MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_015942	GCC	2	6	2383565	2383570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200479
43003	NC_015942	CAT	2	6	2383580	2383585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200479
43004	NC_015942	TGG	2	6	2383617	2383622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200479
43005	NC_015942	GC	3	6	2383641	2383646	0 %	0 %	50 %	50 %	344200479
43006	NC_015942	CAGG	2	8	2383793	2383800	25 %	0 %	50 %	25 %	344200479
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43008	NC_015942	CGT	2	6	2383824	2383829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200479
43009	NC_015942	AG	3	6	2383845	2383850	50 %	0 %	50 %	0 %	344200479
43010	NC_015942	TAA	2	6	2383909	2383914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200479
43011	NC_015942	T	6	6	2383949	2383954	0 %	100 %	0 %	0 %	344200479
43012	NC_015942	TGA	2	6	2383957	2383962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200479
43013	NC_015942	CAG	2	6	2383969	2383974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200479
43014	NC_015942	TTC	2	6	2383996	2384001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200479
43015	NC_015942	CCA	2	6	2384116	2384121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200480
43016	NC_015942	CTG	2	6	2384232	2384237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200480
43017	NC_015942	CAG	2	6	2384243	2384248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200480
43018	NC_015942	GCC	2	6	2384278	2384283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200480
43019	NC_015942	GAT	2	6	2384327	2384332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200480
43020	NC_015942	TGC	2	6	2384354	2384359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200480
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43022	NC_015942	CGGC	2	8	2384405	2384412	0 %	0 %	50 %	50 %	344200480
43023	NC_015942	GCTGG	2	10	2384453	2384462	0 %	20 %	60 %	20 %	344200480
43024	NC_015942	GCT	2	6	2384543	2384548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200480
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43031	NC_015942	TGC	2	6	2384797	2384802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200480
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43062	NC_015942	CCCG	2	8	2386124	2386131	0 %	0 %	25 %	75 %	344200480
43063	NC_015942	CAG	2	6	2386164	2386169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200480
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43065	NC_015942	CGG	2	6	2386211	2386216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200480
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43076	NC_015942	TCA	2	6	2386867	2386872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200481
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43085	NC_015942	CATC	2	8	2387513	2387520	25 %	25 %	0 %	50 %	344200483
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43097	NC_015942	CT	3	6	2387927	2387932	0 %	50 %	0 %	50 %	344200483
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43101	NC_015942	T	7	7	2388291	2388297	0 %	100 %	0 %	0 %	344200484
43102	NC_015942	CAG	3	9	2388436	2388444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200484
43103	NC_015942	ATA	2	6	2388470	2388475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200484
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43106	NC_015942	CAGC	2	8	2388502	2388509	25 %	0 %	25 %	50 %	344200484
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43110	NC_015942	CA	3	6	2388602	2388607	50 %	0 %	0 %	50 %	344200484
43111	NC_015942	GGC	2	6	2388650	2388655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200484
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43113	NC_015942	ACC	2	6	2388738	2388743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200484
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43116	NC_015942	GC	3	6	2388880	2388885	0 %	0 %	50 %	50 %	344200485
43117	NC_015942	TCA	2	6	2388972	2388977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200485
43118	NC_015942	ATCGAG	2	12	2389018	2389029	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	344200485
43119	NC_015942	GCC	2	6	2389064	2389069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200485
43120	NC_015942	CGCA	2	8	2389108	2389115	25 %	0 %	25 %	50 %	344200485
43121	NC_015942	GC	3	6	2389247	2389252	0 %	0 %	50 %	50 %	344200485
43122	NC_015942	CG	3	6	2389319	2389324	0 %	0 %	50 %	50 %	344200485
43123	NC_015942	CACC	2	8	2389369	2389376	25 %	0 %	0 %	75 %	344200485
43124	NC_015942	AGGA	2	8	2389394	2389401	50 %	0 %	50 %	0 %	344200485
43125	NC_015942	TTC	2	6	2389411	2389416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200485
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43129	NC_015942	TTC	2	6	2389843	2389848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200486
43130	NC_015942	CAC	2	6	2389876	2389881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200486
43131	NC_015942	CCG	2	6	2389883	2389888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200486
43132	NC_015942	CGA	2	6	2389893	2389898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200486
43133	NC_015942	GA	3	6	2389937	2389942	50 %	0 %	50 %	0 %	344200486
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43136	NC_015942	ATA	2	6	2390210	2390215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200487
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43141	NC_015942	CCA	2	6	2390343	2390348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200487
43142	NC_015942	CAC	2	6	2390514	2390519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200487
43143	NC_015942	GC	3	6	2390533	2390538	0 %	0 %	50 %	50 %	344200487
