MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_015942	TGC	2	6	2896564	2896569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201014
52502	NC_015942	ATTC	2	8	2896611	2896618	25 %	50 %	0 %	25 %	344201014
52503	NC_015942	TTC	2	6	2896738	2896743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201014
52504	NC_015942	GC	3	6	2896816	2896821	0 %	0 %	50 %	50 %	344201014
52505	NC_015942	CGA	2	6	2896845	2896850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201014
52506	NC_015942	CCA	2	6	2896854	2896859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201014
52507	NC_015942	TGGG	2	8	2896916	2896923	0 %	25 %	75 %	0 %	344201014
52508	NC_015942	CAC	2	6	2896951	2896956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201014
52509	NC_015942	GGCG	2	8	2896977	2896984	0 %	0 %	75 %	25 %	344201014
52510	NC_015942	GGA	2	6	2897016	2897021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344201014
52511	NC_015942	ACT	2	6	2897089	2897094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201014
52512	NC_015942	CCG	2	6	2897121	2897126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201014
52513	NC_015942	GGC	2	6	2897137	2897142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201014
52514	NC_015942	A	6	6	2897179	2897184	100 %	0 %	0 %	0 %	344201014
52515	NC_015942	T	7	7	2897220	2897226	0 %	100 %	0 %	0 %	344201014
52516	NC_015942	CCG	2	6	2897259	2897264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201014
52517	NC_015942	GCA	2	6	2897277	2897282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201014
52518	NC_015942	TCCCGC	2	12	2897285	2897296	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	344201014
52519	NC_015942	GTA	2	6	2897372	2897377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201014
52520	NC_015942	GCT	2	6	2897396	2897401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201015
52521	NC_015942	CGCC	2	8	2897447	2897454	0 %	0 %	25 %	75 %	344201015
52522	NC_015942	GCC	2	6	2897473	2897478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201015
52523	NC_015942	CGC	2	6	2897507	2897512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201015
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52531	NC_015942	GC	3	6	2897763	2897768	0 %	0 %	50 %	50 %	344201015
52532	NC_015942	ACC	2	6	2897778	2897783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201015
52533	NC_015942	GTCG	2	8	2897874	2897881	0 %	25 %	50 %	25 %	344201015
52534	NC_015942	GCG	2	6	2897997	2898002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201016
52535	NC_015942	ACT	2	6	2898005	2898010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201016
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52538	NC_015942	CCAT	2	8	2898105	2898112	25 %	25 %	0 %	50 %	344201016
52539	NC_015942	GC	3	6	2898138	2898143	0 %	0 %	50 %	50 %	344201016
52540	NC_015942	CGC	2	6	2898318	2898323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201017
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52542	NC_015942	GC	3	6	2898357	2898362	0 %	0 %	50 %	50 %	344201017
52543	NC_015942	CTC	2	6	2898447	2898452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201017
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52550	NC_015942	CCA	2	6	2898725	2898730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201017
52551	NC_015942	TGA	2	6	2898737	2898742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201017
52552	NC_015942	CAC	2	6	2898777	2898782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201017
52553	NC_015942	CGT	2	6	2898806	2898811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201017
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52555	NC_015942	CAT	2	6	2899141	2899146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201018
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52561	NC_015942	C	6	6	2899624	2899629	0 %	0 %	0 %	100 %	344201018
52562	NC_015942	GCT	2	6	2899695	2899700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201018
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52567	NC_015942	CCCG	2	8	2899900	2899907	0 %	0 %	25 %	75 %	344201018
52568	NC_015942	ACT	2	6	2899977	2899982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201018
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52599	NC_015942	GGTGC	2	10	2902760	2902769	0 %	20 %	60 %	20 %	344201023
52600	NC_015942	GGCG	2	8	2902834	2902841	0 %	0 %	75 %	25 %	344201023
52601	NC_015942	GGC	2	6	2902871	2902876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201023
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52605	NC_015942	GCAT	2	8	2903064	2903071	25 %	25 %	25 %	25 %	344201023
52606	NC_015942	GCTG	2	8	2903131	2903138	0 %	25 %	50 %	25 %	344201023
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52610	NC_015942	T	6	6	2903404	2903409	0 %	100 %	0 %	0 %	344201023
52611	NC_015942	GCG	2	6	2903423	2903428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201023
52612	NC_015942	GGAC	2	8	2903521	2903528	25 %	0 %	50 %	25 %	344201023
