MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_015942	GCC	2	6	1551739	1551744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199694
28002	NC_015942	CGCC	2	8	1551815	1551822	0 %	0 %	25 %	75 %	344199694
28003	NC_015942	TGG	2	6	1551830	1551835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199694
28004	NC_015942	GC	3	6	1551852	1551857	0 %	0 %	50 %	50 %	344199694
28005	NC_015942	GCACGA	2	12	1551980	1551991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199694
28006	NC_015942	GAC	2	6	1552029	1552034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199694
28007	NC_015942	AAC	2	6	1552045	1552050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199694
28008	NC_015942	CTG	2	6	1552069	1552074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199694
28009	NC_015942	ATC	2	6	1552105	1552110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199694
28010	NC_015942	GACCAC	2	12	1552116	1552127	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344199694
28011	NC_015942	TGA	2	6	1552139	1552144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199694
28012	NC_015942	GCC	2	6	1552147	1552152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199694
28013	NC_015942	GCC	2	6	1552242	1552247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199694
28014	NC_015942	CGG	2	6	1552256	1552261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199694
28015	NC_015942	T	6	6	1552365	1552370	0 %	100 %	0 %	0 %	344199694
28016	NC_015942	AGC	2	6	1552399	1552404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199694
28017	NC_015942	TGG	2	6	1552442	1552447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199694
28018	NC_015942	CAC	2	6	1552464	1552469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199694
28019	NC_015942	CTT	2	6	1552478	1552483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199694
28020	NC_015942	T	6	6	1552599	1552604	0 %	100 %	0 %	0 %	344199694
28021	NC_015942	TTTC	2	8	1552607	1552614	0 %	75 %	0 %	25 %	344199694
28022	NC_015942	GCG	2	6	1552794	1552799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199695
28023	NC_015942	TGC	2	6	1552823	1552828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199695
28024	NC_015942	CAC	2	6	1552873	1552878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199695
28025	NC_015942	TGG	2	6	1552896	1552901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199695
28026	NC_015942	TGC	2	6	1552928	1552933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199695
28027	NC_015942	GGT	2	6	1552947	1552952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199695
28028	NC_015942	ATG	2	6	1552994	1552999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199695
28029	NC_015942	T	6	6	1553012	1553017	0 %	100 %	0 %	0 %	344199696
28030	NC_015942	GTCT	2	8	1553027	1553034	0 %	50 %	25 %	25 %	344199696
28031	NC_015942	CTA	2	6	1553074	1553079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199696
28032	NC_015942	CAC	2	6	1553180	1553185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199696
28033	NC_015942	TTGAC	2	10	1553437	1553446	20 %	40 %	20 %	20 %	344199696
28034	NC_015942	TGA	2	6	1553474	1553479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199696
28035	NC_015942	GAA	2	6	1553486	1553491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199696
28036	NC_015942	TGG	2	6	1553492	1553497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199696
28037	NC_015942	TCA	2	6	1553644	1553649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199697
28038	NC_015942	TCA	2	6	1553726	1553731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199697
28039	NC_015942	CTA	2	6	1554082	1554087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199698
28040	NC_015942	AAT	2	6	1554095	1554100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199698
28041	NC_015942	GCC	2	6	1554197	1554202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199698
28042	NC_015942	GCC	2	6	1554219	1554224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199698
28043	NC_015942	TGG	2	6	1554280	1554285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199698
28044	NC_015942	AGT	2	6	1554356	1554361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199698
28045	NC_015942	GCC	2	6	1554408	1554413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199698
28046	NC_015942	ATC	2	6	1554438	1554443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199698
28047	NC_015942	TAA	2	6	1554896	1554901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199699
28048	NC_015942	AT	3	6	1554911	1554916	50 %	50 %	0 %	0 %	344199699
28049	NC_015942	CTG	2	6	1554936	1554941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199699
28050	NC_015942	CAA	2	6	1554965	1554970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344199699
28051	NC_015942	CTGG	2	8	1554971	1554978	0 %	25 %	50 %	25 %	344199699
