MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_015942	ATG	2	6	1882885	1882890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
34002	NC_015942	CAC	2	6	1883149	1883154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200021
34003	NC_015942	ATGT	2	8	1883192	1883199	25 %	50 %	25 %	0 %	344200021
34004	NC_015942	TGCGGG	2	12	1883329	1883340	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	344200021
34005	NC_015942	GCC	2	6	1883351	1883356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200021
34006	NC_015942	TGA	2	6	1883472	1883477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
34007	NC_015942	CAG	2	6	1883506	1883511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200021
34008	NC_015942	TCA	2	6	1883532	1883537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200021
34009	NC_015942	GAT	2	6	1883557	1883562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200021
34010	NC_015942	TCG	2	6	1883564	1883569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200021
34011	NC_015942	CAA	2	6	1883746	1883751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200021
34012	NC_015942	ACC	2	6	1883759	1883764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200021
34013	NC_015942	GGTA	2	8	1883771	1883778	25 %	25 %	50 %	0 %	344200021
34014	NC_015942	CGC	2	6	1883801	1883806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200021
34015	NC_015942	TTC	2	6	1883810	1883815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200021
34016	NC_015942	T	6	6	1883843	1883848	0 %	100 %	0 %	0 %	344200022
34017	NC_015942	GCT	2	6	1883852	1883857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34018	NC_015942	GCT	2	6	1883886	1883891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34019	NC_015942	GCCC	2	8	1883912	1883919	0 %	0 %	25 %	75 %	344200022
34020	NC_015942	GAAC	2	8	1883928	1883935	50 %	0 %	25 %	25 %	344200022
34021	NC_015942	CTG	2	6	1883961	1883966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34022	NC_015942	CAT	2	6	1884008	1884013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200022
34023	NC_015942	TCT	2	6	1884038	1884043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200022
34024	NC_015942	CCTG	2	8	1884079	1884086	0 %	25 %	25 %	50 %	344200022
34025	NC_015942	GCC	2	6	1884106	1884111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200022
34026	NC_015942	CTGG	2	8	1884114	1884121	0 %	25 %	50 %	25 %	344200022
34027	NC_015942	TGC	2	6	1884131	1884136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34028	NC_015942	CTG	2	6	1884240	1884245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34029	NC_015942	TGC	2	6	1884254	1884259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200022
34030	NC_015942	TGCCC	2	10	1884326	1884335	0 %	20 %	20 %	60 %	344200022
34031	NC_015942	CTGA	2	8	1884372	1884379	25 %	25 %	25 %	25 %	344200022
34032	NC_015942	CCG	2	6	1884452	1884457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200022
34033	NC_015942	TAC	2	6	1884551	1884556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200022
34034	NC_015942	T	6	6	1884657	1884662	0 %	100 %	0 %	0 %	344200022
34035	NC_015942	CCA	3	9	1885004	1885012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
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34038	NC_015942	TGAC	2	8	1885064	1885071	25 %	25 %	25 %	25 %	344200023
34039	NC_015942	GGAT	2	8	1885162	1885169	25 %	25 %	50 %	0 %	344200023
34040	NC_015942	CCA	2	6	1885185	1885190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
34041	NC_015942	GAAA	2	8	1885209	1885216	75 %	0 %	25 %	0 %	344200023
34042	NC_015942	CCA	2	6	1885328	1885333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
34043	NC_015942	ATG	2	6	1885428	1885433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
34044	NC_015942	CAC	2	6	1885458	1885463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
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34046	NC_015942	GTA	2	6	1885570	1885575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
34047	NC_015942	TGA	2	6	1885611	1885616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
34048	NC_015942	CAT	2	6	1885734	1885739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200023
34049	NC_015942	CTG	2	6	1885751	1885756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
34050	NC_015942	CCG	2	6	1885796	1885801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
34051	NC_015942	CTT	2	6	1885887	1885892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200023
34052	NC_015942	TAC	2	6	1885903	1885908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200023
34053	NC_015942	GAT	2	6	1885927	1885932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200023
34054	NC_015942	GGC	2	6	1885940	1885945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200023
34055	NC_015942	TCG	2	6	1886004	1886009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
34056	NC_015942	TTG	2	6	1886077	1886082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200023
34057	NC_015942	TA	5	10	1886151	1886160	50 %	50 %	0 %	0 %	344200023
34058	NC_015942	CCG	2	6	1886321	1886326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
34059	NC_015942	GCC	2	6	1886350	1886355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200023
34060	NC_015942	CCCA	2	8	1886497	1886504	25 %	0 %	0 %	75 %	344200023
34061	NC_015942	CTG	2	6	1886517	1886522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200023
34062	NC_015942	CCGG	2	8	1886612	1886619	0 %	0 %	50 %	50 %	344200023
34063	NC_015942	A	6	6	1886698	1886703	100 %	0 %	0 %	0 %	344200023
34064	NC_015942	ACC	2	6	1886710	1886715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
34065	NC_015942	AAACA	2	10	1886716	1886725	80 %	0 %	0 %	20 %	344200023
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34069	NC_015942	CCA	2	6	1887132	1887137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200023
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34103	NC_015942	TTA	2	6	1889103	1889108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200025
34104	NC_015942	AGT	2	6	1889307	1889312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200025
