MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 58001

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51501	NC_015942	CAT	2	6	2846934	2846939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200955
51502	NC_015942	TCA	2	6	2846944	2846949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200955
51503	NC_015942	AAAG	2	8	2847015	2847022	75 %	0 %	25 %	0 %	344200955
51504	NC_015942	GCCAC	2	10	2847109	2847118	20 %	0 %	20 %	60 %	344200955
51505	NC_015942	TGA	2	6	2847149	2847154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200955
51506	NC_015942	A	6	6	2847192	2847197	100 %	0 %	0 %	0 %	344200955
51507	NC_015942	CGCC	2	8	2847224	2847231	0 %	0 %	25 %	75 %	344200955
51508	NC_015942	GAT	2	6	2847324	2847329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200956
51509	NC_015942	CTG	2	6	2847400	2847405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200956
51510	NC_015942	GGA	2	6	2847549	2847554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200956
51511	NC_015942	GCC	2	6	2847616	2847621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200957
51512	NC_015942	GCC	2	6	2847627	2847632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200957
51513	NC_015942	CAA	2	6	2847660	2847665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200957
51514	NC_015942	GCA	2	6	2847685	2847690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200957
51515	NC_015942	ATT	2	6	2847765	2847770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200957
51516	NC_015942	ACC	3	9	2847807	2847815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200957
51517	NC_015942	CTG	2	6	2847867	2847872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200957
51518	NC_015942	CAG	2	6	2847936	2847941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200957
51519	NC_015942	CAC	2	6	2847954	2847959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200957
51520	NC_015942	CTG	3	9	2847966	2847974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200957
51521	NC_015942	GCC	2	6	2847989	2847994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200957
51522	NC_015942	TGG	2	6	2848022	2848027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200957
51523	NC_015942	CTT	2	6	2848065	2848070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200957
51524	NC_015942	GC	3	6	2848102	2848107	0 %	0 %	50 %	50 %	344200957
51525	NC_015942	GCT	2	6	2848133	2848138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200957
51526	NC_015942	CAA	2	6	2848139	2848144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200957
51527	NC_015942	TCT	2	6	2848165	2848170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200957
51528	NC_015942	GGCA	2	8	2848176	2848183	25 %	0 %	50 %	25 %	344200957
51529	NC_015942	A	6	6	2848200	2848205	100 %	0 %	0 %	0 %	344200957
51530	NC_015942	TGC	2	6	2848253	2848258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200958
51531	NC_015942	ATGGTA	2	12	2848321	2848332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200958
51532	NC_015942	GATG	2	8	2848410	2848417	25 %	25 %	50 %	0 %	344200958
51533	NC_015942	TCACC	2	10	2848505	2848514	20 %	20 %	0 %	60 %	344200958
51534	NC_015942	CAT	2	6	2848595	2848600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200958
51535	NC_015942	GA	3	6	2848615	2848620	50 %	0 %	50 %	0 %	344200958
51536	NC_015942	CAC	2	6	2848641	2848646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200958
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51538	NC_015942	GAG	2	6	2848662	2848667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200958
51539	NC_015942	CCCA	2	8	2848678	2848685	25 %	0 %	0 %	75 %	344200958
51540	NC_015942	CAC	2	6	2848766	2848771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200959
51541	NC_015942	CAC	2	6	2848784	2848789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200959
51542	NC_015942	GGC	2	6	2848850	2848855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200959
51543	NC_015942	CAAAG	2	10	2848876	2848885	60 %	0 %	20 %	20 %	344200959
51544	NC_015942	GCC	2	6	2848955	2848960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200959
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51546	NC_015942	CCG	2	6	2848995	2849000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200959
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51549	NC_015942	CAT	2	6	2849099	2849104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200959
51550	NC_015942	CGG	2	6	2849149	2849154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200959
51551	NC_015942	CGCC	2	8	2849168	2849175	0 %	0 %	25 %	75 %	344200959
51552	NC_015942	AGC	2	6	2849184	2849189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200959
51553	NC_015942	GAA	2	6	2849309	2849314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200959
51554	NC_015942	AGC	2	6	2849315	2849320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200959
51555	NC_015942	CAG	3	9	2849330	2849338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200959
51556	NC_015942	CGC	2	6	2849435	2849440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200959
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51559	NC_015942	GCCG	2	8	2849522	2849529	0 %	0 %	50 %	50 %	344200960
51560	NC_015942	GCT	2	6	2849649	2849654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200960
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51567	NC_015942	ACC	2	6	2849862	2849867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200960
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51583	NC_015942	TCG	2	6	2850820	2850825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200961
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51598	NC_015942	T	7	7	2851526	2851532	0 %	100 %	0 %	0 %	344200962
51599	NC_015942	AAT	3	9	2851548	2851556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200962
51600	NC_015942	ATG	2	6	2851624	2851629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200962
51601	NC_015942	ATC	2	6	2851632	2851637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200962
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51607	NC_015942	TGG	2	6	2851860	2851865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200962
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51609	NC_015942	ATT	2	6	2851942	2851947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200962
51610	NC_015942	GGC	2	6	2851967	2851972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200962