28052	NC_015942	AGA	2	6	1555102	1555107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199699
28053	NC_015942	GGA	2	6	1555118	1555123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199699
28054	NC_015942	CGC	2	6	1555187	1555192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199699
28055	NC_015942	GCC	2	6	1555320	1555325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199699
28056	NC_015942	G	6	6	1555471	1555476	0 %	0 %	100 %	0 %	344199700
28057	NC_015942	CG	3	6	1555519	1555524	0 %	0 %	50 %	50 %	344199700
28058	NC_015942	TCA	2	6	1555552	1555557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199700
28059	NC_015942	CCGT	2	8	1555567	1555574	0 %	25 %	25 %	50 %	344199700
28060	NC_015942	GTGC	2	8	1555590	1555597	0 %	25 %	50 %	25 %	344199700
28061	NC_015942	ATA	2	6	1555614	1555619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344199700
28062	NC_015942	CGT	2	6	1555622	1555627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199700
28063	NC_015942	ATG	2	6	1555723	1555728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199700
28064	NC_015942	CTC	2	6	1555804	1555809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199701
28065	NC_015942	CTG	2	6	1555819	1555824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199701
28066	NC_015942	GCT	2	6	1555827	1555832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199701
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28069	NC_015942	GAT	2	6	1555918	1555923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199701
28070	NC_015942	GTC	2	6	1555943	1555948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199701
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28073	NC_015942	GAT	2	6	1556161	1556166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199701
28074	NC_015942	GC	4	8	1556201	1556208	0 %	0 %	50 %	50 %	344199701
28075	NC_015942	TTTC	2	8	1556268	1556275	0 %	75 %	0 %	25 %	344199701
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28081	NC_015942	TCA	2	6	1557010	1557015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199702
28082	NC_015942	ATG	2	6	1557214	1557219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199703
28083	NC_015942	TGGT	2	8	1557265	1557272	0 %	50 %	50 %	0 %	344199703
28084	NC_015942	GGA	2	6	1557294	1557299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199703
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28087	NC_015942	GC	4	8	1557442	1557449	0 %	0 %	50 %	50 %	344199703
28088	NC_015942	TGG	2	6	1557590	1557595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199703
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28092	NC_015942	TCG	2	6	1557734	1557739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199703
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28101	NC_015942	GC	3	6	1558903	1558908	0 %	0 %	50 %	50 %	344199704
28102	NC_015942	CTG	2	6	1558913	1558918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199704
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28110	NC_015942	GC	3	6	1559103	1559108	0 %	0 %	50 %	50 %	344199705
28111	NC_015942	CGA	2	6	1559145	1559150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199705
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28116	NC_015942	GCC	2	6	1559256	1559261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199705
28117	NC_015942	CTG	2	6	1559305	1559310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199705
28118	NC_015942	TGC	2	6	1559369	1559374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199705
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28218	NC_015942	AGT	2	6	1567346	1567351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199715
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28221	NC_015942	TCC	2	6	1567537	1567542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199715
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28229	NC_015942	TCG	2	6	1567754	1567759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199715
28230	NC_015942	GGTC	2	8	1567764	1567771	0 %	25 %	50 %	25 %	344199715
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28232	NC_015942	CCT	2	6	1567812	1567817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199715
28233	NC_015942	AGC	2	6	1567835	1567840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199715
28234	NC_015942	GGC	2	6	1567949	1567954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199715
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28239	NC_015942	GC	3	6	1568825	1568830	0 %	0 %	50 %	50 %	344199716
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28340	NC_015942	GAG	2	6	1575802	1575807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199720
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28342	NC_015942	CT	3	6	1575847	1575852	0 %	50 %	0 %	50 %	344199720
28343	NC_015942	TGC	2	6	1575920	1575925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199720
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