MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48118	NC_015850	TGA	2	6	2629258	2629263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783315
48119	NC_015850	CTG	2	6	2629272	2629277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783315
48120	NC_015850	ACC	2	6	2629363	2629368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783315
48121	NC_015850	CGA	2	6	2629388	2629393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783315
48122	NC_015850	GT	3	6	2629582	2629587	0 %	50 %	50 %	0 %	340783315
48123	NC_015850	GCG	2	6	2629808	2629813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783315
48124	NC_015850	ACCA	2	8	2629911	2629918	50 %	0 %	0 %	50 %	340783315
48125	NC_015850	CCTT	2	8	2629993	2630000	0 %	50 %	0 %	50 %	340783315
48126	NC_015850	TGCCC	2	10	2630120	2630129	0 %	20 %	20 %	60 %	340783315
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48128	NC_015850	GTCTGC	2	12	2630206	2630217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783315
48129	NC_015850	GGC	2	6	2630225	2630230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783315
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48131	NC_015850	GC	3	6	2630242	2630247	0 %	0 %	50 %	50 %	340783315
48132	NC_015850	TGC	2	6	2630330	2630335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783315
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48142	NC_015850	GC	3	6	2630527	2630532	0 %	0 %	50 %	50 %	340783315
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48153	NC_015850	GTATCG	2	12	2631031	2631042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340783315
48154	NC_015850	CAGCGG	2	12	2631056	2631067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340783315
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48187	NC_015850	CGA	2	6	2632530	2632535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783317
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48194	NC_015850	GGC	2	6	2632770	2632775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783317
48195	NC_015850	CCGC	2	8	2632787	2632794	0 %	0 %	25 %	75 %	340783317
48196	NC_015850	GCCGC	2	10	2632795	2632804	0 %	0 %	40 %	60 %	340783317
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48199	NC_015850	CTG	3	9	2632956	2632964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783318
48200	NC_015850	TCG	2	6	2632975	2632980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783318
48201	NC_015850	CAT	2	6	2633036	2633041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783318
48202	NC_015850	TCCGGA	2	12	2633051	2633062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783318
48203	NC_015850	GAA	2	6	2633064	2633069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783318
48204	NC_015850	GCG	2	6	2633078	2633083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783318
48205	NC_015850	CGC	2	6	2633088	2633093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783318
48206	NC_015850	CTGGCT	2	12	2633228	2633239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783318
48207	NC_015850	CCAT	2	8	2633290	2633297	25 %	25 %	0 %	50 %	340783318
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48209	NC_015850	TCC	2	6	2633405	2633410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783319
48210	NC_015850	GCT	2	6	2633421	2633426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783319
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48214	NC_015850	CTG	3	9	2633548	2633556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783319
48215	NC_015850	TGG	2	6	2633574	2633579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783319
48216	NC_015850	CTGGCT	2	12	2633629	2633640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48217	NC_015850	TCA	2	6	2633670	2633675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783320
48218	NC_015850	CGT	2	6	2633707	2633712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48219	NC_015850	GCG	2	6	2633748	2633753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783320
48220	NC_015850	TGATCC	2	12	2633754	2633765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783320
48221	NC_015850	GCA	2	6	2633773	2633778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48222	NC_015850	GCC	2	6	2633780	2633785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783320
48223	NC_015850	CGGAT	2	10	2633799	2633808	20 %	20 %	40 %	20 %	340783320
48224	NC_015850	TCG	2	6	2633835	2633840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48225	NC_015850	TGA	2	6	2633877	2633882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783320
48226	NC_015850	CATC	2	8	2633911	2633918	25 %	25 %	0 %	50 %	340783320
48227	NC_015850	CTGG	2	8	2633936	2633943	0 %	25 %	50 %	25 %	340783320
48228	NC_015850	TAT	2	6	2633963	2633968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340783320
48229	NC_015850	TCG	2	6	2633985	2633990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48230	NC_015850	CCT	2	6	2634022	2634027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783320
48231	NC_015850	CTGGG	2	10	2634038	2634047	0 %	20 %	60 %	20 %	340783320
48232	NC_015850	TCG	2	6	2634075	2634080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
