MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_015942	CAT	3	9	2981480	2981488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201120
54002	NC_015942	CGA	2	6	2981494	2981499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201120
54003	NC_015942	GCC	2	6	2981508	2981513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201120
54004	NC_015942	CTT	2	6	2981525	2981530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201120
54005	NC_015942	ATC	2	6	2981559	2981564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201120
54006	NC_015942	GCG	2	6	2981708	2981713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201121
54007	NC_015942	TGA	2	6	2981714	2981719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201121
54008	NC_015942	TTCC	2	8	2981750	2981757	0 %	50 %	0 %	50 %	344201121
54009	NC_015942	CAT	2	6	2981835	2981840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201121
54010	NC_015942	GCC	2	6	2981895	2981900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201121
54011	NC_015942	TGGC	2	8	2982109	2982116	0 %	25 %	50 %	25 %	344201121
54012	NC_015942	TCA	2	6	2982173	2982178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201121
54013	NC_015942	GTT	2	6	2982218	2982223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201122
54014	NC_015942	CTGACC	2	12	2982227	2982238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	344201122
54015	NC_015942	CGG	2	6	2982256	2982261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201122
54016	NC_015942	TGT	2	6	2982334	2982339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201122
54017	NC_015942	CCT	2	6	2982367	2982372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201122
54018	NC_015942	TCG	2	6	2982460	2982465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54019	NC_015942	TTCA	2	8	2982482	2982489	25 %	50 %	0 %	25 %	344201122
54020	NC_015942	CGC	2	6	2982512	2982517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201122
54021	NC_015942	CGC	2	6	2982529	2982534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201122
54022	NC_015942	TAC	2	6	2982586	2982591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
54023	NC_015942	TCA	2	6	2982679	2982684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
54024	NC_015942	ATGG	2	8	2982755	2982762	25 %	25 %	50 %	0 %	344201122
54025	NC_015942	CCT	2	6	2982780	2982785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201122
54026	NC_015942	CT	3	6	2982823	2982828	0 %	50 %	0 %	50 %	344201122
54027	NC_015942	TGC	2	6	2982838	2982843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54028	NC_015942	CGA	2	6	2982928	2982933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54029	NC_015942	AGAT	2	8	2983017	2983024	50 %	25 %	25 %	0 %	344201122
54030	NC_015942	T	6	6	2983028	2983033	0 %	100 %	0 %	0 %	344201122
54031	NC_015942	TCA	2	6	2983054	2983059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
54032	NC_015942	ACC	2	6	2983200	2983205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201122
54033	NC_015942	GCG	2	6	2983234	2983239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201122
54034	NC_015942	TGC	3	9	2983245	2983253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54035	NC_015942	TCA	2	6	2983270	2983275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201122
54036	NC_015942	CTG	2	6	2983316	2983321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54037	NC_015942	GCC	2	6	2983443	2983448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201122
54038	NC_015942	CTT	2	6	2983463	2983468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201122
54039	NC_015942	TGG	2	6	2983552	2983557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201122
54040	NC_015942	TTC	2	6	2983566	2983571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201122
54041	NC_015942	GCTG	2	8	2983612	2983619	0 %	25 %	50 %	25 %	344201122
54042	NC_015942	GAT	2	6	2983622	2983627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201122
54043	NC_015942	GCA	2	6	2983647	2983652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201122
54044	NC_015942	CCA	2	6	2983700	2983705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201122
54045	NC_015942	TACC	2	8	2983726	2983733	25 %	25 %	0 %	50 %	344201122
54046	NC_015942	TGGT	2	8	2983892	2983899	0 %	50 %	50 %	0 %	344201123
54047	NC_015942	GCC	2	6	2984417	2984422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201123
54048	NC_015942	TG	3	6	2984433	2984438	0 %	50 %	50 %	0 %	344201123
54049	NC_015942	GCG	2	6	2984471	2984476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
54050	NC_015942	CGG	2	6	2984502	2984507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
54051	NC_015942	GCG	2	6	2984508	2984513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