34105	NC_015942	AG	3	6	1889324	1889329	50 %	0 %	50 %	0 %	344200025
34106	NC_015942	TCA	2	6	1889418	1889423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200026
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34110	NC_015942	CA	3	6	1889613	1889618	50 %	0 %	0 %	50 %	344200026
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34112	NC_015942	TGG	2	6	1889937	1889942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200027
34113	NC_015942	GC	3	6	1889974	1889979	0 %	0 %	50 %	50 %	344200027
34114	NC_015942	TCAC	2	8	1890026	1890033	25 %	25 %	0 %	50 %	344200027
34115	NC_015942	CGG	2	6	1890077	1890082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200027
34116	NC_015942	CTG	2	6	1890127	1890132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34117	NC_015942	GCA	2	6	1890197	1890202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34118	NC_015942	GCA	2	6	1890213	1890218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34119	NC_015942	TCAGA	2	10	1890270	1890279	40 %	20 %	20 %	20 %	344200027
34120	NC_015942	TG	3	6	1890287	1890292	0 %	50 %	50 %	0 %	344200027
34121	NC_015942	TCT	2	6	1890345	1890350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200027
34122	NC_015942	CAT	2	6	1890370	1890375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200027
34123	NC_015942	CAG	2	6	1890391	1890396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34124	NC_015942	GCC	2	6	1890473	1890478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200027
34125	NC_015942	CCG	2	6	1890603	1890608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200027
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34127	NC_015942	TGG	2	6	1890689	1890694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200027
34128	NC_015942	CG	3	6	1890707	1890712	0 %	0 %	50 %	50 %	344200027
34129	NC_015942	ATA	2	6	1890734	1890739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200027
34130	NC_015942	CCT	2	6	1890854	1890859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200027
34131	NC_015942	GT	3	6	1890995	1891000	0 %	50 %	50 %	0 %	344200027
34132	NC_015942	GTC	2	6	1891181	1891186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34133	NC_015942	TCA	2	6	1891215	1891220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200027
34134	NC_015942	CTT	2	6	1891360	1891365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200027
34135	NC_015942	ATCCGC	2	12	1891444	1891455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344200027
34136	NC_015942	TAT	2	6	1891476	1891481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200027
34137	NC_015942	CGC	2	6	1891497	1891502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200027
34138	NC_015942	GCG	2	6	1891555	1891560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200027
34139	NC_015942	CT	3	6	1891670	1891675	0 %	50 %	0 %	50 %	344200027
34140	NC_015942	CGT	2	6	1891725	1891730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
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34143	NC_015942	CTG	2	6	1892007	1892012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34144	NC_015942	GGT	2	6	1892041	1892046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200027
34145	NC_015942	TTC	3	9	1892068	1892076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200027
34146	NC_015942	TGC	2	6	1892078	1892083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200027
34147	NC_015942	GGC	2	6	1892085	1892090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200027
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34149	NC_015942	CTT	2	6	1892160	1892165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200027
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34154	NC_015942	GCC	2	6	1892805	1892810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200028
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34191	NC_015942	CTT	2	6	1894392	1894397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200032
34192	NC_015942	CATA	2	8	1894432	1894439	50 %	25 %	0 %	25 %	344200032
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34199	NC_015942	ATC	2	6	1894630	1894635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200032
34200	NC_015942	ATAA	2	8	1894647	1894654	75 %	25 %	0 %	0 %	344200032
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34210	NC_015942	CGA	2	6	1895106	1895111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200032
34211	NC_015942	TCA	2	6	1895153	1895158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200032
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34214	NC_015942	CGCT	2	8	1895406	1895413	0 %	25 %	25 %	50 %	344200033
34215	NC_015942	CTT	2	6	1895415	1895420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200033
34216	NC_015942	ATCT	2	8	1895426	1895433	25 %	50 %	0 %	25 %	344200033
34217	NC_015942	CAT	2	6	1895447	1895452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200033
34218	NC_015942	AGT	2	6	1895466	1895471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200033
34219	NC_015942	CGC	2	6	1895529	1895534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200033
34220	NC_015942	GGC	2	6	1895569	1895574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200033
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34222	NC_015942	GAT	2	6	1895705	1895710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200033
34223	NC_015942	GGC	2	6	1895714	1895719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200033
34224	NC_015942	CATC	2	8	1895750	1895757	25 %	25 %	0 %	50 %	344200033
34225	NC_015942	TCA	2	6	1895773	1895778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200033
34226	NC_015942	TCC	2	6	1895810	1895815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200034
34227	NC_015942	ATAC	2	8	1895831	1895838	50 %	25 %	0 %	25 %	344200034
34228	NC_015942	TCA	2	6	1895846	1895851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200034
34229	NC_015942	GTC	2	6	1895863	1895868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200034
34230	NC_015942	TTC	2	6	1895869	1895874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200034
34231	NC_015942	CGG	2	6	1895932	1895937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200034