48233	NC_015850	ATACC	2	10	2634190	2634199	40 %	20 %	0 %	40 %	340783320
48234	NC_015850	GAT	2	6	2634223	2634228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783320
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48237	NC_015850	GC	3	6	2634267	2634272	0 %	0 %	50 %	50 %	340783320
48238	NC_015850	GGCC	2	8	2634340	2634347	0 %	0 %	50 %	50 %	340783320
48239	NC_015850	CTG	2	6	2634416	2634421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
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48244	NC_015850	GC	3	6	2634588	2634593	0 %	0 %	50 %	50 %	340783320
48245	NC_015850	GGC	2	6	2634652	2634657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783320
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48247	NC_015850	TGC	2	6	2634732	2634737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783320
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48252	NC_015850	CTGGG	2	10	2634959	2634968	0 %	20 %	60 %	20 %	340783320
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48263	NC_015850	TCG	2	6	2635511	2635516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783321
48264	NC_015850	GGCG	2	8	2635528	2635535	0 %	0 %	75 %	25 %	340783321
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48268	NC_015850	CTG	2	6	2635717	2635722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783321
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48331	NC_015850	GCTGG	2	10	2638216	2638225	0 %	20 %	60 %	20 %	340783322
48332	NC_015850	TGG	2	6	2638491	2638496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783323
48333	NC_015850	ACG	2	6	2638502	2638507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783323
48334	NC_015850	CT	3	6	2638541	2638546	0 %	50 %	0 %	50 %	340783323
48335	NC_015850	GC	3	6	2638605	2638610	0 %	0 %	50 %	50 %	340783323
48336	NC_015850	CATC	2	8	2638640	2638647	25 %	25 %	0 %	50 %	340783323
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48338	NC_015850	GA	3	6	2638855	2638860	50 %	0 %	50 %	0 %	340783323
48339	NC_015850	CTA	2	6	2638863	2638868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783323
48340	NC_015850	CGC	2	6	2638872	2638877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783323
48341	NC_015850	T	6	6	2638878	2638883	0 %	100 %	0 %	0 %	340783323
48342	NC_015850	TGG	2	6	2638920	2638925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783323
48343	NC_015850	GCT	2	6	2638976	2638981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783323
48344	NC_015850	CTC	2	6	2638986	2638991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783323
48345	NC_015850	CCG	2	6	2639070	2639075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783323
48346	NC_015850	A	6	6	2639228	2639233	100 %	0 %	0 %	0 %	340783324
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48348	NC_015850	GC	3	6	2639364	2639369	0 %	0 %	50 %	50 %	340783324
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48461	NC_015850	GAAA	2	8	2645616	2645623	75 %	0 %	25 %	0 %	340783334
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48464	NC_015850	GC	3	6	2645771	2645776	0 %	0 %	50 %	50 %	340783334
48465	NC_015850	GGC	2	6	2645826	2645831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783334
48466	NC_015850	GCT	2	6	2645832	2645837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783334
48467	NC_015850	T	7	7	2645912	2645918	0 %	100 %	0 %	0 %	340783334
48468	NC_015850	CTG	2	6	2645932	2645937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783334
48469	NC_015850	CGC	2	6	2645997	2646002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783334
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48473	NC_015850	CTA	3	9	2646270	2646278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783334
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48475	NC_015850	CCTT	2	8	2646290	2646297	0 %	50 %	0 %	50 %	340783334
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48480	NC_015850	T	6	6	2646423	2646428	0 %	100 %	0 %	0 %	340783334
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48484	NC_015850	GC	3	6	2646552	2646557	0 %	0 %	50 %	50 %	340783334
48485	NC_015850	GCT	2	6	2646567	2646572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783334
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48491	NC_015850	TGG	2	6	2646880	2646885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783334
48492	NC_015850	GCCG	2	8	2646907	2646914	0 %	0 %	50 %	50 %	340783334
48493	NC_015850	TCC	2	6	2646968	2646973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783334
48494	NC_015850	GCG	2	6	2647029	2647034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783334
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48496	NC_015850	CTG	2	6	2647108	2647113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783334
48497	NC_015850	GCA	2	6	2647227	2647232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783335
48498	NC_015850	GGT	2	6	2647319	2647324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783335
48499	NC_015850	TGG	2	6	2647423	2647428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783335
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