MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_015942	GCC	2	6	2723057	2723062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200824
49002	NC_015942	CGT	2	6	2723113	2723118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200824
49003	NC_015942	CCAC	2	8	2723127	2723134	25 %	0 %	0 %	75 %	344200824
49004	NC_015942	TGG	2	6	2723247	2723252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200824
49005	NC_015942	GCC	2	6	2723315	2723320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200824
49006	NC_015942	TGGT	2	8	2723351	2723358	0 %	50 %	50 %	0 %	344200824
49007	NC_015942	CAA	2	6	2723362	2723367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200824
49008	NC_015942	GGA	3	9	2723383	2723391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200824
49009	NC_015942	GGC	2	6	2723392	2723397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200824
49010	NC_015942	GCC	2	6	2723459	2723464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200824
49011	NC_015942	GTG	2	6	2723466	2723471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200824
49012	NC_015942	CGA	2	6	2723560	2723565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200824
49013	NC_015942	CGA	2	6	2723569	2723574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200824
49014	NC_015942	GGA	2	6	2723587	2723592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200824
49015	NC_015942	GAC	2	6	2723603	2723608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200824
49016	NC_015942	TCA	2	6	2723672	2723677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200825
49017	NC_015942	GCA	2	6	2723684	2723689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49018	NC_015942	GCT	2	6	2723725	2723730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49019	NC_015942	CA	3	6	2723745	2723750	50 %	0 %	0 %	50 %	344200825
49020	NC_015942	CCG	2	6	2723763	2723768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200825
49021	NC_015942	TCC	2	6	2723794	2723799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200825
49022	NC_015942	GGC	2	6	2723868	2723873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49023	NC_015942	GGC	2	6	2723889	2723894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49024	NC_015942	CGG	2	6	2723928	2723933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49025	NC_015942	CAT	2	6	2724042	2724047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200825
49026	NC_015942	CTG	2	6	2724241	2724246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49027	NC_015942	GGCG	2	8	2724252	2724259	0 %	0 %	75 %	25 %	344200825
49028	NC_015942	GCG	2	6	2724281	2724286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49029	NC_015942	GCG	2	6	2724307	2724312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49030	NC_015942	GCC	2	6	2724334	2724339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200825
49031	NC_015942	GGC	2	6	2724435	2724440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200825
49032	NC_015942	GCTG	2	8	2724449	2724456	0 %	25 %	50 %	25 %	344200825
49033	NC_015942	CG	3	6	2724504	2724509	0 %	0 %	50 %	50 %	344200825
49034	NC_015942	AGC	2	6	2724529	2724534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49035	NC_015942	CCG	3	9	2724554	2724562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200825
49036	NC_015942	TGT	2	6	2724587	2724592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200825
49037	NC_015942	AGG	2	6	2724650	2724655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200825
49038	NC_015942	TGC	2	6	2724659	2724664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49039	NC_015942	TGAGAT	2	12	2724714	2724725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200825
49040	NC_015942	CAG	2	6	2724750	2724755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49041	NC_015942	CAG	2	6	2724759	2724764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200825
49042	NC_015942	ATAGAG	2	12	2724840	2724851	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	344200826
49043	NC_015942	A	6	6	2724867	2724872	100 %	0 %	0 %	0 %	344200826
49044	NC_015942	CTG	2	6	2724894	2724899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200826
49045	NC_015942	TCA	2	6	2724916	2724921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200826
49046	NC_015942	A	6	6	2724921	2724926	100 %	0 %	0 %	0 %	344200826
49047	NC_015942	GTG	2	6	2724966	2724971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200826
49048	NC_015942	TTC	2	6	2725116	2725121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200826
49049	NC_015942	TGTT	2	8	2725217	2725224	0 %	75 %	25 %	0 %	344200826
49050	NC_015942	GTA	2	6	2725363	2725368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200827
