MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_015942	GA	3	6	3148307	3148312	50 %	0 %	50 %	0 %	344201280
57002	NC_015942	CAC	2	6	3148318	3148323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57003	NC_015942	GGCG	2	8	3148342	3148349	0 %	0 %	75 %	25 %	344201280
57004	NC_015942	AC	3	6	3148427	3148432	50 %	0 %	0 %	50 %	344201280
57005	NC_015942	GCA	2	6	3148470	3148475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201280
57006	NC_015942	CGG	2	6	3148504	3148509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201280
57007	NC_015942	CCA	2	6	3148563	3148568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57008	NC_015942	GCT	2	6	3148569	3148574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201280
57009	NC_015942	CGG	2	6	3148663	3148668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201280
57010	NC_015942	CGC	2	6	3148766	3148771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201280
57011	NC_015942	ATC	2	6	3148796	3148801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201280
57012	NC_015942	CGG	2	6	3148838	3148843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201280
57013	NC_015942	GAG	2	6	3148844	3148849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201280
57014	NC_015942	ATA	2	6	3148858	3148863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201280
57015	NC_015942	GC	4	8	3148950	3148957	0 %	0 %	50 %	50 %	344201280
57016	NC_015942	TCC	2	6	3148979	3148984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201280
57017	NC_015942	A	6	6	3148993	3148998	100 %	0 %	0 %	0 %	344201280
57018	NC_015942	TCA	2	6	3149006	3149011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201280
57019	NC_015942	CG	3	6	3149035	3149040	0 %	0 %	50 %	50 %	344201280
57020	NC_015942	GCC	2	6	3149057	3149062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201280
57021	NC_015942	GCC	2	6	3149084	3149089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201280
57022	NC_015942	CGA	2	6	3149096	3149101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201280
57023	NC_015942	C	6	6	3149137	3149142	0 %	0 %	0 %	100 %	344201280
57024	NC_015942	CAC	2	6	3149194	3149199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57025	NC_015942	CAT	2	6	3149265	3149270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201280
57026	NC_015942	AGC	2	6	3149276	3149281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201280
57027	NC_015942	CA	3	6	3149282	3149287	50 %	0 %	0 %	50 %	344201280
57028	NC_015942	CCA	2	6	3149364	3149369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57029	NC_015942	CCA	2	6	3149442	3149447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57030	NC_015942	ACC	2	6	3149450	3149455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201280
57031	NC_015942	GC	3	6	3149486	3149491	0 %	0 %	50 %	50 %	344201280
57032	NC_015942	CGG	2	6	3149508	3149513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201280
57033	NC_015942	ATG	2	6	3149534	3149539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201280
57034	NC_015942	GGTA	2	8	3149597	3149604	25 %	25 %	50 %	0 %	344201281
57035	NC_015942	ATC	2	6	3149609	3149614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201281
57036	NC_015942	TCC	2	6	3149666	3149671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201281
57037	NC_015942	GCG	2	6	3149879	3149884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201281
57038	NC_015942	CAC	2	6	3149941	3149946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201281
57039	NC_015942	CTT	2	6	3149956	3149961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201281
57040	NC_015942	TTG	2	6	3149965	3149970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201281
57041	NC_015942	GC	3	6	3150080	3150085	0 %	0 %	50 %	50 %	344201281
57042	NC_015942	GTG	2	6	3150246	3150251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201282
57043	NC_015942	AATCG	2	10	3150307	3150316	40 %	20 %	20 %	20 %	344201282
57044	NC_015942	T	7	7	3150716	3150722	0 %	100 %	0 %	0 %	344201283
57045	NC_015942	TTG	2	6	3150754	3150759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201283
57046	NC_015942	GAT	2	6	3150834	3150839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201283
57047	NC_015942	CGC	2	6	3150852	3150857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201283
57048	NC_015942	CAT	2	6	3150872	3150877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201283
57049	NC_015942	CAA	2	6	3150881	3150886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201283
57050	NC_015942	A	6	6	3150889	3150894	100 %	0 %	0 %	0 %	344201283
57051	NC_015942	ATT	2	6	3150939	3150944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201283
57052	NC_015942	CTT	2	6	3150962	3150967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201283
57053	NC_015942	CAG	2	6	3151083	3151088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201283
57054	NC_015942	GTT	2	6	3151100	3151105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201283
57055	NC_015942	GC	3	6	3151107	3151112	0 %	0 %	50 %	50 %	344201283
57056	NC_015942	CGG	2	6	3151128	3151133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201283
57057	NC_015942	GCT	2	6	3151214	3151219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201283
