MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_015942	GCG	2	6	2411128	2411133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200503
43502	NC_015942	CAG	2	6	2411141	2411146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200503
43503	NC_015942	GAA	2	6	2411213	2411218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200503
43504	NC_015942	C	7	7	2411234	2411240	0 %	0 %	0 %	100 %	344200503
43505	NC_015942	AAT	2	6	2411317	2411322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200504
43506	NC_015942	AC	3	6	2411326	2411331	50 %	0 %	0 %	50 %	344200504
43507	NC_015942	ATG	2	6	2411364	2411369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200504
43508	NC_015942	CCA	2	6	2411486	2411491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200504
43509	NC_015942	CA	3	6	2411543	2411548	50 %	0 %	0 %	50 %	344200504
43510	NC_015942	GCG	2	6	2411617	2411622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200504
43511	NC_015942	GCA	2	6	2411626	2411631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200504
43512	NC_015942	CAT	2	6	2411633	2411638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200504
43513	NC_015942	CGC	2	6	2411639	2411644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200504
43514	NC_015942	CGCT	2	8	2411705	2411712	0 %	25 %	25 %	50 %	344200504
43515	NC_015942	CGA	2	6	2411723	2411728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200504
43516	NC_015942	AT	3	6	2411768	2411773	50 %	50 %	0 %	0 %	344200504
43517	NC_015942	CCG	2	6	2411834	2411839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200504
43518	NC_015942	TAA	2	6	2411878	2411883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200504
43519	NC_015942	CAG	2	6	2411892	2411897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200504
43520	NC_015942	GCC	2	6	2411923	2411928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200504
43521	NC_015942	ACG	2	6	2412007	2412012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200504
43522	NC_015942	GTGC	2	8	2412083	2412090	0 %	25 %	50 %	25 %	344200504
43523	NC_015942	CCA	2	6	2412113	2412118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200504
43524	NC_015942	CCGC	2	8	2412152	2412159	0 %	0 %	25 %	75 %	344200504
43525	NC_015942	CAG	2	6	2412573	2412578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200505
43526	NC_015942	AGCC	2	8	2412603	2412610	25 %	0 %	25 %	50 %	344200505
43527	NC_015942	CCA	2	6	2412613	2412618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200505
43528	NC_015942	GCCA	2	8	2412619	2412626	25 %	0 %	25 %	50 %	344200505
43529	NC_015942	CCAG	2	8	2412636	2412643	25 %	0 %	25 %	50 %	344200505
43530	NC_015942	GCCA	2	8	2412679	2412686	25 %	0 %	25 %	50 %	344200505
43531	NC_015942	AG	3	6	2412707	2412712	50 %	0 %	50 %	0 %	344200505
43532	NC_015942	CCCA	2	8	2412732	2412739	25 %	0 %	0 %	75 %	344200505
43533	NC_015942	CAGC	2	8	2412740	2412747	25 %	0 %	25 %	50 %	344200505
43534	NC_015942	CAG	2	6	2412786	2412791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200505
43535	NC_015942	AAG	2	6	2412852	2412857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200505
43536	NC_015942	CCA	2	6	2412875	2412880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200505
43537	NC_015942	CTT	2	6	2412891	2412896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200505
43538	NC_015942	CCAT	2	8	2413016	2413023	25 %	25 %	0 %	50 %	344200505
43539	NC_015942	CAG	2	6	2413035	2413040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200505
43540	NC_015942	GCGCCA	2	12	2413051	2413062	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	344200505
43541	NC_015942	GCA	2	6	2413064	2413069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200505
43542	NC_015942	TCA	2	6	2413130	2413135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200505
43543	NC_015942	CG	3	6	2413248	2413253	0 %	0 %	50 %	50 %	344200506
43544	NC_015942	ATT	2	6	2413258	2413263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200506
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43547	NC_015942	CAT	2	6	2413401	2413406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200506
43548	NC_015942	GC	3	6	2413414	2413419	0 %	0 %	50 %	50 %	344200506
43549	NC_015942	GTT	2	6	2413452	2413457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200506
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43551	NC_015942	TGC	2	6	2413538	2413543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200506
43552	NC_015942	GCA	2	6	2413547	2413552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200506
43553	NC_015942	TCC	2	6	2413562	2413567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200506
43554	NC_015942	CGG	2	6	2413569	2413574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200506