54052	NC_015942	TGG	2	6	2984527	2984532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201123
54053	NC_015942	GGC	2	6	2984561	2984566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
54054	NC_015942	GCC	2	6	2984584	2984589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201123
54055	NC_015942	GGCT	2	8	2984600	2984607	0 %	25 %	50 %	25 %	344201123
54056	NC_015942	CTG	2	6	2984650	2984655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201123
54057	NC_015942	TTG	2	6	2984749	2984754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201123
54058	NC_015942	CTG	2	6	2984760	2984765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201123
54059	NC_015942	GCTC	2	8	2984782	2984789	0 %	25 %	25 %	50 %	344201123
54060	NC_015942	AGG	2	6	2984812	2984817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201123
54061	NC_015942	CGG	2	6	2984818	2984823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201123
54062	NC_015942	CGT	2	6	2984842	2984847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201123
54063	NC_015942	ACG	2	6	2984884	2984889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201123
54064	NC_015942	CAT	2	6	2984890	2984895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201123
54065	NC_015942	ATT	2	6	2985048	2985053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201124
54066	NC_015942	CGC	2	6	2985093	2985098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201124
54067	NC_015942	TTCGC	2	10	2985110	2985119	0 %	40 %	20 %	40 %	344201124
54068	NC_015942	A	6	6	2985123	2985128	100 %	0 %	0 %	0 %	344201124
54069	NC_015942	GTA	2	6	2985297	2985302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201124
54070	NC_015942	ATC	2	6	2985388	2985393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201124
54071	NC_015942	CTG	2	6	2985396	2985401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201124
54072	NC_015942	GCC	2	6	2985544	2985549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201125
54073	NC_015942	GTT	2	6	2985596	2985601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201125
54074	NC_015942	ACACC	2	10	2985622	2985631	40 %	0 %	0 %	60 %	344201125
54075	NC_015942	GAT	2	6	2985677	2985682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201125
54076	NC_015942	CTT	2	6	2985706	2985711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201125
54077	NC_015942	CTG	2	6	2985731	2985736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201125
54078	NC_015942	GTC	2	6	2985740	2985745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201125
54079	NC_015942	ATCT	2	8	2985777	2985784	25 %	50 %	0 %	25 %	344201126
54080	NC_015942	CTT	2	6	2985799	2985804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201126
54081	NC_015942	GCT	2	6	2985857	2985862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201126
54082	NC_015942	GATG	2	8	2985886	2985893	25 %	25 %	50 %	0 %	344201126
54083	NC_015942	TGC	2	6	2985902	2985907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201126
54084	NC_015942	CTG	2	6	2985979	2985984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201126
54085	NC_015942	GTG	2	6	2985993	2985998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201126
54086	NC_015942	CGC	2	6	2986245	2986250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201126
54087	NC_015942	CGG	2	6	2986338	2986343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201126
54088	NC_015942	ATC	2	6	2986510	2986515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201126
54089	NC_015942	GTG	2	6	2986647	2986652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201127
54090	NC_015942	GAT	2	6	2986699	2986704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201127
54091	NC_015942	GTC	2	6	2986800	2986805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201127
54092	NC_015942	CG	3	6	2986870	2986875	0 %	0 %	50 %	50 %	344201127
54093	NC_015942	GCC	2	6	2986948	2986953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201127
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54096	NC_015942	TGA	2	6	2987116	2987121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201127
54097	NC_015942	CGG	2	6	2987122	2987127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201127
54098	NC_015942	AGGC	2	8	2987235	2987242	25 %	0 %	50 %	25 %	344201127
54099	NC_015942	GCG	2	6	2987308	2987313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201127
54100	NC_015942	CAG	2	6	2987357	2987362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201127
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54102	NC_015942	GCA	2	6	2987455	2987460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201127
54103	NC_015942	TGG	2	6	2987461	2987466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201127