57058	NC_015942	CGC	2	6	3151237	3151242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201283
57059	NC_015942	GAT	2	6	3151266	3151271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201283
57060	NC_015942	CAT	2	6	3151292	3151297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201283
57061	NC_015942	GCC	2	6	3151492	3151497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201283
57062	NC_015942	TGC	2	6	3151530	3151535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201283
57063	NC_015942	GCCA	2	8	3151537	3151544	25 %	0 %	25 %	50 %	344201283
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57066	NC_015942	TTC	2	6	3151882	3151887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201283
57067	NC_015942	TTC	2	6	3152041	3152046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201284
57068	NC_015942	TGAT	2	8	3152203	3152210	25 %	50 %	25 %	0 %	344201284
57069	NC_015942	CGG	2	6	3152283	3152288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201284
57070	NC_015942	CTG	2	6	3153113	3153118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201285
57071	NC_015942	GCG	2	6	3153151	3153156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201285
57072	NC_015942	CGG	3	9	3153248	3153256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201285
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57074	NC_015942	A	6	6	3153308	3153313	100 %	0 %	0 %	0 %	344201285
57075	NC_015942	CGC	2	6	3153484	3153489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201285
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57080	NC_015942	AAG	2	6	3153945	3153950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201285
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57082	NC_015942	GAC	2	6	3154039	3154044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201285
57083	NC_015942	TTA	2	6	3154080	3154085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201285
57084	NC_015942	CAAA	2	8	3154191	3154198	75 %	0 %	0 %	25 %	344201285
57085	NC_015942	TCCAG	2	10	3154227	3154236	20 %	20 %	20 %	40 %	344201285
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57087	NC_015942	CGTCA	2	10	3154322	3154331	20 %	20 %	20 %	40 %	344201285
57088	NC_015942	GAG	2	6	3154478	3154483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201285
57089	NC_015942	ACATC	2	10	3154513	3154522	40 %	20 %	0 %	40 %	344201285
57090	NC_015942	ACGG	2	8	3154532	3154539	25 %	0 %	50 %	25 %	344201285
57091	NC_015942	AC	4	8	3154548	3154555	50 %	0 %	0 %	50 %	344201285
57092	NC_015942	AGA	2	6	3156058	3156063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201286
57093	NC_015942	TTA	2	6	3156160	3156165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201286
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57097	NC_015942	GCATA	2	10	3156302	3156311	40 %	20 %	20 %	20 %	344201286
57098	NC_015942	CGT	2	6	3156401	3156406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201286
57099	NC_015942	CCA	2	6	3156436	3156441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201286
57100	NC_015942	TCA	2	6	3156458	3156463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201286
57101	NC_015942	AAC	2	6	3156505	3156510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201286
57102	NC_015942	CCAT	2	8	3156528	3156535	25 %	25 %	0 %	50 %	344201286
57103	NC_015942	GGC	2	6	3156556	3156561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201286
57104	NC_015942	CTTA	2	8	3156576	3156583	25 %	50 %	0 %	25 %	344201286
57105	NC_015942	GTT	2	6	3156586	3156591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201286
57106	NC_015942	AAT	2	6	3156600	3156605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201286
57107	NC_015942	TAG	2	6	3156615	3156620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201286
57108	NC_015942	GAA	2	6	3156680	3156685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201286
57109	NC_015942	ATC	2	6	3156906	3156911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201286
57110	NC_015942	AGC	2	6	3156966	3156971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201286
57111	NC_015942	AAGGC	3	15	3157143	3157157	40 %	0 %	40 %	20 %	344201286
57112	NC_015942	ATG	2	6	3157324	3157329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201287
57113	NC_015942	CAG	2	6	3157539	3157544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201287
57114	NC_015942	CAG	2	6	3157557	3157562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201287
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57116	NC_015942	CGC	2	6	3157668	3157673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201287
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57231	NC_015942	CCA	2	6	3163359	3163364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201290
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57352	NC_015942	GGC	2	6	3171063	3171068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201296
57353	NC_015942	TCG	2	6	3171123	3171128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
57354	NC_015942	CG	3	6	3171211	3171216	0 %	0 %	50 %	50 %	344201296
57355	NC_015942	CGT	2	6	3171301	3171306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201296
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