MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_015942	AGCC	2	8	1939316	1939323	25 %	0 %	25 %	50 %	344200076
35003	NC_015942	CGG	2	6	1939486	1939491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200076
35004	NC_015942	GCC	2	6	1939552	1939557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200076
35005	NC_015942	CAGA	2	8	1939562	1939569	50 %	0 %	25 %	25 %	344200076
35006	NC_015942	AGG	2	6	1939591	1939596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200076
35007	NC_015942	ATC	2	6	1939601	1939606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200076
35008	NC_015942	CAG	2	6	1939709	1939714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200076
35009	NC_015942	CTG	2	6	1939730	1939735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200076
35010	NC_015942	ACG	2	6	1939860	1939865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200076
35011	NC_015942	CGG	2	6	1939945	1939950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200076
35012	NC_015942	ACC	3	9	1939974	1939982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200076
35013	NC_015942	CAC	2	6	1940063	1940068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200076
35014	NC_015942	GGAT	2	8	1940122	1940129	25 %	25 %	50 %	0 %	344200076
35015	NC_015942	CGGT	2	8	1940193	1940200	0 %	25 %	50 %	25 %	344200076
35016	NC_015942	TCCA	2	8	1940214	1940221	25 %	25 %	0 %	50 %	344200076
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35032	NC_015942	TCG	2	6	1940832	1940837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200076
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35034	NC_015942	GGC	2	6	1940866	1940871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200076
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35042	NC_015942	CTG	2	6	1941200	1941205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200076
35043	NC_015942	GAT	2	6	1941320	1941325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200076
35044	NC_015942	GAT	2	6	1941389	1941394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200076
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35112	NC_015942	T	7	7	1945617	1945623	0 %	100 %	0 %	0 %	344200082
35113	NC_015942	CATAAT	2	12	1945633	1945644	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344200082
35114	NC_015942	TGAT	2	8	1945651	1945658	25 %	50 %	25 %	0 %	344200083
35115	NC_015942	CTTT	2	8	1945697	1945704	0 %	75 %	0 %	25 %	344200083
35116	NC_015942	TCT	2	6	1945757	1945762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200083
35117	NC_015942	GCA	2	6	1945886	1945891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200084
35118	NC_015942	ACC	2	6	1945939	1945944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200084
35119	NC_015942	CGT	2	6	1945945	1945950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200084
35120	NC_015942	T	6	6	1945975	1945980	0 %	100 %	0 %	0 %	344200084
35121	NC_015942	GAA	2	6	1946082	1946087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200084
35122	NC_015942	CCA	2	6	1946093	1946098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200084
35123	NC_015942	TGT	2	6	1946127	1946132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200084
35124	NC_015942	GGT	2	6	1946141	1946146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200084
35125	NC_015942	CTTT	2	8	1946156	1946163	0 %	75 %	0 %	25 %	344200084
35126	NC_015942	TCA	2	6	1946657	1946662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200085
35127	NC_015942	TCC	2	6	1946726	1946731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200085
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35129	NC_015942	TGC	2	6	1946846	1946851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200085
35130	NC_015942	TCA	3	9	1946867	1946875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200085
35131	NC_015942	GTAGCC	2	12	1946888	1946899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344200085
35132	NC_015942	AT	3	6	1947341	1947346	50 %	50 %	0 %	0 %	344200086
35133	NC_015942	TGC	2	6	1947378	1947383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200086
35134	NC_015942	GTG	2	6	1947398	1947403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200086
35135	NC_015942	CGC	2	6	1947459	1947464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200086
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35139	NC_015942	TGT	2	6	1947588	1947593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200086
35140	NC_015942	CAG	2	6	1947666	1947671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200086
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35143	NC_015942	TG	3	6	1947775	1947780	0 %	50 %	50 %	0 %	344200086
35144	NC_015942	TTG	2	6	1947795	1947800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200086
35145	NC_015942	TAT	3	9	1947857	1947865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200086
35146	NC_015942	G	6	6	1947887	1947892	0 %	0 %	100 %	0 %	344200086
35147	NC_015942	G	6	6	1947899	1947904	0 %	0 %	100 %	0 %	344200086
35148	NC_015942	GTA	2	6	1947940	1947945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200086
35149	NC_015942	GCC	2	6	1947990	1947995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200086
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35153	NC_015942	CGC	2	6	1948137	1948142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200086
35154	NC_015942	TTGG	2	8	1948203	1948210	0 %	50 %	50 %	0 %	344200086
35155	NC_015942	C	6	6	1948215	1948220	0 %	0 %	0 %	100 %	344200086
35156	NC_015942	AGGT	2	8	1948228	1948235	25 %	25 %	50 %	0 %	344200086
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35178	NC_015942	CTG	2	6	1949145	1949150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200087
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35199	NC_015942	CAC	2	6	1950156	1950161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200090
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35201	NC_015942	CGA	2	6	1950209	1950214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200090
