MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_015942	GCG	2	6	3041636	3041641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201177
55002	NC_015942	GGC	2	6	3041745	3041750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201177
55003	NC_015942	ACGT	2	8	3041789	3041796	25 %	25 %	25 %	25 %	344201177
55004	NC_015942	CCGG	2	8	3041806	3041813	0 %	0 %	50 %	50 %	344201177
55005	NC_015942	GGC	2	6	3041866	3041871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201177
55006	NC_015942	GTC	2	6	3041908	3041913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201177
55007	NC_015942	A	7	7	3041917	3041923	100 %	0 %	0 %	0 %	344201177
55008	NC_015942	CGC	2	6	3041983	3041988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201177
55009	NC_015942	CAC	2	6	3042022	3042027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201178
55010	NC_015942	CATC	2	8	3042149	3042156	25 %	25 %	0 %	50 %	344201178
55011	NC_015942	GCA	2	6	3042173	3042178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201178
55012	NC_015942	CGC	2	6	3042222	3042227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201178
55013	NC_015942	GGCG	2	8	3042254	3042261	0 %	0 %	75 %	25 %	344201178
55014	NC_015942	GC	3	6	3042560	3042565	0 %	0 %	50 %	50 %	344201179
55015	NC_015942	CGA	2	6	3042571	3042576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55016	NC_015942	CCT	2	6	3042586	3042591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201179
55017	NC_015942	GCC	2	6	3042638	3042643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
55018	NC_015942	ACG	2	6	3042666	3042671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55019	NC_015942	TGG	2	6	3042681	3042686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201179
55020	NC_015942	CGA	2	6	3042724	3042729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55021	NC_015942	A	7	7	3042737	3042743	100 %	0 %	0 %	0 %	344201179
55022	NC_015942	GCT	2	6	3042820	3042825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55023	NC_015942	CGCGC	2	10	3042905	3042914	0 %	0 %	40 %	60 %	344201179
55024	NC_015942	GCA	2	6	3042930	3042935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55025	NC_015942	CCT	2	6	3042979	3042984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201179
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55027	NC_015942	CGC	2	6	3043024	3043029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
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55029	NC_015942	GCG	2	6	3043078	3043083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201179
55030	NC_015942	GGT	3	9	3043084	3043092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201179
55031	NC_015942	AT	3	6	3043137	3043142	50 %	50 %	0 %	0 %	344201179
55032	NC_015942	CCG	2	6	3043155	3043160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
55033	NC_015942	GC	3	6	3043270	3043275	0 %	0 %	50 %	50 %	344201179
55034	NC_015942	GCC	2	6	3043298	3043303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
55035	NC_015942	ATT	2	6	3043308	3043313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201179
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55038	NC_015942	GGA	2	6	3043426	3043431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201179
55039	NC_015942	GCC	2	6	3043502	3043507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
55040	NC_015942	GCG	2	6	3043613	3043618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201179
55041	NC_015942	GATG	2	8	3043714	3043721	25 %	25 %	50 %	0 %	344201179
55042	NC_015942	AG	3	6	3043739	3043744	50 %	0 %	50 %	0 %	344201179
55043	NC_015942	CTC	2	6	3043760	3043765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201179
55044	NC_015942	GCC	2	6	3043797	3043802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201179
55045	NC_015942	GACCTG	2	12	3043829	3043840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55046	NC_015942	GTG	2	6	3043841	3043846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201179
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55048	NC_015942	GCGG	2	8	3043947	3043954	0 %	0 %	75 %	25 %	344201179
55049	NC_015942	GC	3	6	3044009	3044014	0 %	0 %	50 %	50 %	344201179
55050	NC_015942	GCT	2	6	3044022	3044027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55051	NC_015942	TCG	2	6	3044064	3044069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55052	NC_015942	GAA	2	6	3044093	3044098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201179
55053	NC_015942	TGC	2	6	3044103	3044108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201179
55054	NC_015942	AGCGC	2	10	3044173	3044182	20 %	0 %	40 %	40 %	344201179
55055	NC_015942	GGCT	2	8	3044183	3044190	0 %	25 %	50 %	25 %	344201179
55056	NC_015942	GAA	2	6	3044194	3044199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201179
55057	NC_015942	CTG	2	6	3044240	3044245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201179
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55059	NC_015942	CAG	2	6	3044401	3044406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201180
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55062	NC_015942	ATC	2	6	3044551	3044556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201180
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55074	NC_015942	GCAG	2	8	3045059	3045066	25 %	0 %	50 %	25 %	344201180
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55082	NC_015942	CAGGG	2	10	3045577	3045586	20 %	0 %	60 %	20 %	344201182
55083	NC_015942	CTG	2	6	3045600	3045605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201182
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55087	NC_015942	TCC	3	9	3045855	3045863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201182
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55089	NC_015942	TATG	2	8	3046017	3046024	25 %	50 %	25 %	0 %	344201183
55090	NC_015942	GGCG	2	8	3046060	3046067	0 %	0 %	75 %	25 %	344201183