43555	NC_015942	CCG	2	6	2413608	2413613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200506
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43558	NC_015942	GCCA	2	8	2413724	2413731	25 %	0 %	25 %	50 %	344200506
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43562	NC_015942	GC	3	6	2413864	2413869	0 %	0 %	50 %	50 %	344200506
43563	NC_015942	TGC	2	6	2413926	2413931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200506
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43566	NC_015942	G	6	6	2414082	2414087	0 %	0 %	100 %	0 %	344200506
43567	NC_015942	GCA	2	6	2414202	2414207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200506
43568	NC_015942	CGG	2	6	2414214	2414219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200506
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43571	NC_015942	CCCA	2	8	2414461	2414468	25 %	0 %	0 %	75 %	344200506
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43575	NC_015942	GCCA	2	8	2414590	2414597	25 %	0 %	25 %	50 %	344200507
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43578	NC_015942	AT	3	6	2414854	2414859	50 %	50 %	0 %	0 %	344200507
43579	NC_015942	TGG	2	6	2414966	2414971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200507
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43584	NC_015942	ACC	2	6	2415120	2415125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200508
43585	NC_015942	GCC	2	6	2415164	2415169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200508
43586	NC_015942	AAT	2	6	2415222	2415227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200508
43587	NC_015942	CCG	2	6	2415308	2415313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200508
43588	NC_015942	T	6	6	2415401	2415406	0 %	100 %	0 %	0 %	344200509
43589	NC_015942	GGCT	2	8	2415409	2415416	0 %	25 %	50 %	25 %	344200509
43590	NC_015942	ATG	2	6	2415461	2415466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200509
43591	NC_015942	CAGC	2	8	2415508	2415515	25 %	0 %	25 %	50 %	344200509
43592	NC_015942	CACT	2	8	2415552	2415559	25 %	25 %	0 %	50 %	344200509
43593	NC_015942	ACTGC	2	10	2415604	2415613	20 %	20 %	20 %	40 %	344200509
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43597	NC_015942	CAG	2	6	2415791	2415796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200510
43598	NC_015942	GCA	2	6	2415835	2415840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200510
43599	NC_015942	TCAC	2	8	2415879	2415886	25 %	25 %	0 %	50 %	344200510
43600	NC_015942	A	6	6	2415932	2415937	100 %	0 %	0 %	0 %	344200510
43601	NC_015942	CAG	2	6	2416052	2416057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200511
43602	NC_015942	GCC	2	6	2416097	2416102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200511
43603	NC_015942	ATG	2	6	2416122	2416127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200511
43604	NC_015942	ATG	2	6	2416140	2416145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200511
43605	NC_015942	CGCAC	2	10	2416176	2416185	20 %	0 %	20 %	60 %	344200511
43606	NC_015942	AG	3	6	2416209	2416214	50 %	0 %	50 %	0 %	344200511
43607	NC_015942	CAC	2	6	2416268	2416273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200511
43608	NC_015942	CGCC	2	8	2416276	2416283	0 %	0 %	25 %	75 %	344200511
43609	NC_015942	CCA	2	6	2416417	2416422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200511
43610	NC_015942	AAT	2	6	2416448	2416453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200511
43611	NC_015942	AGC	2	6	2416457	2416462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200511
43612	NC_015942	ATC	2	6	2416532	2416537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200511
43613	NC_015942	ACA	2	6	2416621	2416626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200511
43614	NC_015942	GTC	2	6	2416713	2416718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200511
43615	NC_015942	GCC	2	6	2416753	2416758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200511
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43617	NC_015942	CAGC	2	8	2416870	2416877	25 %	0 %	25 %	50 %	344200511
43618	NC_015942	GCA	2	6	2416963	2416968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200511
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43724	NC_015942	GTA	2	6	2423215	2423220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200516
43725	NC_015942	CG	3	6	2423297	2423302	0 %	0 %	50 %	50 %	344200516
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43730	NC_015942	GCCA	2	8	2423516	2423523	25 %	0 %	25 %	50 %	344200516
43731	NC_015942	CGC	2	6	2423582	2423587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200516
43732	NC_015942	CAG	2	6	2423648	2423653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200516
43733	NC_015942	AGC	2	6	2423668	2423673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200516