34232	NC_015942	CGG	2	6	1895961	1895966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200034
34233	NC_015942	TCA	3	9	1895973	1895981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200034
34234	NC_015942	T	6	6	1895983	1895988	0 %	100 %	0 %	0 %	344200034
34235	NC_015942	TC	3	6	1895999	1896004	0 %	50 %	0 %	50 %	344200034
34236	NC_015942	GTA	2	6	1896033	1896038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200034
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34238	NC_015942	TCCGG	2	10	1896086	1896095	0 %	20 %	40 %	40 %	344200035
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34242	NC_015942	T	6	6	1896199	1896204	0 %	100 %	0 %	0 %	344200035
34243	NC_015942	CCA	2	6	1896208	1896213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200035
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34340	NC_015942	GC	3	6	1902366	1902371	0 %	0 %	50 %	50 %	344200040
34341	NC_015942	TGCG	2	8	1902449	1902456	0 %	25 %	50 %	25 %	344200040
34342	NC_015942	TGAC	2	8	1902461	1902468	25 %	25 %	25 %	25 %	344200040
34343	NC_015942	CT	3	6	1902472	1902477	0 %	50 %	0 %	50 %	344200040
34344	NC_015942	TGC	2	6	1902492	1902497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200040
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34347	NC_015942	ATG	2	6	1902599	1902604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200040
34348	NC_015942	CCA	2	6	1902936	1902941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200041
34349	NC_015942	GCT	2	6	1902969	1902974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200041
34350	NC_015942	GCC	2	6	1902977	1902982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200041
34351	NC_015942	CGT	2	6	1902998	1903003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200041
34352	NC_015942	TG	3	6	1903035	1903040	0 %	50 %	50 %	0 %	344200041
34353	NC_015942	GCT	2	6	1903043	1903048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200041
34354	NC_015942	CAG	2	6	1903131	1903136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200041
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34356	NC_015942	CGG	2	6	1903196	1903201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200041
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34359	NC_015942	AC	3	6	1903498	1903503	50 %	0 %	0 %	50 %	344200042
34360	NC_015942	TCA	2	6	1903528	1903533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200042
34361	NC_015942	CCTG	2	8	1903662	1903669	0 %	25 %	25 %	50 %	344200042
34362	NC_015942	GCC	2	6	1903695	1903700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200042
34363	NC_015942	ATTTC	2	10	1903717	1903726	20 %	60 %	0 %	20 %	344200042
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34386	NC_015942	AG	3	6	1905205	1905210	50 %	0 %	50 %	0 %	344200042
34387	NC_015942	T	7	7	1905245	1905251	0 %	100 %	0 %	0 %	344200042
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34400	NC_015942	CAGT	2	8	1905826	1905833	25 %	25 %	25 %	25 %	344200042
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34402	NC_015942	GGAT	2	8	1905849	1905856	25 %	25 %	50 %	0 %	344200042
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34423	NC_015942	AT	3	6	1906999	1907004	50 %	50 %	0 %	0 %	344200043
34424	NC_015942	ACT	2	6	1907065	1907070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200043
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34440	NC_015942	T	6	6	1907951	1907956	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
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34450	NC_015942	T	6	6	1908483	1908488	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
34451	NC_015942	T	6	6	1908525	1908530	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
34452	NC_015942	AGA	2	6	1908547	1908552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200043
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34454	NC_015942	AT	3	6	1908591	1908596	50 %	50 %	0 %	0 %	344200043
34455	NC_015942	CGT	2	6	1908647	1908652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200043
34456	NC_015942	T	7	7	1908715	1908721	0 %	100 %	0 %	0 %	344200043
34457	NC_015942	TAT	2	6	1908735	1908740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200043
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34459	NC_015942	TGC	2	6	1908969	1908974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200043
34460	NC_015942	ATATCA	2	12	1909042	1909053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	344200043
34461	NC_015942	TTCA	2	8	1909071	1909078	25 %	50 %	0 %	25 %	344200043
34462	NC_015942	CCG	3	9	1909851	1909859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200044
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34464	NC_015942	AGC	2	6	1909971	1909976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200044
34465	NC_015942	TGA	2	6	1910237	1910242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200045
34466	NC_015942	CAA	2	6	1910247	1910252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200045
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34468	NC_015942	ACA	2	6	1910330	1910335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200045
34469	NC_015942	GAC	2	6	1910353	1910358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200045
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34472	NC_015942	TAC	2	6	1910482	1910487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200045
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34477	NC_015942	TGA	2	6	1911308	1911313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200046
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34484	NC_015942	CT	3	6	1911635	1911640	0 %	50 %	0 %	50 %	344200047
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34491	NC_015942	A	6	6	1912276	1912281	100 %	0 %	0 %	0 %	344200048
34492	NC_015942	CTT	2	6	1912291	1912296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200048
34493	NC_015942	A	6	6	1912384	1912389	100 %	0 %	0 %	0 %	344200048
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34495	NC_015942	T	6	6	1912470	1912475	0 %	100 %	0 %	0 %	344200048
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