54104	NC_015942	CGT	2	6	2987516	2987521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201127
54105	NC_015942	TGC	2	6	2987532	2987537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201127
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54108	NC_015942	GCGG	2	8	2987582	2987589	0 %	0 %	75 %	25 %	344201127
54109	NC_015942	CGG	2	6	2987610	2987615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201127
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54112	NC_015942	AGCC	2	8	2987756	2987763	25 %	0 %	25 %	50 %	344201127
54113	NC_015942	TGC	2	6	2987773	2987778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201127
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54115	NC_015942	GCA	2	6	2987806	2987811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201127
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54220	NC_015942	GC	3	6	2994397	2994402	0 %	0 %	50 %	50 %	344201135
54221	NC_015942	ATCT	2	8	2994451	2994458	25 %	50 %	0 %	25 %	344201135
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54228	NC_015942	AAGT	2	8	2995379	2995386	50 %	25 %	25 %	0 %	344201136
54229	NC_015942	CAA	2	6	2995402	2995407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201136
54230	NC_015942	CAC	2	6	2995428	2995433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201136
54231	NC_015942	TG	3	6	2995437	2995442	0 %	50 %	50 %	0 %	344201136
54232	NC_015942	AG	3	6	2995450	2995455	50 %	0 %	50 %	0 %	344201136
54233	NC_015942	ATC	2	6	2995468	2995473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201136
54234	NC_015942	GAA	2	6	2995551	2995556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201136
54235	NC_015942	GATT	2	8	2995572	2995579	25 %	50 %	25 %	0 %	344201136
54236	NC_015942	GTCGC	2	10	2995600	2995609	0 %	20 %	40 %	40 %	344201136
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54238	NC_015942	TGC	2	6	2995634	2995639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201136
54239	NC_015942	TGC	2	6	2995642	2995647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201136
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54242	NC_015942	TCG	2	6	2996250	2996255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201137
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54244	NC_015942	CGG	2	6	2996277	2996282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201137
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54247	NC_015942	TTC	3	9	2996452	2996460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201138
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54251	NC_015942	TGA	2	6	2996604	2996609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201138
54252	NC_015942	TATC	2	8	2996637	2996644	25 %	50 %	0 %	25 %	344201138
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54254	NC_015942	GGC	3	9	2996806	2996814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201139
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54258	NC_015942	CCA	2	6	2996887	2996892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201139
54259	NC_015942	A	6	6	2996918	2996923	100 %	0 %	0 %	0 %	344201139
54260	NC_015942	CCGT	2	8	2996984	2996991	0 %	25 %	25 %	50 %	344201139
54261	NC_015942	T	6	6	2997094	2997099	0 %	100 %	0 %	0 %	344201139
54262	NC_015942	CTT	2	6	2997100	2997105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201139
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54300	NC_015942	CA	3	6	2999061	2999066	50 %	0 %	0 %	50 %	344201140
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54317	NC_015942	GCC	2	6	3000311	3000316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201142
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54321	NC_015942	GCTG	2	8	3000437	3000444	0 %	25 %	50 %	25 %	344201142
54322	NC_015942	GCG	2	6	3000478	3000483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201142
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54324	NC_015942	T	7	7	3000527	3000533	0 %	100 %	0 %	0 %	344201142
54325	NC_015942	TTTC	2	8	3000547	3000554	0 %	75 %	0 %	25 %	344201142
54326	NC_015942	CGA	2	6	3000758	3000763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201142
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54328	NC_015942	TGT	2	6	3000863	3000868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201142
54329	NC_015942	CCTC	2	8	3001170	3001177	0 %	25 %	0 %	75 %	344201143
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54331	NC_015942	GCA	2	6	3001339	3001344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201143
54332	NC_015942	AAC	2	6	3001441	3001446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201144
54333	NC_015942	AACG	2	8	3001756	3001763	50 %	0 %	25 %	25 %	344201145
