MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48001	NC_015942	CAA	3	9	2668247	2668255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200755
48002	NC_015942	CAAT	2	8	2668261	2668268	50 %	25 %	0 %	25 %	344200755
48003	NC_015942	GCG	2	6	2668272	2668277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200755
48004	NC_015942	CAGCAC	2	12	2668283	2668294	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344200755
48005	NC_015942	CGC	3	9	2668295	2668303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200755
48006	NC_015942	GC	4	8	2668317	2668324	0 %	0 %	50 %	50 %	344200755
48007	NC_015942	GAT	2	6	2668333	2668338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200755
48008	NC_015942	AGC	2	6	2668383	2668388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200755
48009	NC_015942	GCC	2	6	2668392	2668397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200755
48010	NC_015942	C	6	6	2668426	2668431	0 %	0 %	0 %	100 %	344200755
48011	NC_015942	CACC	2	8	2668471	2668478	25 %	0 %	0 %	75 %	344200755
48012	NC_015942	CAA	2	6	2668487	2668492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200755
48013	NC_015942	A	6	6	2668547	2668552	100 %	0 %	0 %	0 %	344200755
48014	NC_015942	CGC	2	6	2668557	2668562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200755
48015	NC_015942	T	8	8	2668575	2668582	0 %	100 %	0 %	0 %	344200755
48016	NC_015942	C	7	7	2668589	2668595	0 %	0 %	0 %	100 %	344200756
48017	NC_015942	CGC	2	6	2668682	2668687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200756
48018	NC_015942	CAA	2	6	2668743	2668748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200756
48019	NC_015942	GCA	2	6	2668757	2668762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200756
48020	NC_015942	CAGA	2	8	2668914	2668921	50 %	0 %	25 %	25 %	344200756
48021	NC_015942	GCG	2	6	2668938	2668943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200756
48022	NC_015942	ATG	2	6	2669059	2669064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200756
48023	NC_015942	CAA	2	6	2669104	2669109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200756
48024	NC_015942	CAC	2	6	2669140	2669145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200756
48025	NC_015942	AAT	2	6	2669207	2669212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200756
48026	NC_015942	CCG	2	6	2669232	2669237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200756
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48028	NC_015942	GCA	2	6	2669356	2669361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48029	NC_015942	GCC	2	6	2669364	2669369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48030	NC_015942	GC	3	6	2669390	2669395	0 %	0 %	50 %	50 %	344200757
48031	NC_015942	TGC	2	6	2669441	2669446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48032	NC_015942	GCC	3	9	2669511	2669519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48033	NC_015942	GGC	2	6	2669525	2669530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200757
48034	NC_015942	CTC	2	6	2669568	2669573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200757
48035	NC_015942	ATGGC	2	10	2669593	2669602	20 %	20 %	40 %	20 %	344200757
48036	NC_015942	CGT	2	6	2669642	2669647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48037	NC_015942	GCGG	2	8	2669738	2669745	0 %	0 %	75 %	25 %	344200757
48038	NC_015942	GAC	2	6	2669806	2669811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48039	NC_015942	TGG	2	6	2669830	2669835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200757
48040	NC_015942	CCG	2	6	2669893	2669898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
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48042	NC_015942	CGC	2	6	2670037	2670042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48043	NC_015942	GCC	2	6	2670052	2670057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48044	NC_015942	TC	3	6	2670065	2670070	0 %	50 %	0 %	50 %	344200757
48045	NC_015942	GCCT	2	8	2670090	2670097	0 %	25 %	25 %	50 %	344200757
48046	NC_015942	GCC	2	6	2670138	2670143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48047	NC_015942	GC	3	6	2670172	2670177	0 %	0 %	50 %	50 %	344200757
48048	NC_015942	ATC	2	6	2670234	2670239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200757
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48050	NC_015942	TGC	2	6	2670287	2670292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48051	NC_015942	ACC	2	6	2670304	2670309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200757
48052	NC_015942	CGC	2	6	2670311	2670316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200757
48053	NC_015942	GTA	2	6	2670412	2670417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200757
48054	NC_015942	GCA	2	6	2670454	2670459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200757
48055	NC_015942	CG	3	6	2670470	2670475	0 %	0 %	50 %	50 %	344200757
48056	NC_015942	GCC	2	6	2670616	2670621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200758
48057	NC_015942	GC	3	6	2670633	2670638	0 %	0 %	50 %	50 %	344200758
48058	NC_015942	CCG	2	6	2670689	2670694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200758
48059	NC_015942	TAC	2	6	2670737	2670742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200758
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48062	NC_015942	CTAA	2	8	2671145	2671152	50 %	25 %	0 %	25 %	344200759
48063	NC_015942	CAG	2	6	2671154	2671159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200759
48064	NC_015942	CAA	2	6	2671184	2671189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200759
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48099	NC_015942	GGTCCC	2	12	2673361	2673372	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	344200762
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48101	NC_015942	T	6	6	2673414	2673419	0 %	100 %	0 %	0 %	344200762
48102	NC_015942	CCG	2	6	2673431	2673436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200762
48103	NC_015942	CTTT	2	8	2673599	2673606	0 %	75 %	0 %	25 %	344200762
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48107	NC_015942	ACG	2	6	2674133	2674138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200764
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48109	NC_015942	TCT	2	6	2674404	2674409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200765
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48116	NC_015942	TAA	2	6	2674769	2674774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200766
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48132	NC_015942	AGT	2	6	2675434	2675439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200767
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48229	NC_015942	TTG	2	6	2681797	2681802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200781
48230	NC_015942	TACCA	2	10	2681814	2681823	40 %	20 %	0 %	40 %	344200781
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48233	NC_015942	CT	3	6	2681902	2681907	0 %	50 %	0 %	50 %	344200782
48234	NC_015942	CGA	2	6	2681909	2681914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200782
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48236	NC_015942	CGA	2	6	2682017	2682022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200782
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48341	NC_015942	GCA	2	6	2687474	2687479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200790
48342	NC_015942	TTCT	2	8	2687493	2687500	0 %	75 %	0 %	25 %	344200790
48343	NC_015942	CAG	2	6	2687531	2687536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200790
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48495	NC_015942	CG	3	6	2695664	2695669	0 %	0 %	50 %	50 %	344200794
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