	25 %	0 %	50 %	25 %	384136462
51106	NC_017167	ACC	2	6	2625319	2625324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136462
51107	NC_017167	TGC	2	6	2625326	2625331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136462
51108	NC_017167	ACG	2	6	2625334	2625339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136462
51109	NC_017167	GC	3	6	2625357	2625362	0 %	0 %	50 %	50 %	384136462
51110	NC_017167	CGAG	2	8	2625431	2625438	25 %	0 %	50 %	25 %	384136462
51111	NC_017167	GC	3	6	2625447	2625452	0 %	0 %	50 %	50 %	384136462
51112	NC_017167	GCCC	2	8	2625456	2625463	0 %	0 %	25 %	75 %	384136462
51113	NC_017167	GAA	3	9	2625534	2625542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136462
51114	NC_017167	GAAG	2	8	2625544	2625551	50 %	0 %	50 %	0 %	384136462
51115	NC_017167	GC	3	6	2625571	2625576	0 %	0 %	50 %	50 %	384136462
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