MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 16603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_016623	GCCC	2	8	640596	640603	0 %	0 %	25 %	75 %	374294060
16502	NC_016623	C	6	6	640601	640606	0 %	0 %	0 %	100 %	374294060
16503	NC_016623	GTC	2	6	640615	640620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16504	NC_016623	CCG	2	6	640659	640664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16505	NC_016623	GCCGC	2	10	640704	640713	0 %	0 %	40 %	60 %	374294060
16506	NC_016623	CGC	2	6	640749	640754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16507	NC_016623	GGC	2	6	640773	640778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16508	NC_016623	GCG	2	6	640784	640789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16509	NC_016623	CCA	2	6	640842	640847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294060
16510	NC_016623	GC	3	6	640887	640892	0 %	0 %	50 %	50 %	374294060
16511	NC_016623	CGG	2	6	640896	640901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16512	NC_016623	CGG	2	6	640917	640922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16513	NC_016623	TGGCG	2	10	641010	641019	0 %	20 %	60 %	20 %	374294060
16514	NC_016623	GC	3	6	641093	641098	0 %	0 %	50 %	50 %	374294060
16515	NC_016623	CCG	2	6	641132	641137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16516	NC_016623	CAAGGC	2	12	641169	641180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16517	NC_016623	GC	3	6	641179	641184	0 %	0 %	50 %	50 %	374294060
16518	NC_016623	CTG	2	6	641221	641226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16519	NC_016623	GCACCT	2	12	641258	641269	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374294060
16520	NC_016623	ACCA	2	8	641287	641294	50 %	0 %	0 %	50 %	374294060
16521	NC_016623	GCG	2	6	641380	641385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16522	NC_016623	GTG	2	6	641395	641400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294060
16523	NC_016623	TCG	2	6	641441	641446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16524	NC_016623	GC	4	8	641451	641458	0 %	0 %	50 %	50 %	374294060
16525	NC_016623	TCG	2	6	641471	641476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16526	NC_016623	GCT	2	6	641478	641483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16527	NC_016623	CGG	2	6	641490	641495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16528	NC_016623	ACCA	2	8	641500	641507	50 %	0 %	0 %	50 %	374294060
16529	NC_016623	CGC	4	12	641529	641540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16530	NC_016623	GAACT	2	10	641548	641557	40 %	20 %	20 %	20 %	374294060
16531	NC_016623	GGA	2	6	641559	641564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294060
16532	NC_016623	CGG	2	6	641579	641584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16533	NC_016623	GCT	2	6	641592	641597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16534	NC_016623	CGG	2	6	641649	641654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16535	NC_016623	TCA	2	6	641663	641668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294060
16536	NC_016623	CCA	2	6	641711	641716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294060
16537	NC_016623	GGGC	2	8	641727	641734	0 %	0 %	75 %	25 %	374294060
16538	NC_016623	CGA	2	6	641763	641768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16539	NC_016623	GCG	2	6	641771	641776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16540	NC_016623	GCG	2	6	641810	641815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16541	NC_016623	GTC	2	6	641824	641829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16542	NC_016623	CCA	2	6	641831	641836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294060
16543	NC_016623	GGC	2	6	641860	641865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16544	NC_016623	TCA	2	6	641900	641905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294060
16545	NC_016623	CGG	2	6	641912	641917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16546	NC_016623	CGT	2	6	641934	641939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16547	NC_016623	GCCC	2	8	641946	641953	0 %	0 %	25 %	75 %	374294060
16548	NC_016623	AGG	2	6	641969	641974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294060
16549	NC_016623	GCC	2	6	641983	641988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16550	NC_016623	CGCGA	2	10	642010	642019	20 %	0 %	40 %	40 %	374294060
16551	NC_016623	TCG	3	9	642020	642028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16552	NC_016623	CGC	2	6	642083	642088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16553	NC_016623	TGC	2	6	642095	642100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294060
16554	NC_016623	CGG	2	6	642167	642172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16555	NC_016623	GCG	2	6	642200	642205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16556	NC_016623	GCC	2	6	642283	642288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16557	NC_016623	CCG	4	12	642310	642321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294060
16558	NC_016623	CAA	2	6	642372	642377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294060
16559	NC_016623	CGG	2	6	642386	642391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16560	NC_016623	GCG	2	6	642395	642400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294060
16561	NC_016623	CGC	2	6	642582	642587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294061
16562	NC_016623	CGG	2	6	642621	642626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16563	NC_016623	GCT	2	6	642651	642656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16564	NC_016623	ATC	2	6	642709	642714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294061
16565	NC_016623	TCC	2	6	642773	642778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294061
16566	NC_016623	CGA	2	6	642792	642797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16567	NC_016623	CG	3	6	642816	642821	0 %	0 %	50 %	50 %	374294061
16568	NC_016623	CGA	2	6	642864	642869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16569	NC_016623	CCG	2	6	642904	642909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294061
16570	NC_016623	TCT	2	6	642935	642940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294061
16571	NC_016623	CGT	2	6	643020	643025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16572	NC_016623	TCT	2	6	643091	643096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294061
16573	NC_016623	CAG	2	6	643102	643107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16574	NC_016623	CTG	2	6	643153	643158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16575	NC_016623	GCG	2	6	643259	643264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16576	NC_016623	GC	3	6	643283	643288	0 %	0 %	50 %	50 %	374294061
16577	NC_016623	ACC	2	6	643307	643312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294061
16578	NC_016623	TGC	2	6	643313	643318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16579	NC_016623	GTCT	2	8	643324	643331	0 %	50 %	25 %	25 %	374294061
16580	NC_016623	CGA	2	6	643377	643382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
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16583	NC_016623	CGG	2	6	643476	643481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16584	NC_016623	CGA	2	6	643500	643505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16585	NC_016623	CCCG	2	8	643515	643522	0 %	0 %	25 %	75 %	374294061
16586	NC_016623	TCG	2	6	643541	643546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16587	NC_016623	GGC	2	6	643680	643685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16588	NC_016623	CGA	2	6	643728	643733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16589	NC_016623	TGA	2	6	643751	643756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294061
16590	NC_016623	GGC	2	6	643774	643779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16591	NC_016623	CGGC	2	8	643789	643796	0 %	0 %	50 %	50 %	374294061
16592	NC_016623	CGG	2	6	643827	643832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
16593	NC_016623	GATG	2	8	643863	643870	25 %	25 %	50 %	0 %	374294061
16594	NC_016623	CGA	2	6	643905	643910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
16595	NC_016623	ATC	2	6	643942	643947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294061
16596	NC_016623	ACG	3	9	644051	644059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
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16599	NC_016623	TCG	2	6	646247	646252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294062
16600	NC_016623	CCA	2	6	646271	646276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294062
16601	NC_016623	GGAA	2	8	646336	646343	50 %	0 %	50 %	0 %	374294062
16602	NC_016623	GC	3	6	646373	646378	0 %	0 %	50 %	50 %	374294062
16603	NC_016623	ACGGG	2	10	646401	646410	20 %	0 %	60 %	20 %	374294062

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.