43734	NC_015942	CCG	2	6	2423682	2423687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200516
43735	NC_015942	GGCG	2	8	2423714	2423721	0 %	0 %	75 %	25 %	344200516
43736	NC_015942	GTC	2	6	2423729	2423734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200516
43737	NC_015942	GGGT	2	8	2423797	2423804	0 %	25 %	75 %	0 %	344200516
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43739	NC_015942	GCGA	2	8	2423852	2423859	25 %	0 %	50 %	25 %	344200516
43740	NC_015942	C	6	6	2423864	2423869	0 %	0 %	0 %	100 %	344200516
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43744	NC_015942	CG	3	6	2424187	2424192	0 %	0 %	50 %	50 %	344200517
43745	NC_015942	CTG	2	6	2424358	2424363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200517
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43760	NC_015942	AAT	2	6	2424927	2424932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200517
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43763	NC_015942	TCA	2	6	2425110	2425115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200518
43764	NC_015942	T	7	7	2425149	2425155	0 %	100 %	0 %	0 %	344200518
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43768	NC_015942	GTA	2	6	2425279	2425284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200518
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43771	NC_015942	AAT	2	6	2425568	2425573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200519
43772	NC_015942	CCCG	2	8	2425627	2425634	0 %	0 %	25 %	75 %	344200519
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43793	NC_015942	GCGG	2	8	2426709	2426716	0 %	0 %	75 %	25 %	344200520
43794	NC_015942	CTCG	2	8	2426730	2426737	0 %	25 %	25 %	50 %	344200520
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43801	NC_015942	TGC	2	6	2427294	2427299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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43804	NC_015942	CTG	2	6	2427485	2427490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200521
43805	NC_015942	ATG	2	6	2427540	2427545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200521
43806	NC_015942	CAG	2	6	2427581	2427586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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43809	NC_015942	GGC	2	6	2427689	2427694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200521
43810	NC_015942	GCCAT	2	10	2427750	2427759	20 %	20 %	20 %	40 %	344200521
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43814	NC_015942	CTG	2	6	2428136	2428141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200521
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43819	NC_015942	CTGG	2	8	2428358	2428365	0 %	25 %	50 %	25 %	344200521
43820	NC_015942	TCA	2	6	2428444	2428449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200522
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43824	NC_015942	GCT	2	6	2428631	2428636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
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43829	NC_015942	CTG	2	6	2428887	2428892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
43830	NC_015942	GCC	2	6	2428906	2428911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200522
43831	NC_015942	TGC	2	6	2429056	2429061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
43832	NC_015942	GAT	2	6	2429070	2429075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200522
43833	NC_015942	GAT	2	6	2429148	2429153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200522
43834	NC_015942	GAC	2	6	2429218	2429223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200522
43835	NC_015942	CAG	2	6	2429252	2429257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200522
43836	NC_015942	GCC	2	6	2429412	2429417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200522
43837	NC_015942	TGC	2	6	2429419	2429424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200522
43838	NC_015942	GCG	2	6	2429441	2429446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200522
43839	NC_015942	TC	3	6	2429560	2429565	0 %	50 %	0 %	50 %	344200522
43840	NC_015942	CGC	3	9	2429644	2429652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200523
43841	NC_015942	GC	4	8	2429708	2429715	0 %	0 %	50 %	50 %	344200523
43842	NC_015942	GCA	2	6	2429773	2429778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200523
43843	NC_015942	GGC	2	6	2429929	2429934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
43844	NC_015942	CGT	2	6	2429983	2429988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
43845	NC_015942	CGG	2	6	2430003	2430008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
43846	NC_015942	CGGCG	2	10	2430066	2430075	0 %	0 %	60 %	40 %	344200524
