MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_015942	GAA	2	6	2464059	2464064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200560
44502	NC_015942	GCA	2	6	2464108	2464113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200560
44503	NC_015942	CGA	2	6	2464132	2464137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200560
44504	NC_015942	TCCA	2	8	2464166	2464173	25 %	25 %	0 %	50 %	344200560
44505	NC_015942	GC	4	8	2464237	2464244	0 %	0 %	50 %	50 %	344200560
44506	NC_015942	GCCG	2	8	2464262	2464269	0 %	0 %	50 %	50 %	344200560
44507	NC_015942	AC	3	6	2464334	2464339	50 %	0 %	0 %	50 %	344200560
44508	NC_015942	TGGG	2	8	2464356	2464363	0 %	25 %	75 %	0 %	344200560
44509	NC_015942	CCG	2	6	2464383	2464388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200560
44510	NC_015942	GAC	2	6	2464393	2464398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200560
44511	NC_015942	TCG	2	6	2464566	2464571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200560
44512	NC_015942	GC	3	6	2464575	2464580	0 %	0 %	50 %	50 %	344200560
44513	NC_015942	TCA	2	6	2464605	2464610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200560
44514	NC_015942	ACG	2	6	2464715	2464720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200561
44515	NC_015942	TGG	2	6	2464753	2464758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200561
44516	NC_015942	TCA	2	6	2464764	2464769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200561
44517	NC_015942	CTT	2	6	2464783	2464788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200561
44518	NC_015942	AAC	2	6	2464804	2464809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200561
44519	NC_015942	AAG	2	6	2464810	2464815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200561
44520	NC_015942	GACG	2	8	2464938	2464945	25 %	0 %	50 %	25 %	344200561
44521	NC_015942	CG	3	6	2464944	2464949	0 %	0 %	50 %	50 %	344200561
44522	NC_015942	AGC	2	6	2464979	2464984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200561
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44526	NC_015942	GCC	2	6	2465098	2465103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200561
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44528	NC_015942	CAC	2	6	2465171	2465176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200561
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44532	NC_015942	CATC	2	8	2465278	2465285	25 %	25 %	0 %	50 %	344200561
44533	NC_015942	TCC	2	6	2465307	2465312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200561
44534	NC_015942	CCT	2	6	2465442	2465447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200561
44535	NC_015942	AAG	2	6	2465450	2465455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200561
44536	NC_015942	CCA	2	6	2465488	2465493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200561
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44538	NC_015942	CCGCA	2	10	2465516	2465525	20 %	0 %	20 %	60 %	344200561
44539	NC_015942	ATC	2	6	2465526	2465531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200561
44540	NC_015942	TTC	2	6	2465610	2465615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200561
44541	NC_015942	ATG	2	6	2465642	2465647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200561
44542	NC_015942	ACC	2	6	2465704	2465709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200561
44543	NC_015942	TCC	2	6	2465751	2465756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200561
44544	NC_015942	CAG	2	6	2465882	2465887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200562
44545	NC_015942	CGT	2	6	2465902	2465907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200562
44546	NC_015942	CCA	2	6	2465925	2465930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200562
44547	NC_015942	CTT	2	6	2466139	2466144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200562
44548	NC_015942	AGG	2	6	2466207	2466212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200562
44549	NC_015942	CAT	2	6	2466234	2466239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200562
44550	NC_015942	CAG	2	6	2466277	2466282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200562
44551	NC_015942	CAT	2	6	2466316	2466321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200562
44552	NC_015942	ATT	2	6	2466373	2466378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200563
44553	NC_015942	A	7	7	2466379	2466385	100 %	0 %	0 %	0 %	344200563
44554	NC_015942	TCA	2	6	2466450	2466455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200563
44555	NC_015942	GCCA	2	8	2466563	2466570	25 %	0 %	25 %	50 %	344200563
44556	NC_015942	GA	3	6	2466576	2466581	50 %	0 %	50 %	0 %	344200563
44557	NC_015942	A	6	6	2466628	2466633	100 %	0 %	0 %	0 %	344200563
44558	NC_015942	ACA	2	6	2466658	2466663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200563
44559	NC_015942	TCA	2	6	2466718	2466723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200563
44560	NC_015942	TCC	2	6	2466750	2466755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200563
44561	NC_015942	ATC	2	6	2466796	2466801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200564
44562	NC_015942	GCA	2	6	2466833	2466838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200564
44563	NC_015942	GAC	2	6	2467044	2467049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200564
44564	NC_015942	AT	3	6	2467104	2467109	50 %	50 %	0 %	0 %	344200564
44565	NC_015942	ATA	2	6	2467286	2467291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200565
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44567	NC_015942	GC	3	6	2467348	2467353	0 %	0 %	50 %	50 %	344200565
44568	NC_015942	AGAC	2	8	2467354	2467361	50 %	0 %	25 %	25 %	344200565
44569	NC_015942	AGC	2	6	2467376	2467381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200565
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44571	NC_015942	GGA	2	6	2467518	2467523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200565
44572	NC_015942	ATCCGA	2	12	2467549	2467560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344200565
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44577	NC_015942	GTA	2	6	2467729	2467734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200565
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44585	NC_015942	CCG	2	6	2468144	2468149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200565
44586	NC_015942	ATA	2	6	2468173	2468178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200565
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44590	NC_015942	CATT	2	8	2468281	2468288	25 %	50 %	0 %	25 %	344200566
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44597	NC_015942	CCG	2	6	2468736	2468741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200566
44598	NC_015942	GAT	2	6	2468753	2468758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200566
44599	NC_015942	CCA	3	9	2468839	2468847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200566
44600	NC_015942	TGC	2	6	2468856	2468861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200566
44601	NC_015942	GATC	2	8	2468875	2468882	25 %	25 %	25 %	25 %	344200566
44602	NC_015942	AATG	2	8	2468931	2468938	50 %	25 %	25 %	0 %	344200567
44603	NC_015942	ACC	2	6	2468959	2468964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200567
44604	NC_015942	GCC	2	6	2469025	2469030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200567
44605	NC_015942	GC	3	6	2469062	2469067	0 %	0 %	50 %	50 %	344200567
44606	NC_015942	GAT	2	6	2469094	2469099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200567
44607	NC_015942	TCAG	2	8	2469206	2469213	25 %	25 %	25 %	25 %	344200567
44608	NC_015942	CGC	2	6	2469219	2469224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200567
44609	NC_015942	TCA	2	6	2469282	2469287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200567
44610	NC_015942	CAT	2	6	2469388	2469393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200567
44611	NC_015942	CACC	2	8	2469441	2469448	25 %	0 %	0 %	75 %	344200567
44612	NC_015942	CTC	2	6	2469463	2469468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200567
44613	NC_015942	GCT	2	6	2469543	2469548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200567
44614	NC_015942	GAA	2	6	2469558	2469563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200567
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44616	NC_015942	ACT	2	6	2469595	2469600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200567
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44842	NC_015942	CTG	2	6	2481505	2481510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200580
44843	NC_015942	CGG	2	6	2481530	2481535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200580
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44846	NC_015942	GCC	2	6	2481589	2481594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200580
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44849	NC_015942	ACAT	2	8	2481677	2481684	50 %	25 %	0 %	25 %	344200580
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44852	NC_015942	CAT	2	6	2481978	2481983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200580
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44857	NC_015942	GC	3	6	2482140	2482145	0 %	0 %	50 %	50 %	344200580
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44954	NC_015942	A	7	7	2488750	2488756	100 %	0 %	0 %	0 %	344200586
44955	NC_015942	GTC	2	6	2488758	2488763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200586
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