35202	NC_015942	CAC	2	6	1950225	1950230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200090
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35214	NC_015942	GAC	2	6	1950729	1950734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200090
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35227	NC_015942	CTT	2	6	1951175	1951180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200090
35228	NC_015942	T	6	6	1951296	1951301	0 %	100 %	0 %	0 %	344200090
35229	NC_015942	TC	3	6	1951306	1951311	0 %	50 %	0 %	50 %	344200090
35230	NC_015942	GCG	2	6	1951491	1951496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200091
35231	NC_015942	CAC	2	6	1951537	1951542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200091
35232	NC_015942	GATG	2	8	1951570	1951577	25 %	25 %	50 %	0 %	344200091
35233	NC_015942	AGC	2	6	1952001	1952006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200092
35234	NC_015942	GCC	2	6	1952009	1952014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200092
35235	NC_015942	ACCCC	2	10	1952054	1952063	20 %	0 %	0 %	80 %	344200092
35236	NC_015942	GGAT	2	8	1952071	1952078	25 %	25 %	50 %	0 %	344200092
35237	NC_015942	TGC	2	6	1952151	1952156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200092
35238	NC_015942	ACC	3	9	1952175	1952183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200092
35239	NC_015942	TGA	2	6	1952197	1952202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200092
35240	NC_015942	CTGAT	2	10	1952208	1952217	20 %	40 %	20 %	20 %	344200092
35241	NC_015942	TG	3	6	1952308	1952313	0 %	50 %	50 %	0 %	344200092
35242	NC_015942	CG	3	6	1952329	1952334	0 %	0 %	50 %	50 %	344200092
35243	NC_015942	CTT	2	6	1952339	1952344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200092
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35249	NC_015942	CTG	3	9	1952768	1952776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200092
35250	NC_015942	TCCTGT	2	12	1952958	1952969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	344200092
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35252	NC_015942	TGC	3	9	1953156	1953164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200093
35253	NC_015942	CAC	2	6	1953206	1953211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200093
35254	NC_015942	GTA	2	6	1953265	1953270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200093
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35260	NC_015942	CAC	2	6	1953525	1953530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200094
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35262	NC_015942	TTGAC	2	10	1953782	1953791	20 %	40 %	20 %	20 %	344200094
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35264	NC_015942	TGA	2	6	1953819	1953824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200094
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35319	NC_015942	CTG	2	6	1958414	1958419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200100
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35322	NC_015942	CAG	2	6	1959090	1959095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
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35335	NC_015942	GGCC	2	8	1959688	1959695	0 %	0 %	50 %	50 %	344200101
35336	NC_015942	AGG	2	6	1959771	1959776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200101
35337	NC_015942	CGA	2	6	1959886	1959891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200101
35338	NC_015942	GCGG	2	8	1959948	1959955	0 %	0 %	75 %	25 %	344200101
35339	NC_015942	CAC	2	6	1960010	1960015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200101
35340	NC_015942	GCT	2	6	1960027	1960032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200101
35341	NC_015942	TGC	2	6	1960054	1960059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200101
35342	NC_015942	GAA	2	6	1960145	1960150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200101
35343	NC_015942	TCT	2	6	1960170	1960175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200101
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35345	NC_015942	G	7	7	1960232	1960238	0 %	0 %	100 %	0 %	344200101
35346	NC_015942	CCG	2	6	1960240	1960245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200101
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35348	NC_015942	CTG	2	6	1960453	1960458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
35349	NC_015942	GCC	3	9	1960469	1960477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200102
35350	NC_015942	GCT	2	6	1960508	1960513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
35351	NC_015942	CGT	2	6	1960516	1960521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200102
35352	NC_015942	GA	3	6	1960698	1960703	50 %	0 %	50 %	0 %	344200103
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35459	NC_015942	GTG	2	6	1966551	1966556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200110
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35462	NC_015942	AGGGA	2	10	1966767	1966776	40 %	0 %	60 %	0 %	344200110
35463	NC_015942	TCT	2	6	1966845	1966850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200110
35464	NC_015942	CAC	2	6	1966862	1966867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200110
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35466	NC_015942	TCA	2	6	1966957	1966962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200110
35467	NC_015942	CAT	2	6	1967008	1967013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200110
35468	NC_015942	TTG	2	6	1967076	1967081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200110
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35471	NC_015942	CAG	2	6	1967306	1967311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200110
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35499	NC_015942	CCA	2	6	1968967	1968972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200112
35500	NC_015942	CCG	2	6	1969010	1969015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200112

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