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51612	NC_015942	CAGC	2	8	2852032	2852039	25 %	0 %	25 %	50 %	344200963
51613	NC_015942	GC	3	6	2852038	2852043	0 %	0 %	50 %	50 %	344200963
51614	NC_015942	GAT	2	6	2852144	2852149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200963
51615	NC_015942	CCAGCC	2	12	2852165	2852176	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	344200963
51616	NC_015942	GGC	2	6	2852181	2852186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200963
51617	NC_015942	CGG	2	6	2852230	2852235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200963
51618	NC_015942	AGC	2	6	2852257	2852262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200963
51619	NC_015942	GAC	2	6	2852280	2852285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200963
51620	NC_015942	CAC	2	6	2852297	2852302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200963
51621	NC_015942	CCA	2	6	2852308	2852313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200963
51622	NC_015942	CGG	2	6	2852354	2852359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200963
51623	NC_015942	TGC	2	6	2852446	2852451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200963
51624	NC_015942	GCA	2	6	2852456	2852461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200963
51625	NC_015942	CGC	2	6	2852538	2852543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200963
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51627	NC_015942	CAG	2	6	2852902	2852907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200964
51628	NC_015942	TGCGC	2	10	2852928	2852937	0 %	20 %	40 %	40 %	344200964
51629	NC_015942	CT	3	6	2853043	2853048	0 %	50 %	0 %	50 %	344200964
51630	NC_015942	CAC	2	6	2853103	2853108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200964
51631	NC_015942	CAG	2	6	2853166	2853171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200964
51632	NC_015942	GCC	2	6	2853218	2853223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200964
51633	NC_015942	A	8	8	2853233	2853240	100 %	0 %	0 %	0 %	344200964
51634	NC_015942	CAG	2	6	2853247	2853252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200964
51635	NC_015942	GCAG	2	8	2853281	2853288	25 %	0 %	50 %	25 %	344200964
51636	NC_015942	CAC	2	6	2853298	2853303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200964
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51638	NC_015942	ATC	2	6	2853322	2853327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200964
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51643	NC_015942	CCG	2	6	2853516	2853521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200964
51644	NC_015942	TGA	2	6	2853536	2853541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200964
51645	NC_015942	GTT	2	6	2853600	2853605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200964
51646	NC_015942	TGA	2	6	2853662	2853667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200964
51647	NC_015942	GCT	2	6	2853734	2853739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200964
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51649	NC_015942	CCG	2	6	2853840	2853845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200964
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51652	NC_015942	CGG	2	6	2854001	2854006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200964
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51659	NC_015942	T	7	7	2854243	2854249	0 %	100 %	0 %	0 %	344200965
51660	NC_015942	TCA	2	6	2854264	2854269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200965
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51665	NC_015942	GTCC	2	8	2854848	2854855	0 %	25 %	25 %	50 %	344200966
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51667	NC_015942	ACA	2	6	2854914	2854919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200966
51668	NC_015942	TGC	2	6	2855001	2855006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200966
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51672	NC_015942	TGT	2	6	2855145	2855150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200966
51673	NC_015942	CTG	2	6	2855173	2855178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51674	NC_015942	TCG	2	6	2855180	2855185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51675	NC_015942	TCC	2	6	2855207	2855212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200966
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51678	NC_015942	GCC	2	6	2855294	2855299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200966
51679	NC_015942	ATCACC	2	12	2855392	2855403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	344200966
51680	NC_015942	TGC	2	6	2855594	2855599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51681	NC_015942	GAT	2	6	2855691	2855696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200966
51682	NC_015942	CGT	2	6	2855714	2855719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51683	NC_015942	GCA	3	9	2855741	2855749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51684	NC_015942	GCA	2	6	2855879	2855884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51685	NC_015942	CG	3	6	2855899	2855904	0 %	0 %	50 %	50 %	344200966
51686	NC_015942	CAG	2	6	2856047	2856052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200966
51687	NC_015942	GC	3	6	2856135	2856140	0 %	0 %	50 %	50 %	344200966
51688	NC_015942	CATC	2	8	2856218	2856225	25 %	25 %	0 %	50 %	344200967
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51691	NC_015942	CTT	2	6	2856332	2856337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200967
51692	NC_015942	CG	3	6	2856346	2856351	0 %	0 %	50 %	50 %	344200967
51693	NC_015942	CCT	2	6	2856570	2856575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200968
51694	NC_015942	CCG	2	6	2856593	2856598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200968
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51697	NC_015942	TTC	2	6	2856743	2856748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200968
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51701	NC_015942	C	8	8	2856908	2856915	0 %	0 %	0 %	100 %	344200968
51702	NC_015942	AAG	2	6	2856978	2856983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200968
51703	NC_015942	GGGCA	2	10	2857022	2857031	20 %	0 %	60 %	20 %	344200968
51704	NC_015942	CTG	2	6	2857193	2857198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200968
51705	NC_015942	CCG	4	12	2857306	2857317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200968
