MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_015942	ATTT	2	8	2956107	2956114	25 %	75 %	0 %	0 %	344201090
53502	NC_015942	CTC	2	6	2956151	2956156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201090
53503	NC_015942	CTC	2	6	2956173	2956178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201090
53504	NC_015942	GCT	2	6	2956203	2956208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201090
53505	NC_015942	GCT	2	6	2956215	2956220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201090
53506	NC_015942	AGC	2	6	2956241	2956246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201090
53507	NC_015942	ATC	2	6	2956373	2956378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201091
53508	NC_015942	TCG	2	6	2956398	2956403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201091
53509	NC_015942	GCA	2	6	2956489	2956494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201091
53510	NC_015942	CGC	2	6	2956531	2956536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201091
53511	NC_015942	TGC	2	6	2956584	2956589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201091
53512	NC_015942	A	6	6	2956669	2956674	100 %	0 %	0 %	0 %	344201091
53513	NC_015942	ATT	2	6	2956734	2956739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201091
53514	NC_015942	AAAG	2	8	2956750	2956757	75 %	0 %	25 %	0 %	344201091
53515	NC_015942	AGG	2	6	2956761	2956766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201091
53516	NC_015942	CGT	2	6	2956795	2956800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201091
53517	NC_015942	GACC	2	8	2956806	2956813	25 %	0 %	25 %	50 %	344201091
53518	NC_015942	GGTT	2	8	2956823	2956830	0 %	50 %	50 %	0 %	344201091
53519	NC_015942	AGC	2	6	2956965	2956970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201091
53520	NC_015942	GGC	2	6	2956979	2956984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201091
53521	NC_015942	ATC	2	6	2957027	2957032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201091
53522	NC_015942	ATA	2	6	2957127	2957132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201091
53523	NC_015942	CCCT	2	8	2957134	2957141	0 %	25 %	0 %	75 %	344201091
53524	NC_015942	CTAC	2	8	2957265	2957272	25 %	25 %	0 %	50 %	344201091
53525	NC_015942	A	6	6	2957315	2957320	100 %	0 %	0 %	0 %	344201092
53526	NC_015942	GCC	2	6	2957370	2957375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201092
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53528	NC_015942	CGG	2	6	2957420	2957425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201092
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53530	NC_015942	CTTTGA	2	12	2957438	2957449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	344201092
53531	NC_015942	GAAA	2	8	2957549	2957556	75 %	0 %	25 %	0 %	344201092
53532	NC_015942	ATT	2	6	2957569	2957574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201092
53533	NC_015942	CCA	2	6	2957677	2957682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201092
53534	NC_015942	GGC	2	6	2957695	2957700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201092
53535	NC_015942	ATC	2	6	2957707	2957712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201092
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53538	NC_015942	ATG	2	6	2957871	2957876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201092
53539	NC_015942	GA	3	6	2957878	2957883	50 %	0 %	50 %	0 %	344201092
53540	NC_015942	GGC	2	6	2957901	2957906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201092
53541	NC_015942	TCAA	2	8	2958118	2958125	50 %	25 %	0 %	25 %	344201092
53542	NC_015942	CG	3	6	2958129	2958134	0 %	0 %	50 %	50 %	344201092
53543	NC_015942	ACC	2	6	2958171	2958176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201092
53544	NC_015942	TCAACG	2	12	2958202	2958213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	344201092
53545	NC_015942	TGG	2	6	2958238	2958243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201092
53546	NC_015942	CGCTAT	2	12	2958420	2958431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344201092
53547	NC_015942	CTA	3	9	2958518	2958526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201092
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53549	NC_015942	CGG	2	6	2958645	2958650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201093
53550	NC_015942	T	7	7	2958682	2958688	0 %	100 %	0 %	0 %	344201093
53551	NC_015942	TGC	2	6	2958887	2958892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201093
53552	NC_015942	ATCC	2	8	2958945	2958952	25 %	25 %	0 %	50 %	344201093
53553	NC_015942	A	6	6	2959017	2959022	100 %	0 %	0 %	0 %	344201093
53554	NC_015942	AT	3	6	2959034	2959039	50 %	50 %	0 %	0 %	344201094
53555	NC_015942	TTA	2	6	2959042	2959047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344201094
53556	NC_015942	A	6	6	2959049	2959054	100 %	0 %	0 %	0 %	344201094
53557	NC_015942	GAC	2	6	2959190	2959195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201095
53558	NC_015942	CATTCG	2	12	2959216	2959227	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	344201095
53559	NC_015942	GAT	2	6	2959237	2959242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201095
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53567	NC_015942	TA	3	6	2959803	2959808	50 %	50 %	0 %	0 %	344201096
53568	NC_015942	CGT	2	6	2959943	2959948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201096
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53573	NC_015942	CCCG	2	8	2960092	2960099	0 %	0 %	25 %	75 %	344201097
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53580	NC_015942	GTC	2	6	2960510	2960515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201097
53581	NC_015942	CGTAT	2	10	2960567	2960576	20 %	40 %	20 %	20 %	344201097
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53587	NC_015942	GCC	2	6	2960918	2960923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201098
53588	NC_015942	AT	3	6	2961046	2961051	50 %	50 %	0 %	0 %	344201098
53589	NC_015942	CAA	2	6	2961057	2961062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344201098
53590	NC_015942	A	6	6	2961067	2961072	100 %	0 %	0 %	0 %	344201098
53591	NC_015942	TA	3	6	2961099	2961104	50 %	50 %	0 %	0 %	344201098
53592	NC_015942	GAT	2	6	2961253	2961258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201099
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53599	NC_015942	CAAC	2	8	2961479	2961486	50 %	0 %	0 %	50 %	344201100
53600	NC_015942	ATG	2	6	2961502	2961507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201100
53601	NC_015942	TGA	2	6	2961545	2961550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201100
53602	NC_015942	CAT	2	6	2961603	2961608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201100
53603	NC_015942	GTA	2	6	2961781	2961786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201101
53604	NC_015942	CCA	3	9	2961818	2961826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201101
53605	NC_015942	CGC	2	6	2961838	2961843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201101
53606	NC_015942	GAC	2	6	2961848	2961853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
53607	NC_015942	AGA	2	6	2961858	2961863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201101
53608	NC_015942	T	6	6	2961888	2961893	0 %	100 %	0 %	0 %	344201101
53609	NC_015942	CAG	2	6	2961960	2961965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
53610	NC_015942	GCCCA	2	10	2962066	2962075	20 %	0 %	20 %	60 %	344201101
53611	NC_015942	ATGCCG	2	12	2962077	2962088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344201101
53612	NC_015942	CAG	2	6	2962094	2962099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201101
53613	NC_015942	CCA	2	6	2962175	2962180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201101
53614	NC_015942	GCC	2	6	2962190	2962195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201101
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53616	NC_015942	TTC	2	6	2962286	2962291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201101
53617	NC_015942	CAT	2	6	2962462	2962467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201102
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53730	NC_015942	TGGC	2	8	2968089	2968096	0 %	25 %	50 %	25 %	344201109
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53733	NC_015942	GCC	2	6	2968229	2968234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201109
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53844	NC_015942	TGC	2	6	2973579	2973584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201112
53845	NC_015942	GAT	2	6	2973637	2973642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201112
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53963	NC_015942	CTGA	2	8	2979922	2979929	25 %	25 %	25 %	25 %	344201118
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53991	NC_015942	TGA	2	6	2981266	2981271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201120
53992	NC_015942	GTA	2	6	2981285	2981290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201120
53993	NC_015942	CCG	2	6	2981304	2981309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201120
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