43144	NC_015942	CCA	2	6	2390547	2390552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200487
43145	NC_015942	CCGGC	2	10	2390556	2390565	0 %	0 %	40 %	60 %	344200487
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43221	NC_015942	CTG	2	6	2395029	2395034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200492
43222	NC_015942	A	6	6	2395139	2395144	100 %	0 %	0 %	0 %	344200492
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43225	NC_015942	ATA	2	6	2395243	2395248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200492
43226	NC_015942	GGT	2	6	2395249	2395254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200492
43227	NC_015942	CCA	2	6	2395320	2395325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200492
43228	NC_015942	GCA	2	6	2395343	2395348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200492
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43231	NC_015942	TCA	2	6	2395521	2395526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200492
43232	NC_015942	T	6	6	2395565	2395570	0 %	100 %	0 %	0 %	344200492
43233	NC_015942	ATG	2	6	2395577	2395582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200492
43234	NC_015942	TCA	2	6	2395599	2395604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200492
43235	NC_015942	TGGG	2	8	2395626	2395633	0 %	25 %	75 %	0 %	344200492
43236	NC_015942	GCG	2	6	2395652	2395657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200492
43237	NC_015942	CG	3	6	2395656	2395661	0 %	0 %	50 %	50 %	344200492
43238	NC_015942	GC	3	6	2395662	2395667	0 %	0 %	50 %	50 %	344200492
43239	NC_015942	CCA	2	6	2395708	2395713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200492
43240	NC_015942	G	6	6	2396018	2396023	0 %	0 %	100 %	0 %	344200493
43241	NC_015942	CG	3	6	2396048	2396053	0 %	0 %	50 %	50 %	344200493
43242	NC_015942	TTGGCT	2	12	2396058	2396069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	344200493
43243	NC_015942	AAG	2	6	2396115	2396120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200493
43244	NC_015942	CTG	3	9	2396135	2396143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
43245	NC_015942	TGC	2	6	2396160	2396165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
43246	NC_015942	GCTG	2	8	2396208	2396215	0 %	25 %	50 %	25 %	344200493
43247	NC_015942	GGC	2	6	2396420	2396425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200493
43248	NC_015942	CTG	2	6	2396552	2396557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
43249	NC_015942	CTG	2	6	2396585	2396590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
43250	NC_015942	TGC	2	6	2396601	2396606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
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43252	NC_015942	GGT	2	6	2396686	2396691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200493
43253	NC_015942	TCT	2	6	2396704	2396709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200493
43254	NC_015942	GCA	2	6	2396758	2396763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200494
43255	NC_015942	CGT	2	6	2396803	2396808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200494
43256	NC_015942	CTG	2	6	2396868	2396873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200494
43257	NC_015942	TGC	2	6	2396895	2396900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200494
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43259	NC_015942	TGGT	2	8	2396926	2396933	0 %	50 %	50 %	0 %	344200494
43260	NC_015942	GGC	2	6	2396958	2396963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200494
43261	NC_015942	TGAG	2	8	2396964	2396971	25 %	25 %	50 %	0 %	344200494
43262	NC_015942	CA	3	6	2397042	2397047	50 %	0 %	0 %	50 %	344200494
43263	NC_015942	A	6	6	2397177	2397182	100 %	0 %	0 %	0 %	344200494
43264	NC_015942	CGC	2	6	2397277	2397282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200494
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43269	NC_015942	CGA	2	6	2397553	2397558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200494
43270	NC_015942	TGC	2	6	2397567	2397572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200494
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43275	NC_015942	TGA	2	6	2398541	2398546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200495
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43286	NC_015942	CTT	2	6	2399158	2399163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200496
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43290	NC_015942	GCTG	2	8	2400029	2400036	0 %	25 %	50 %	25 %	344200497
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43297	NC_015942	TGA	2	6	2400467	2400472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200498
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43300	NC_015942	TCG	2	6	2400731	2400736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43301	NC_015942	GCA	2	6	2400756	2400761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43302	NC_015942	CTG	2	6	2400774	2400779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43303	NC_015942	ACC	2	6	2400810	2400815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200498
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43305	NC_015942	CCG	2	6	2400878	2400883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200498
43306	NC_015942	ATG	2	6	2401002	2401007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200498
43307	NC_015942	TAC	2	6	2401035	2401040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200498
43308	NC_015942	TCG	2	6	2401048	2401053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43309	NC_015942	CGA	2	6	2401055	2401060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200498
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43312	NC_015942	CTA	3	9	2401202	2401210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200498
