MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acinetobacter baumannii 1656-2 plasmid ABKp2

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017164	TGAA	2	8	67	74	50 %	25 %	25 %	0 %	384133677
2	NC_017164	ACA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
3	NC_017164	ACA	3	9	131	139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
4	NC_017164	AAAG	2	8	141	148	75 %	0 %	25 %	0 %	384133677
5	NC_017164	A	6	6	220	225	100 %	0 %	0 %	0 %	384133677
6	NC_017164	ACA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
7	NC_017164	TGA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133677
8	NC_017164	CTA	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133677
9	NC_017164	ACC	2	6	426	431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133677
10	NC_017164	T	7	7	564	570	0 %	100 %	0 %	0 %	384133677
11	NC_017164	CCA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133678
12	NC_017164	TG	3	6	929	934	0 %	50 %	50 %	0 %	384133678
13	NC_017164	TCCA	2	8	937	944	25 %	25 %	0 %	50 %	384133678
14	NC_017164	A	6	6	953	958	100 %	0 %	0 %	0 %	384133678
15	NC_017164	AAT	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133678
16	NC_017164	TAA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133678
17	NC_017164	CTG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133678
18	NC_017164	A	7	7	1161	1167	100 %	0 %	0 %	0 %	384133678
19	NC_017164	AG	3	6	1189	1194	50 %	0 %	50 %	0 %	384133678
20	NC_017164	T	6	6	1204	1209	0 %	100 %	0 %	0 %	384133678
21	NC_017164	ACT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133679
22	NC_017164	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133679
23	NC_017164	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	384133679
24	NC_017164	CTT	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133679
25	NC_017164	AAT	2	6	1444	1449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133679
26	NC_017164	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133679
27	NC_017164	CA	3	6	1824	1829	50 %	0 %	0 %	50 %	384133680
28	NC_017164	GCTT	2	8	1878	1885	0 %	50 %	25 %	25 %	384133680
29	NC_017164	TGA	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133680
30	NC_017164	CAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133680
31	NC_017164	CTTG	2	8	2024	2031	0 %	50 %	25 %	25 %	384133680
32	NC_017164	ATGA	2	8	2066	2073	50 %	25 %	25 %	0 %	384133680
33	NC_017164	ATGCT	2	10	2085	2094	20 %	40 %	20 %	20 %	384133680
34	NC_017164	A	6	6	2104	2109	100 %	0 %	0 %	0 %	384133680
35	NC_017164	TCA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133680
36	NC_017164	TAAA	2	8	2251	2258	75 %	25 %	0 %	0 %	384133681
37	NC_017164	TAC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
38	NC_017164	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
39	NC_017164	ATTC	2	8	2484	2491	25 %	50 %	0 %	25 %	384133681
40	NC_017164	TAT	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
41	NC_017164	AGGA	2	8	2536	2543	50 %	0 %	50 %	0 %	384133681
42	NC_017164	AAT	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
43	NC_017164	GTG	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133681
44	NC_017164	TAC	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
45	NC_017164	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133681
46	NC_017164	CTC	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133681
47	NC_017164	AGA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
48	NC_017164	ATA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
49	NC_017164	ATG	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
50	NC_017164	A	6	6	3149	3154	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
51	NC_017164	TAT	2	6	3165	3170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
52	NC_017164	GATG	2	8	3179	3186	25 %	25 %	50 %	0 %	384133681
53	NC_017164	ATTA	2	8	3195	3202	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
54	NC_017164	TCA	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
55	NC_017164	TC	3	6	3256	3261	0 %	50 %	0 %	50 %	384133681
56	NC_017164	ATG	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
57	NC_017164	TA	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
58	NC_017164	ATT	2	6	3370	3375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
59	NC_017164	T	6	6	3411	3416	0 %	100 %	0 %	0 %	384133681
60	NC_017164	ATA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
61	NC_017164	AAG	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
62	NC_017164	ACC	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133681
63	NC_017164	CAG	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133681
64	NC_017164	ACTTT	2	10	3637	3646	20 %	60 %	0 %	20 %	384133681
65	NC_017164	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
66	NC_017164	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
67	NC_017164	A	7	7	3757	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
68	NC_017164	TAA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
69	NC_017164	AAGA	2	8	3901	3908	75 %	0 %	25 %	0 %	384133681
70	NC_017164	CTA	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
71	NC_017164	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
72	NC_017164	GAT	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
73	NC_017164	TACT	2	8	4058	4065	25 %	50 %	0 %	25 %	384133681
74	NC_017164	TA	4	8	4083	4090	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
75	NC_017164	CTG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133681
76	NC_017164	CT	3	6	4235	4240	0 %	50 %	0 %	50 %	384133681
77	NC_017164	CCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133681
78	NC_017164	TGA	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
79	NC_017164	ATA	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
80	NC_017164	CA	3	6	4527	4532	50 %	0 %	0 %	50 %	384133681
81	NC_017164	AAT	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
82	NC_017164	AT	3	6	4604	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
83	NC_017164	GAA	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
84	NC_017164	TTTAG	2	10	4629	4638	20 %	60 %	20 %	0 %	384133681
85	NC_017164	AGATA	2	10	4657	4666	60 %	20 %	20 %	0 %	384133681
86	NC_017164	CT	3	6	4979	4984	0 %	50 %	0 %	50 %	384133682
87	NC_017164	CAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133682
88	NC_017164	A	9	9	5003	5011	100 %	0 %	0 %	0 %	384133682
89	NC_017164	AAC	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133682
90	NC_017164	ACT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133682
91	NC_017164	ATG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
92	NC_017164	TGA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
93	NC_017164	GCA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133682
94	NC_017164	TCA	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133682
95	NC_017164	TGA	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
96	NC_017164	TTGAT	2	10	5405	5414	20 %	60 %	20 %	0 %	384133682
97	NC_017164	GAA	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133683
98	NC_017164	A	7	7	6281	6287	100 %	0 %	0 %	0 %	384133683
99	NC_017164	AGA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133683
100	NC_017164	TGAG	2	8	6625	6632	25 %	25 %	50 %	0 %	384133683
101	NC_017164	GATA	2	8	7571	7578	50 %	25 %	25 %	0 %	384133684
102	NC_017164	ATG	2	6	7590	7595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133684
103	NC_017164	T	7	7	7677	7683	0 %	100 %	0 %	0 %	384133684

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.