49051	NC_015942	CAT	2	6	2725397	2725402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200827
49052	NC_015942	GTA	2	6	2725456	2725461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200827
49053	NC_015942	GCCT	2	8	2725529	2725536	0 %	25 %	25 %	50 %	344200827
49054	NC_015942	T	6	6	2725569	2725574	0 %	100 %	0 %	0 %	344200827
49055	NC_015942	CGT	2	6	2725671	2725676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200828
49056	NC_015942	CG	4	8	2725721	2725728	0 %	0 %	50 %	50 %	344200828
49057	NC_015942	CCG	2	6	2725755	2725760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200828
49058	NC_015942	GTG	2	6	2725943	2725948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200828
49059	NC_015942	ACC	2	6	2725991	2725996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200828
49060	NC_015942	AAT	2	6	2726014	2726019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200828
49061	NC_015942	GTCC	2	8	2726024	2726031	0 %	25 %	25 %	50 %	344200828
49062	NC_015942	GCA	2	6	2726090	2726095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200828
49063	NC_015942	GGT	2	6	2726110	2726115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200828
49064	NC_015942	ATG	2	6	2726125	2726130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200828
49065	NC_015942	ACG	2	6	2726149	2726154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49066	NC_015942	GAT	2	6	2726209	2726214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200829
49067	NC_015942	TCG	2	6	2726215	2726220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49068	NC_015942	GCA	2	6	2726295	2726300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49069	NC_015942	CCGA	2	8	2726381	2726388	25 %	0 %	25 %	50 %	344200829
49070	NC_015942	CAG	2	6	2726407	2726412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49071	NC_015942	C	6	6	2726457	2726462	0 %	0 %	0 %	100 %	344200829
49072	NC_015942	ATA	2	6	2726479	2726484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200829
49073	NC_015942	GAT	2	6	2726511	2726516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200829
49074	NC_015942	CCAG	2	8	2726528	2726535	25 %	0 %	25 %	50 %	344200829
49075	NC_015942	GAT	2	6	2726587	2726592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200829
49076	NC_015942	CTG	2	6	2726630	2726635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49077	NC_015942	CGC	2	6	2726638	2726643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200829
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49079	NC_015942	CGG	2	6	2726663	2726668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200829
49080	NC_015942	CGG	2	6	2726686	2726691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200829
49081	NC_015942	CAC	2	6	2726720	2726725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200829
49082	NC_015942	A	7	7	2726789	2726795	100 %	0 %	0 %	0 %	344200829
49083	NC_015942	GC	3	6	2726865	2726870	0 %	0 %	50 %	50 %	344200829
49084	NC_015942	CCG	2	6	2726900	2726905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200829
49085	NC_015942	CCA	3	9	2726925	2726933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200829
49086	NC_015942	T	6	6	2726961	2726966	0 %	100 %	0 %	0 %	344200829
49087	NC_015942	GGT	2	6	2726988	2726993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200829
49088	NC_015942	GCG	2	6	2727014	2727019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200829
49089	NC_015942	CAGC	2	8	2727186	2727193	25 %	0 %	25 %	50 %	344200829
49090	NC_015942	CAG	2	6	2727235	2727240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200829
49091	NC_015942	CTT	2	6	2727312	2727317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200829
49092	NC_015942	AGC	3	9	2727443	2727451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200830
49093	NC_015942	GC	3	6	2727547	2727552	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
49094	NC_015942	CAT	2	6	2727580	2727585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200830
49095	NC_015942	GC	3	6	2727615	2727620	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
49096	NC_015942	GC	3	6	2727869	2727874	0 %	0 %	50 %	50 %	344200830
49097	NC_015942	GGGCG	2	10	2727883	2727892	0 %	0 %	80 %	20 %	344200830
49098	NC_015942	GCT	2	6	2727935	2727940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
49099	NC_015942	TGA	2	6	2728004	2728009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200831
49100	NC_015942	CAA	2	6	2728013	2728018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200831
49101	NC_015942	GAAA	2	8	2728031	2728038	75 %	0 %	25 %	0 %	344200831
49102	NC_015942	TGC	2	6	2728042	2728047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