43847	NC_015942	GTC	2	6	2430080	2430085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
43848	NC_015942	CCG	2	6	2430096	2430101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200524
43849	NC_015942	AAG	2	6	2430111	2430116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200524
43850	NC_015942	GCC	2	6	2430155	2430160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200524
43851	NC_015942	CTGC	2	8	2430170	2430177	0 %	25 %	25 %	50 %	344200524
43852	NC_015942	GAT	2	6	2430199	2430204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200524
43853	NC_015942	TCA	2	6	2430520	2430525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200524
43854	NC_015942	GGC	2	6	2430568	2430573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
43855	NC_015942	CTG	2	6	2430587	2430592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
43856	NC_015942	C	7	7	2430593	2430599	0 %	0 %	0 %	100 %	344200524
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43861	NC_015942	CAC	2	6	2430770	2430775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200524
43862	NC_015942	GCG	2	6	2430872	2430877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
43863	NC_015942	CGG	2	6	2430878	2430883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200524
43864	NC_015942	TCCCTG	2	12	2430925	2430936	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	344200524
43865	NC_015942	GCA	2	6	2430955	2430960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
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43867	NC_015942	GCA	2	6	2431082	2431087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
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43870	NC_015942	TGC	2	6	2431284	2431289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200524
43871	NC_015942	GCA	2	6	2431299	2431304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200524
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43874	NC_015942	CCTG	2	8	2431709	2431716	0 %	25 %	25 %	50 %	344200525
43875	NC_015942	GAT	2	6	2431740	2431745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200525
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43884	NC_015942	TCT	2	6	2432294	2432299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200525
43885	NC_015942	CCA	2	6	2432482	2432487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200525
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43888	NC_015942	A	8	8	2432578	2432585	100 %	0 %	0 %	0 %	344200525
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43908	NC_015942	AGGCG	2	10	2433709	2433718	20 %	0 %	60 %	20 %	344200527
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43925	NC_015942	GCG	2	6	2434629	2434634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200527
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43934	NC_015942	CGT	2	6	2435129	2435134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200527
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43940	NC_015942	GACAAG	2	12	2435280	2435291	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	344200528
43941	NC_015942	ATA	2	6	2435324	2435329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200528
43942	NC_015942	AGA	2	6	2435448	2435453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200528
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43946	NC_015942	AC	3	6	2435563	2435568	50 %	0 %	0 %	50 %	344200528
43947	NC_015942	CGT	2	6	2435572	2435577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200528
43948	NC_015942	CAT	2	6	2435593	2435598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200528
43949	NC_015942	TGCA	2	8	2435607	2435614	25 %	25 %	25 %	25 %	344200528
43950	NC_015942	CTC	2	6	2435722	2435727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200529
43951	NC_015942	GC	3	6	2435797	2435802	0 %	0 %	50 %	50 %	344200529
43952	NC_015942	CAC	2	6	2435915	2435920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200529
43953	NC_015942	GC	3	6	2436034	2436039	0 %	0 %	50 %	50 %	344200529
43954	NC_015942	GCC	2	6	2436047	2436052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200529
43955	NC_015942	ACC	2	6	2436175	2436180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200529
43956	NC_015942	CGC	2	6	2436189	2436194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200529
43957	NC_015942	GCA	2	6	2436258	2436263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200529
43958	NC_015942	ACTG	2	8	2436267	2436274	25 %	25 %	25 %	25 %	344200529
43959	NC_015942	GCC	2	6	2436284	2436289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200529
43960	NC_015942	TCC	2	6	2436302	2436307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200529
43961	NC_015942	GC	3	6	2436373	2436378	0 %	0 %	50 %	50 %	344200529
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