54334	NC_015942	ATG	2	6	3001764	3001769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201145
54335	NC_015942	GCA	2	6	3001885	3001890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201145
54336	NC_015942	TTG	2	6	3001896	3001901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201145
54337	NC_015942	TCG	2	6	3001908	3001913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201145
54338	NC_015942	GA	3	6	3001939	3001944	50 %	0 %	50 %	0 %	344201145
54339	NC_015942	CCG	2	6	3002104	3002109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201145
54340	NC_015942	A	6	6	3002112	3002117	100 %	0 %	0 %	0 %	344201145
54341	NC_015942	CCT	2	6	3002125	3002130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201145
54342	NC_015942	A	7	7	3002134	3002140	100 %	0 %	0 %	0 %	344201145
54343	NC_015942	ACA	2	6	3002389	3002394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201146
54344	NC_015942	CA	3	6	3002439	3002444	50 %	0 %	0 %	50 %	344201146
54345	NC_015942	CAGAA	2	10	3002456	3002465	60 %	0 %	20 %	20 %	344201146
54346	NC_015942	TCG	2	6	3002507	3002512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201146
54347	NC_015942	TC	3	6	3002516	3002521	0 %	50 %	0 %	50 %	344201146
54348	NC_015942	GAAG	2	8	3002544	3002551	50 %	0 %	50 %	0 %	344201146
54349	NC_015942	CTTC	2	8	3002667	3002674	0 %	50 %	0 %	50 %	344201147
54350	NC_015942	CAT	2	6	3002707	3002712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201147
54351	NC_015942	CGA	2	6	3002717	3002722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201147
54352	NC_015942	GCC	2	6	3002750	3002755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201147
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54355	NC_015942	GTA	2	6	3002909	3002914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201147
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54358	NC_015942	CAA	2	6	3002992	3002997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201147
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54373	NC_015942	T	6	6	3003514	3003519	0 %	100 %	0 %	0 %	344201147
54374	NC_015942	CTT	2	6	3003541	3003546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201147
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54457	NC_015942	GCC	2	6	3008621	3008626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201152
54458	NC_015942	GCCG	2	8	3008737	3008744	0 %	0 %	50 %	50 %	344201152
54459	NC_015942	CCA	2	6	3008787	3008792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201152
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54462	NC_015942	GACC	2	8	3008853	3008860	25 %	0 %	25 %	50 %	344201152
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54464	NC_015942	TCA	2	6	3008931	3008936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201152
54465	NC_015942	CCT	2	6	3008949	3008954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201152
54466	NC_015942	G	6	6	3009076	3009081	0 %	0 %	100 %	0 %	344201152
54467	NC_015942	GCG	2	6	3009116	3009121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201152
54468	NC_015942	CCT	2	6	3009135	3009140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201152
54469	NC_015942	CGG	2	6	3009154	3009159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201152
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54471	NC_015942	TGC	2	6	3009344	3009349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201152
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54476	NC_015942	CAT	2	6	3009591	3009596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201152
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54480	NC_015942	GAT	2	6	3009708	3009713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201152
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54484	NC_015942	GAC	2	6	3009870	3009875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201152
54485	NC_015942	GC	3	6	3009880	3009885	0 %	0 %	50 %	50 %	344201152
54486	NC_015942	CCA	2	6	3009891	3009896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201152
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54490	NC_015942	CG	3	6	3010129	3010134	0 %	0 %	50 %	50 %	344201152
54491	NC_015942	CTGA	2	8	3010204	3010211	25 %	25 %	25 %	25 %	344201152
54492	NC_015942	GTG	2	6	3010274	3010279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201152
54493	NC_015942	CGC	2	6	3010296	3010301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201152
54494	NC_015942	CGA	2	6	3010320	3010325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201152
54495	NC_015942	CTG	2	6	3010335	3010340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201152
54496	NC_015942	CTG	2	6	3010375	3010380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201152
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