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55118	NC_015942	GC	3	6	3048075	3048080	0 %	0 %	50 %	50 %	344201186
55119	NC_015942	GTT	2	6	3048130	3048135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201186
55120	NC_015942	TCT	2	6	3048229	3048234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201186
55121	NC_015942	ATGTC	2	10	3048263	3048272	20 %	40 %	20 %	20 %	344201186
55122	NC_015942	A	6	6	3048374	3048379	100 %	0 %	0 %	0 %	344201187
55123	NC_015942	CAAC	2	8	3048460	3048467	50 %	0 %	0 %	50 %	344201187
55124	NC_015942	ACCAG	2	10	3048492	3048501	40 %	0 %	20 %	40 %	344201187
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55128	NC_015942	CAA	2	6	3048638	3048643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201187
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55130	NC_015942	GTTTT	2	10	3049378	3049387	0 %	80 %	20 %	0 %	344201188
55131	NC_015942	CGG	2	6	3049389	3049394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201188
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55134	NC_015942	TAG	2	6	3049580	3049585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201188
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55141	NC_015942	T	6	6	3050001	3050006	0 %	100 %	0 %	0 %	344201189
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55145	NC_015942	TGC	2	6	3050269	3050274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201190
55146	NC_015942	TCCG	2	8	3050282	3050289	0 %	25 %	25 %	50 %	344201190
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55150	NC_015942	GCA	2	6	3050579	3050584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201190
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55157	NC_015942	GC	3	6	3051382	3051387	0 %	0 %	50 %	50 %	344201192
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55181	NC_015942	ACATG	2	10	3052568	3052577	40 %	20 %	20 %	20 %	344201195
55182	NC_015942	CCA	2	6	3052579	3052584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201195
55183	NC_015942	ATG	2	6	3052690	3052695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201195
55184	NC_015942	CTT	2	6	3052704	3052709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201195
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55215	NC_015942	CAT	3	9	3053971	3053979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
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55218	NC_015942	GCA	2	6	3054247	3054252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
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55220	NC_015942	T	6	6	3054321	3054326	0 %	100 %	0 %	0 %	344201196
55221	NC_015942	A	6	6	3054378	3054383	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
55222	NC_015942	A	6	6	3054398	3054403	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
55223	NC_015942	GAC	2	6	3054790	3054795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
55224	NC_015942	GGC	2	6	3054796	3054801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201196
55225	NC_015942	GGAT	2	8	3054841	3054848	25 %	25 %	50 %	0 %	344201196
55226	NC_015942	ATG	2	6	3054935	3054940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201196
55227	NC_015942	CCT	2	6	3054949	3054954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201196
55228	NC_015942	CCG	2	6	3055006	3055011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201196
55229	NC_015942	CCCA	2	8	3055069	3055076	25 %	0 %	0 %	75 %	344201196
55230	NC_015942	AT	3	6	3055101	3055106	50 %	50 %	0 %	0 %	344201196
55231	NC_015942	CAG	2	6	3055184	3055189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
55232	NC_015942	A	6	6	3055215	3055220	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
55233	NC_015942	TGTGC	2	10	3055228	3055237	0 %	40 %	40 %	20 %	344201196
55234	NC_015942	CCT	2	6	3055240	3055245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201196
55235	NC_015942	GCA	2	6	3055251	3055256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201196
55236	NC_015942	A	6	6	3055256	3055261	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
55237	NC_015942	TGCC	2	8	3055280	3055287	0 %	25 %	25 %	50 %	344201196
55238	NC_015942	TCA	2	6	3055302	3055307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201196
55239	NC_015942	A	7	7	3055307	3055313	100 %	0 %	0 %	0 %	344201196
55240	NC_015942	TGA	2	6	3055327	3055332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201196
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55242	NC_015942	TTGA	2	8	3055468	3055475	25 %	50 %	25 %	0 %	344201196
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55250	NC_015942	TGA	2	6	3055779	3055784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201196
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55260	NC_015942	C	6	6	3056216	3056221	0 %	0 %	0 %	100 %	344201197
55261	NC_015942	GCT	2	6	3056226	3056231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201197
55262	NC_015942	GC	3	6	3056259	3056264	0 %	0 %	50 %	50 %	344201197
55263	NC_015942	ACTG	2	8	3056288	3056295	25 %	25 %	25 %	25 %	344201197
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55322	NC_015942	TGC	2	6	3059622	3059627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201199
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55337	NC_015942	GAATC	2	10	3060760	3060769	40 %	20 %	20 %	20 %	344201200
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55342	NC_015942	AGC	2	6	3060901	3060906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
55343	NC_015942	GA	3	6	3060913	3060918	50 %	0 %	50 %	0 %	344201200
55344	NC_015942	CAT	2	6	3060942	3060947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
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55346	NC_015942	GC	3	6	3060991	3060996	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
55347	NC_015942	CTTG	2	8	3061031	3061038	0 %	50 %	25 %	25 %	344201200
