MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015942	TCCGCA	2	12	1084297	1084308	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344199232
19502	NC_015942	GGAT	2	8	1084330	1084337	25 %	25 %	50 %	0 %	344199232
19503	NC_015942	GTGA	2	8	1084496	1084503	25 %	25 %	50 %	0 %	344199232
19504	NC_015942	ATCC	2	8	1084663	1084670	25 %	25 %	0 %	50 %	344199233
19505	NC_015942	CAC	2	6	1084675	1084680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199233
19506	NC_015942	TTG	2	6	1084719	1084724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199233
19507	NC_015942	TAG	2	6	1084750	1084755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199233
19508	NC_015942	GATT	2	8	1084759	1084766	25 %	50 %	25 %	0 %	344199233
19509	NC_015942	AGT	2	6	1084773	1084778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199233
19510	NC_015942	CCA	2	6	1084785	1084790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199233
19511	NC_015942	AAG	2	6	1084806	1084811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199233
19512	NC_015942	ATG	2	6	1084827	1084832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199233
19513	NC_015942	GCCACC	2	12	1084862	1084873	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344199233
19514	NC_015942	GCA	2	6	1084946	1084951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199233
19515	NC_015942	CCG	2	6	1085019	1085024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199233
19516	NC_015942	CCA	2	6	1085034	1085039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199233
19517	NC_015942	C	8	8	1085049	1085056	0 %	0 %	0 %	100 %	344199233
19518	NC_015942	GGC	2	6	1085081	1085086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199233
19519	NC_015942	GC	3	6	1085111	1085116	0 %	0 %	50 %	50 %	344199233
19520	NC_015942	CTG	2	6	1085214	1085219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199233
19521	NC_015942	GTG	2	6	1085242	1085247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199233
19522	NC_015942	GGC	2	6	1085264	1085269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199233
19523	NC_015942	CTC	2	6	1085366	1085371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199233
19524	NC_015942	TCG	2	6	1085435	1085440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199234
19525	NC_015942	G	6	6	1085465	1085470	0 %	0 %	100 %	0 %	344199234
19526	NC_015942	CGC	2	6	1085483	1085488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199234
19527	NC_015942	CTG	2	6	1085496	1085501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199234
19528	NC_015942	TGC	2	6	1085513	1085518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199234
19529	NC_015942	AGA	2	6	1085548	1085553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344199234
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19532	NC_015942	CGG	2	6	1085701	1085706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199234
19533	NC_015942	GGCG	2	8	1085897	1085904	0 %	0 %	75 %	25 %	344199234
19534	NC_015942	A	7	7	1085937	1085943	100 %	0 %	0 %	0 %	344199234
19535	NC_015942	TAT	2	6	1086000	1086005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344199234
19536	NC_015942	TTTC	2	8	1086065	1086072	0 %	75 %	0 %	25 %	344199234
19537	NC_015942	GGC	2	6	1086084	1086089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199234
19538	NC_015942	GGC	2	6	1086113	1086118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199234
19539	NC_015942	AGG	2	6	1086151	1086156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344199234
19540	NC_015942	CTT	2	6	1086200	1086205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344199234
19541	NC_015942	A	6	6	1086225	1086230	100 %	0 %	0 %	0 %	344199234
19542	NC_015942	GCC	2	6	1086248	1086253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199234
19543	NC_015942	GACC	2	8	1086262	1086269	25 %	0 %	25 %	50 %	344199234
19544	NC_015942	CGG	2	6	1086442	1086447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199234
19545	NC_015942	TAC	2	6	1086495	1086500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199234
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19548	NC_015942	GTGC	2	8	1086675	1086682	0 %	25 %	50 %	25 %	344199234
19549	NC_015942	ATG	2	6	1086730	1086735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199234
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19551	NC_015942	GTG	2	6	1086771	1086776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199234
19552	NC_015942	GAC	2	6	1086777	1086782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199234
19553	NC_015942	GC	3	6	1086828	1086833	0 %	0 %	50 %	50 %	344199234
19554	NC_015942	TGG	2	6	1086841	1086846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199234