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43320	NC_015942	GAT	2	6	2401751	2401756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200498
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43322	NC_015942	ATC	2	6	2401818	2401823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200498
43323	NC_015942	GCT	3	9	2401931	2401939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200498
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43327	NC_015942	GCA	2	6	2402057	2402062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43328	NC_015942	GCCAA	2	10	2402072	2402081	40 %	0 %	20 %	40 %	344200498
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43330	NC_015942	ACA	2	6	2402266	2402271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200498
43331	NC_015942	GC	3	6	2402300	2402305	0 %	0 %	50 %	50 %	344200498
43332	NC_015942	CTG	2	6	2402317	2402322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43333	NC_015942	GGCT	2	8	2402350	2402357	0 %	25 %	50 %	25 %	344200498
43334	NC_015942	ATC	2	6	2402460	2402465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200498
43335	NC_015942	GGC	2	6	2402574	2402579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200498
43336	NC_015942	ACG	2	6	2402587	2402592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200498
43337	NC_015942	TTTG	2	8	2402633	2402640	0 %	75 %	25 %	0 %	344200498
43338	NC_015942	CGC	2	6	2402678	2402683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200498
43339	NC_015942	CGC	2	6	2402777	2402782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200498
43340	NC_015942	GC	3	6	2402795	2402800	0 %	0 %	50 %	50 %	344200498
43341	NC_015942	CAAC	2	8	2402801	2402808	50 %	0 %	0 %	50 %	344200498
43342	NC_015942	T	6	6	2402813	2402818	0 %	100 %	0 %	0 %	344200498
43343	NC_015942	CG	3	6	2402862	2402867	0 %	0 %	50 %	50 %	344200498
43344	NC_015942	GCC	2	6	2402879	2402884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200498
43345	NC_015942	GAA	2	6	2402934	2402939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200498
43346	NC_015942	GTT	2	6	2402960	2402965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200498
43347	NC_015942	GCC	2	6	2402973	2402978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200498
43348	NC_015942	ACC	2	6	2403185	2403190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200499
43349	NC_015942	GGCG	2	8	2403287	2403294	0 %	0 %	75 %	25 %	344200499
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43463	NC_015942	AAC	2	6	2408926	2408931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200502
43464	NC_015942	GC	3	6	2408945	2408950	0 %	0 %	50 %	50 %	344200502
43465	NC_015942	CAG	2	6	2408982	2408987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200502
43466	NC_015942	TGC	2	6	2409031	2409036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200502
43467	NC_015942	ACC	2	6	2409037	2409042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200502
43468	NC_015942	CAG	2	6	2409084	2409089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200502
43469	NC_015942	ACC	2	6	2409154	2409159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200502
43470	NC_015942	GCA	2	6	2409308	2409313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200502
43471	NC_015942	GGCG	2	8	2409314	2409321	0 %	0 %	75 %	25 %	344200502
43472	NC_015942	GA	3	6	2409340	2409345	50 %	0 %	50 %	0 %	344200502
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43474	NC_015942	A	6	6	2409492	2409497	100 %	0 %	0 %	0 %	344200502
43475	NC_015942	ACA	2	6	2409620	2409625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200502
43476	NC_015942	CCG	2	6	2409629	2409634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200502
43477	NC_015942	TGCGC	2	10	2409671	2409680	0 %	20 %	40 %	40 %	344200502
43478	NC_015942	ATC	2	6	2409751	2409756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200502
43479	NC_015942	ATCC	2	8	2409807	2409814	25 %	25 %	0 %	50 %	344200502
43480	NC_015942	CCA	2	6	2409866	2409871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200502
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43482	NC_015942	CGT	2	6	2409953	2409958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200502
43483	NC_015942	GCC	2	6	2410003	2410008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200502
43484	NC_015942	CGG	2	6	2410034	2410039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200502
43485	NC_015942	GTC	2	6	2410251	2410256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200503
43486	NC_015942	GCA	2	6	2410288	2410293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200503
43487	NC_015942	GCC	2	6	2410376	2410381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200503
43488	NC_015942	ACC	2	6	2410485	2410490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200503
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43490	NC_015942	AGC	2	6	2410617	2410622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200503
43491	NC_015942	GGCA	2	8	2410655	2410662	25 %	0 %	50 %	25 %	344200503
43492	NC_015942	GCC	2	6	2410682	2410687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200503
43493	NC_015942	CTG	2	6	2410712	2410717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200503
43494	NC_015942	GA	3	6	2410864	2410869	50 %	0 %	50 %	0 %	344200503
43495	NC_015942	GCA	2	6	2410996	2411001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200503
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43499	NC_015942	ACC	2	6	2411057	2411062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200503
43500	NC_015942	GC	3	6	2411083	2411088	0 %	0 %	50 %	50 %	344200503

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