55348	NC_015942	TCA	2	6	3061123	3061128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
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55350	NC_015942	CGG	2	6	3061233	3061238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201200
55351	NC_015942	TGG	2	6	3061268	3061273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201200
55352	NC_015942	GAA	2	6	3061287	3061292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201200
55353	NC_015942	CAT	2	6	3061322	3061327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201200
55354	NC_015942	CGCCGG	2	12	3061328	3061339	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
55355	NC_015942	TGC	2	6	3061390	3061395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
55356	NC_015942	GTC	2	6	3061461	3061466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
55357	NC_015942	TGC	2	6	3061519	3061524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201200
55358	NC_015942	GCA	2	6	3061531	3061536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201200
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55362	NC_015942	GC	3	6	3061668	3061673	0 %	0 %	50 %	50 %	344201200
55363	NC_015942	GT	3	6	3061714	3061719	0 %	50 %	50 %	0 %	344201200
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55372	NC_015942	TGG	2	6	3062027	3062032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201200
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55451	NC_015942	CCA	2	6	3065641	3065646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201207
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55453	NC_015942	GCC	3	9	3065738	3065746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201207
55454	NC_015942	CCA	2	6	3065761	3065766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201207
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55456	NC_015942	CCG	2	6	3065797	3065802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201207
55457	NC_015942	CG	3	6	3065824	3065829	0 %	0 %	50 %	50 %	344201207
55458	NC_015942	CTGT	2	8	3065908	3065915	0 %	50 %	25 %	25 %	344201208
55459	NC_015942	GGTCA	2	10	3065954	3065963	20 %	20 %	40 %	20 %	344201208
55460	NC_015942	GGC	2	6	3065996	3066001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201208
55461	NC_015942	TGG	2	6	3066032	3066037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201208
55462	NC_015942	ACCG	2	8	3066041	3066048	25 %	0 %	25 %	50 %	344201208
55463	NC_015942	CGG	2	6	3066052	3066057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201208
55464	NC_015942	GAC	2	6	3066146	3066151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201208
55465	NC_015942	ATG	2	6	3066156	3066161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201208
55466	NC_015942	GAT	2	6	3066198	3066203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201209
55467	NC_015942	CGA	2	6	3066206	3066211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201209
55468	NC_015942	CGC	2	6	3066243	3066248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201209
55469	NC_015942	CG	3	6	3066251	3066256	0 %	0 %	50 %	50 %	344201209
55470	NC_015942	CTT	2	6	3066322	3066327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201209
55471	NC_015942	ACC	2	6	3066346	3066351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201209
55472	NC_015942	T	6	6	3066401	3066406	0 %	100 %	0 %	0 %	344201209
55473	NC_015942	CG	3	6	3066426	3066431	0 %	0 %	50 %	50 %	344201210
55474	NC_015942	CAT	2	6	3066451	3066456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201210
55475	NC_015942	CCG	2	6	3066457	3066462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201210
55476	NC_015942	TCC	2	6	3066717	3066722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201210
55477	NC_015942	TTC	2	6	3066767	3066772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201210
55478	NC_015942	ATCC	2	8	3066775	3066782	25 %	25 %	0 %	50 %	344201210
55479	NC_015942	TGA	2	6	3066790	3066795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201210
55480	NC_015942	CGTT	2	8	3066798	3066805	0 %	50 %	25 %	25 %	344201210
55481	NC_015942	CATA	2	8	3066843	3066850	50 %	25 %	0 %	25 %	344201210
55482	NC_015942	GTT	2	6	3066866	3066871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201210
55483	NC_015942	CCGT	2	8	3066936	3066943	0 %	25 %	25 %	50 %	344201210
55484	NC_015942	GGC	2	6	3066950	3066955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201210
55485	NC_015942	TA	3	6	3067015	3067020	50 %	50 %	0 %	0 %	344201210
55486	NC_015942	CATCGG	2	12	3067060	3067071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201210
55487	NC_015942	GCA	2	6	3067139	3067144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201210
55488	NC_015942	CTG	2	6	3067198	3067203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201210
55489	NC_015942	GGCA	2	8	3067304	3067311	25 %	0 %	50 %	25 %	344201210
55490	NC_015942	GCG	3	9	3067543	3067551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201210
55491	NC_015942	ACGC	2	8	3067593	3067600	25 %	0 %	25 %	50 %	344201210
55492	NC_015942	GC	4	8	3067609	3067616	0 %	0 %	50 %	50 %	344201210
55493	NC_015942	TCC	2	6	3067641	3067646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201210
55494	NC_015942	GC	3	6	3067698	3067703	0 %	0 %	50 %	50 %	344201210
55495	NC_015942	TGC	2	6	3067722	3067727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201210
55496	NC_015942	GGC	2	6	3067730	3067735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201210
55497	NC_015942	ATG	2	6	3067755	3067760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201210
55498	NC_015942	CAG	2	6	3067796	3067801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201210
55499	NC_015942	GCG	2	6	3067802	3067807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201210
55500	NC_015942	GTC	2	6	3067843	3067848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201210

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