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19557	NC_015942	GGC	2	6	1087733	1087738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199235
19558	NC_015942	ACC	2	6	1087910	1087915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199235
19559	NC_015942	ATG	2	6	1087923	1087928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199235
19560	NC_015942	TAG	2	6	1088050	1088055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199235
19561	NC_015942	TGG	2	6	1088059	1088064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344199235
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19564	NC_015942	GC	4	8	1088170	1088177	0 %	0 %	50 %	50 %	344199235
19565	NC_015942	GTTG	2	8	1088197	1088204	0 %	50 %	50 %	0 %	344199235
19566	NC_015942	GCA	2	6	1088208	1088213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199235
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19568	NC_015942	GCA	2	6	1088251	1088256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199235
19569	NC_015942	AGC	2	6	1088319	1088324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199235
19570	NC_015942	GCG	2	6	1088331	1088336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199235
19571	NC_015942	GTC	2	6	1088342	1088347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199235
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19575	NC_015942	CTG	2	6	1088486	1088491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199235
19576	NC_015942	GAAGCC	2	12	1088564	1088575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199235
19577	NC_015942	GCG	4	12	1088589	1088600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199235
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19581	NC_015942	GC	3	6	1088769	1088774	0 %	0 %	50 %	50 %	344199235
19582	NC_015942	GCA	2	6	1088803	1088808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199235
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19585	NC_015942	TCC	2	6	1089110	1089115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344199236
19586	NC_015942	GC	3	6	1089132	1089137	0 %	0 %	50 %	50 %	344199236
19587	NC_015942	TCG	2	6	1089152	1089157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199236
19588	NC_015942	A	7	7	1089158	1089164	100 %	0 %	0 %	0 %	344199236
19589	NC_015942	ACC	2	6	1089166	1089171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199236
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19593	NC_015942	AG	3	6	1089425	1089430	50 %	0 %	50 %	0 %	344199236
19594	NC_015942	G	6	6	1089487	1089492	0 %	0 %	100 %	0 %	344199236
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19599	NC_015942	GCCGG	2	10	1089778	1089787	0 %	0 %	60 %	40 %	344199237
19600	NC_015942	GTT	2	6	1089844	1089849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344199237
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19603	NC_015942	GGGT	2	8	1089918	1089925	0 %	25 %	75 %	0 %	344199237
19604	NC_015942	CCGCA	2	10	1089932	1089941	20 %	0 %	20 %	60 %	344199237
19605	NC_015942	CGT	2	6	1090001	1090006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199237
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19611	NC_015942	GC	3	6	1090144	1090149	0 %	0 %	50 %	50 %	344199237
19612	NC_015942	C	6	6	1090231	1090236	0 %	0 %	0 %	100 %	344199237
19613	NC_015942	GAC	2	6	1090249	1090254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199237
19614	NC_015942	GCA	2	6	1090267	1090272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344199237
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19616	NC_015942	CGG	2	6	1090360	1090365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344199238
19617	NC_015942	GCT	2	6	1090375	1090380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344199238
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19721	NC_015942	TGGG	2	8	1095543	1095550	0 %	25 %	75 %	0 %	344199243
19722	NC_015942	ATG	2	6	1095564	1095569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344199243
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19729	NC_015942	CCA	2	6	1095847	1095852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344199243
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19848	NC_015942	CCCT	2	8	1101019	1101026	0 %	25 %	0 %	75 %	344199247
19849	NC_015942	GCC	2	6	1101040	1101045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344199247
19850	NC_015942	TAC	2	6	1101055	1101060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199247
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19853	NC_015942	CT	3	6	1101124	1101129	0 %	50 %	0 %	50 %	344199247
19854	NC_015942	TCA	2	6	1101140	1101145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344199247
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