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52615	NC_015942	CCA	2	6	2903861	2903866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201024
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52725	NC_015942	GA	3	6	2911279	2911284	50 %	0 %	50 %	0 %	344201035
52726	NC_015942	ATA	2	6	2911411	2911416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344201035
52727	NC_015942	GTG	2	6	2911420	2911425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344201035
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52729	NC_015942	ATC	2	6	2911518	2911523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201036
52730	NC_015942	GTCGTA	2	12	2911758	2911769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344201036
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52732	NC_015942	AGC	2	6	2911933	2911938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201036
52733	NC_015942	TGA	2	6	2912161	2912166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201037
52734	NC_015942	AGT	2	6	2912208	2912213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201037
52735	NC_015942	CAG	2	6	2912222	2912227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201037
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52805	NC_015942	GCA	3	9	2916264	2916272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201045
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52840	NC_015942	GCA	2	6	2918167	2918172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201045
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52842	NC_015942	GCC	2	6	2918211	2918216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201045
52843	NC_015942	TGT	2	6	2918335	2918340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344201045
52844	NC_015942	CAT	2	6	2918390	2918395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201045
52845	NC_015942	GTC	2	6	2918436	2918441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201045
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52847	NC_015942	AAAG	2	8	2918645	2918652	75 %	0 %	25 %	0 %	344201045
52848	NC_015942	CCG	2	6	2918668	2918673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344201045
52849	NC_015942	GCT	2	6	2918729	2918734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201045
52850	NC_015942	TGCT	2	8	2918753	2918760	0 %	50 %	25 %	25 %	344201045
52851	NC_015942	A	6	6	2918767	2918772	100 %	0 %	0 %	0 %	344201045
52852	NC_015942	ACC	2	6	2918831	2918836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344201045
52853	NC_015942	CTG	2	6	2918882	2918887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201045
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52865	NC_015942	CGG	2	6	2919625	2919630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201046
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52947	NC_015942	CAG	2	6	2924280	2924285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344201054
52948	NC_015942	GTC	2	6	2924358	2924363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201054
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52953	NC_015942	TGA	2	6	2924624	2924629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344201054
52954	NC_015942	CT	4	8	2924638	2924645	0 %	50 %	0 %	50 %	344201054
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52959	NC_015942	TC	3	6	2924819	2924824	0 %	50 %	0 %	50 %	344201054
52960	NC_015942	GTC	2	6	2924877	2924882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201054
52961	NC_015942	TCC	2	6	2924887	2924892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344201054
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52963	NC_015942	CGT	2	6	2924915	2924920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201054
52964	NC_015942	CGG	2	6	2924943	2924948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201054
52965	NC_015942	GTC	2	6	2924958	2924963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201054
52966	NC_015942	ATC	3	9	2924964	2924972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344201054
52967	NC_015942	TCT	2	6	2924989	2924994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344201054
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52970	NC_015942	CTTC	2	8	2925086	2925093	0 %	50 %	0 %	50 %	344201054
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52972	NC_015942	AT	3	6	2925163	2925168	50 %	50 %	0 %	0 %	344201054
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52975	NC_015942	TCTT	2	8	2925322	2925329	0 %	75 %	0 %	25 %	344201054
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52982	NC_015942	GCT	2	6	2925627	2925632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344201054
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52992	NC_015942	GGC	2	6	2925983	2925988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344201054
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53000	NC_015942	AGA	2	6	2926436	2926441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344201054

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