51706	NC_015942	GCT	2	6	2857347	2857352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200968
51707	NC_015942	CCG	2	6	2857374	2857379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200968
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51710	NC_015942	TAA	2	6	2857431	2857436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200968
51711	NC_015942	TGCC	2	8	2857487	2857494	0 %	25 %	25 %	50 %	344200968
51712	NC_015942	TGC	2	6	2857554	2857559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200968
51713	NC_015942	CAG	2	6	2857646	2857651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200968
51714	NC_015942	TGC	2	6	2857692	2857697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200969
51715	NC_015942	CTG	2	6	2857771	2857776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200969
51716	NC_015942	G	6	6	2857953	2857958	0 %	0 %	100 %	0 %	344200969
51717	NC_015942	GGTC	2	8	2858007	2858014	0 %	25 %	50 %	25 %	344200969
51718	NC_015942	CCTGGA	2	12	2858121	2858132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344200969
51719	NC_015942	GC	3	6	2858157	2858162	0 %	0 %	50 %	50 %	344200969
51720	NC_015942	CTGCA	2	10	2858167	2858176	20 %	20 %	20 %	40 %	344200969
51721	NC_015942	CG	3	6	2858238	2858243	0 %	0 %	50 %	50 %	344200969
51722	NC_015942	GCCAGT	2	12	2858421	2858432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344200969
51723	NC_015942	ACTG	2	8	2858442	2858449	25 %	25 %	25 %	25 %	344200969
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51727	NC_015942	ATC	2	6	2858540	2858545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200969
51728	NC_015942	CCG	2	6	2858570	2858575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200969
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51730	NC_015942	AGG	2	6	2858654	2858659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200969
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51833	NC_015942	A	6	6	2863275	2863280	100 %	0 %	0 %	0 %	344200975
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51839	NC_015942	CCA	2	6	2863805	2863810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200976
51840	NC_015942	CAT	2	6	2863835	2863840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200976
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51843	NC_015942	TAA	2	6	2863940	2863945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200976
51844	NC_015942	ACCG	2	8	2863958	2863965	25 %	0 %	25 %	50 %	344200976
51845	NC_015942	TGC	2	6	2864020	2864025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200976
51846	NC_015942	CGC	2	6	2864167	2864172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200977
51847	NC_015942	GCC	2	6	2864194	2864199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200977
51848	NC_015942	TCC	2	6	2864219	2864224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200977
51849	NC_015942	CAGC	2	8	2864246	2864253	25 %	0 %	25 %	50 %	344200977
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51851	NC_015942	AT	3	6	2864419	2864424	50 %	50 %	0 %	0 %	344200977
51852	NC_015942	A	6	6	2864523	2864528	100 %	0 %	0 %	0 %	344200977
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51854	NC_015942	GC	3	6	2864607	2864612	0 %	0 %	50 %	50 %	344200977
51855	NC_015942	AT	3	6	2864632	2864637	50 %	50 %	0 %	0 %	344200977
51856	NC_015942	CCGC	2	8	2864656	2864663	0 %	0 %	25 %	75 %	344200977
51857	NC_015942	ACCC	2	8	2864736	2864743	25 %	0 %	0 %	75 %	344200977
51858	NC_015942	CACC	2	8	2864786	2864793	25 %	0 %	0 %	75 %	344200977
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51863	NC_015942	GCA	2	6	2865041	2865046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200977
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51866	NC_015942	CTG	2	6	2865229	2865234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200977
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51878	NC_015942	CGC	2	6	2865889	2865894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200978
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51881	NC_015942	CATG	2	8	2866100	2866107	25 %	25 %	25 %	25 %	344200978
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51924	NC_015942	TAA	2	6	2867787	2867792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200981
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51931	NC_015942	GCCTC	2	10	2868035	2868044	0 %	20 %	20 %	60 %	344200982
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51935	NC_015942	TCT	2	6	2868235	2868240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200982
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51944	NC_015942	CGG	2	6	2868722	2868727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200982
51945	NC_015942	AGGGC	2	10	2868739	2868748	20 %	0 %	60 %	20 %	344200982
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51947	NC_015942	CAG	2	6	2868837	2868842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200982
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51950	NC_015942	CG	3	6	2869120	2869125	0 %	0 %	50 %	50 %	344200983
51951	NC_015942	G	6	6	2869160	2869165	0 %	0 %	100 %	0 %	344200983
51952	NC_015942	CAC	2	6	2869195	2869200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200983
51953	NC_015942	AGCGCA	2	12	2869216	2869227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200983
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51955	NC_015942	CTT	2	6	2869297	2869302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200984
51956	NC_015942	CTG	2	6	2869310	2869315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200984
51957	NC_015942	CAC	2	6	2869349	2869354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200984
51958	NC_015942	GCA	2	6	2869368	2869373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200984
51959	NC_015942	GGC	2	6	2869400	2869405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200984
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51961	NC_015942	GCAGC	2	10	2869702	2869711	20 %	0 %	40 %	40 %	344200984
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51963	NC_015942	CATC	2	8	2869781	2869788	25 %	25 %	0 %	50 %	344200985
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51990	NC_015942	AAT	2	6	2870777	2870782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200986
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52000	NC_015942	TCC	2	6	2871105	2871110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200986

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