MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_015942	GCCA	2	8	3127057	3127064	25 %	0 %	25 %	50 %	344201258
56502	NC_015942	CCA	2	6	3127130	3127135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201258
56503	NC_015942	CAG	2	6	3127137	3127142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201258
56504	NC_015942	CGT	2	6	3127167	3127172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201258
56505	NC_015942	TCA	2	6	3127268	3127273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201258
56506	NC_015942	TCA	2	6	3127351	3127356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201258
56507	NC_015942	CCAG	2	8	3127376	3127383	25 %	0 %	25 %	50 %	344201258
56508	NC_015942	CAC	2	6	3127425	3127430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201258
56509	NC_015942	TGA	2	6	3127439	3127444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201258
56510	NC_015942	ACCCA	2	10	3127462	3127471	40 %	0 %	0 %	60 %	344201258
56511	NC_015942	CAA	2	6	3127759	3127764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201259
56512	NC_015942	GCT	2	6	3127827	3127832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201259
56513	NC_015942	GGC	2	6	3127859	3127864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201259
56514	NC_015942	CAG	3	9	3127865	3127873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201259
56515	NC_015942	TCA	2	6	3128031	3128036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201260
56516	NC_015942	AC	3	6	3128044	3128049	50 %	0 %	0 %	50 %	344201260
56517	NC_015942	GCC	2	6	3128067	3128072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
56518	NC_015942	TCC	2	6	3128085	3128090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201260
56519	NC_015942	CGC	2	6	3128107	3128112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
56520	NC_015942	GCG	2	6	3128154	3128159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
56521	NC_015942	GCA	2	6	3128175	3128180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
56522	NC_015942	GGCCC	2	10	3128213	3128222	0 %	0 %	40 %	60 %	344201260
56523	NC_015942	GAC	2	6	3128270	3128275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
56524	NC_015942	GCA	2	6	3128386	3128391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201260
56525	NC_015942	GGC	2	6	3128411	3128416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
56526	NC_015942	TCG	2	6	3128466	3128471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201260
56527	NC_015942	CTT	2	6	3128494	3128499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201260
56528	NC_015942	GCG	2	6	3128624	3128629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
56529	NC_015942	CCG	3	9	3128655	3128663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
56530	NC_015942	CAC	2	6	3128687	3128692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201260
56531	NC_015942	GGC	2	6	3128711	3128716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201260
56532	NC_015942	TTC	2	6	3128720	3128725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201260
56533	NC_015942	CTC	2	6	3128732	3128737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201260
56534	NC_015942	GCC	2	6	3128804	3128809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201260
56535	NC_015942	GACC	2	8	3128854	3128861	25 %	0 %	25 %	50 %	344201260
56536	NC_015942	CCAC	2	8	3128871	3128878	25 %	0 %	0 %	75 %	344201261
56537	NC_015942	GCG	2	6	3128897	3128902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201261
56538	NC_015942	AGC	2	6	3128950	3128955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201261
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56540	NC_015942	GCTCCA	2	12	3129033	3129044	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344201261
56541	NC_015942	GGA	2	6	3129055	3129060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201261
56542	NC_015942	GCA	2	6	3129090	3129095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201261
56543	NC_015942	GCAC	2	8	3129128	3129135	25 %	0 %	25 %	50 %	344201261
56544	NC_015942	ATA	2	6	3129178	3129183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201261
56545	NC_015942	GCGG	2	8	3129251	3129258	0 %	0 %	75 %	25 %	344201261
56546	NC_015942	ATT	2	6	3129283	3129288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201261
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56548	NC_015942	GA	5	10	3129382	3129391	50 %	0 %	50 %	0 %	344201261
56549	NC_015942	CCG	2	6	3129393	3129398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201261
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56551	NC_015942	GAG	2	6	3129439	3129444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201261
56552	NC_015942	ATCA	2	8	3129517	3129524	50 %	25 %	0 %	25 %	344201261
56553	NC_015942	CGG	2	6	3129555	3129560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201261
56554	NC_015942	CGG	2	6	3129570	3129575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201261
56555	NC_015942	ACCC	2	8	3129586	3129593	25 %	0 %	0 %	75 %	344201261
56556	NC_015942	ATG	2	6	3129626	3129631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201261
56557	NC_015942	TACC	2	8	3129713	3129720	25 %	25 %	0 %	50 %	344201262
56558	NC_015942	AGC	2	6	3129726	3129731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201262
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56560	NC_015942	CG	3	6	3129768	3129773	0 %	0 %	50 %	50 %	344201262
56561	NC_015942	GGT	2	6	3129940	3129945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201262
56562	NC_015942	ATGGC	2	10	3129999	3130008	20 %	20 %	40 %	20 %	344201262
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56567	NC_015942	CAG	2	6	3130160	3130165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201262
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56574	NC_015942	CTG	2	6	3130372	3130377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201263
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56586	NC_015942	TGCT	2	8	3130838	3130845	0 %	50 %	25 %	25 %	344201263
56587	NC_015942	GC	3	6	3130861	3130866	0 %	0 %	50 %	50 %	344201263
56588	NC_015942	G	6	6	3130896	3130901	0 %	0 %	100 %	0 %	344201263
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56603	NC_015942	GGCG	2	8	3131566	3131573	0 %	0 %	75 %	25 %	344201263
56604	NC_015942	TGC	2	6	3131616	3131621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201263
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56607	NC_015942	CG	3	6	3131677	3131682	0 %	0 %	50 %	50 %	344201263
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56612	NC_015942	GC	3	6	3131963	3131968	0 %	0 %	50 %	50 %	344201263
56613	NC_015942	CCG	2	6	3131970	3131975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201263
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56616	NC_015942	ACC	2	6	3132085	3132090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201263
56617	NC_015942	GCA	2	6	3132173	3132178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201263
56618	NC_015942	CCG	2	6	3132200	3132205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201263
56619	NC_015942	ACG	2	6	3132209	3132214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201263
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56621	NC_015942	T	7	7	3132274	3132280	0 %	100 %	0 %	0 %	344201264
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56662	NC_015942	GCA	2	6	3134001	3134006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201267
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56726	NC_015942	TGA	2	6	3136562	3136567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201269
56727	NC_015942	TGGC	2	8	3136573	3136580	0 %	25 %	50 %	25 %	344201269
56728	NC_015942	ATG	2	6	3136588	3136593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201269
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56963	NC_015942	GTC	2	6	3146165	3146170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201277
56964	NC_015942	GC	3	6	3146179	3146184	0 %	0 %	50 %	50 %	344201277
56965	NC_015942	GAT	2	6	3146197	3146202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201277
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56999	NC_015942	CCGC	2	8	3148218	3148225	0 %	0 %	25 %	75 %	344201280
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