49103	NC_015942	GTA	2	6	2728059	2728064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200831
49104	NC_015942	CAGCG	2	10	2728073	2728082	20 %	0 %	40 %	40 %	344200831
49105	NC_015942	ACT	2	6	2728108	2728113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
49106	NC_015942	CTG	2	6	2728137	2728142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
49107	NC_015942	CGC	2	6	2728221	2728226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200831
49108	NC_015942	ATT	2	6	2728247	2728252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200831
49109	NC_015942	ACCGCC	2	12	2728266	2728277	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344200831
49110	NC_015942	ATC	2	6	2728290	2728295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
49111	NC_015942	GCT	2	6	2728319	2728324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200831
49112	NC_015942	GGA	3	9	2728379	2728387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200831
49113	NC_015942	TCC	2	6	2728456	2728461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200831
49114	NC_015942	ATC	2	6	2728473	2728478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
49115	NC_015942	TCA	2	6	2728561	2728566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
49116	NC_015942	CCCTG	2	10	2728567	2728576	0 %	20 %	20 %	60 %	344200831
49117	NC_015942	CAG	2	6	2728632	2728637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200831
49118	NC_015942	CAT	2	6	2728671	2728676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200831
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49231	NC_015942	GCA	2	6	2733852	2733857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200836
49232	NC_015942	CAC	2	6	2733928	2733933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200836
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49331	NC_015942	CG	3	6	2738430	2738435	0 %	0 %	50 %	50 %	344200842
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49341	NC_015942	C	6	6	2738826	2738831	0 %	0 %	0 %	100 %	344200843
49342	NC_015942	CGC	2	6	2738854	2738859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200843
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49344	NC_015942	ACT	2	6	2738958	2738963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200843
49345	NC_015942	ACAACC	2	12	2738964	2738975	50 %	0 %	0 %	50 %	344200843
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49347	NC_015942	CCG	2	6	2739109	2739114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200843
49348	NC_015942	TGC	2	6	2739129	2739134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200843
49349	NC_015942	GTTCCC	2	12	2739188	2739199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344200843
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49354	NC_015942	GCCCC	2	10	2739694	2739703	0 %	0 %	20 %	80 %	344200844
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49460	NC_015942	CGG	2	6	2744694	2744699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200850
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49464	NC_015942	AGG	2	6	2744979	2744984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200851
49465	NC_015942	ATA	2	6	2745058	2745063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200851
49466	NC_015942	AAAG	2	8	2745211	2745218	75 %	0 %	25 %	0 %	344200851
49467	NC_015942	CTTTT	2	10	2745250	2745259	0 %	80 %	0 %	20 %	344200851
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49471	NC_015942	AG	3	6	2745444	2745449	50 %	0 %	50 %	0 %	344200851
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49483	NC_015942	TTC	2	6	2746224	2746229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200852
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49488	NC_015942	A	6	6	2746512	2746517	100 %	0 %	0 %	0 %	344200853
49489	NC_015942	GC	3	6	2746523	2746528	0 %	0 %	50 %	50 %	344200853
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49491	NC_015942	CCG	2	6	2746545	2746550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200853
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49493	NC_015942	AGTG	2	8	2746615	2746622	25 %	25 %	50 %	0 %	344200853
49494	NC_015942	ACT	2	6	2746726	2746731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200853
49495	NC_015942	GAT	2	6	2746755	2746760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200853
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49497	NC_015942	ACC	2	6	2746870	2746875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200853
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49499	NC_015942	AACC	2	8	2746906	2746913	50 %	0 %	0 %	50 %	344200853
49500	NC_015942	CAC	2	6	2746998	2747003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200853

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