MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_015850	CCA	2	6	2522863	2522868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
46003	NC_015850	CCG	2	6	2522908	2522913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
46004	NC_015850	CGG	2	6	2522983	2522988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783208
46005	NC_015850	ACC	2	6	2523000	2523005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
46006	NC_015850	TTG	2	6	2523027	2523032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783208
46007	NC_015850	CTC	2	6	2523074	2523079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
46008	NC_015850	CCT	2	6	2523127	2523132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
46009	NC_015850	GTC	2	6	2523191	2523196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46010	NC_015850	CTG	2	6	2523203	2523208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46011	NC_015850	CTT	2	6	2523226	2523231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783208
46012	NC_015850	GCTG	2	8	2523286	2523293	0 %	25 %	50 %	25 %	340783208
46013	NC_015850	GCT	2	6	2523337	2523342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46014	NC_015850	TCG	2	6	2523378	2523383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46015	NC_015850	GAT	2	6	2523386	2523391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
46016	NC_015850	CCG	2	6	2523403	2523408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
46017	NC_015850	TGA	2	6	2523421	2523426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
46018	NC_015850	TGA	2	6	2523487	2523492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
46019	NC_015850	CA	3	6	2523521	2523526	50 %	0 %	0 %	50 %	340783208
46020	NC_015850	CGC	2	6	2523596	2523601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
46021	NC_015850	AGC	2	6	2523663	2523668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46022	NC_015850	GA	4	8	2523682	2523689	50 %	0 %	50 %	0 %	340783208
46023	NC_015850	CG	3	6	2523703	2523708	0 %	0 %	50 %	50 %	340783208
46024	NC_015850	CCG	2	6	2523713	2523718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783208
46025	NC_015850	ATC	2	6	2523774	2523779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783208
46026	NC_015850	GAT	2	6	2523818	2523823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
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46028	NC_015850	TGA	2	6	2523859	2523864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783208
46029	NC_015850	CGA	2	6	2523892	2523897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46030	NC_015850	TGC	2	6	2523953	2523958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46031	NC_015850	TCC	2	6	2524071	2524076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783208
46032	NC_015850	CCA	2	6	2524087	2524092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783208
46033	NC_015850	GTG	2	6	2524110	2524115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783208
46034	NC_015850	GAC	2	6	2524142	2524147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783208
46035	NC_015850	CGTCCA	2	12	2524376	2524387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783209
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46038	NC_015850	GCA	2	6	2524685	2524690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783209
46039	NC_015850	GCC	3	9	2524720	2524728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783209
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46041	NC_015850	T	6	6	2524805	2524810	0 %	100 %	0 %	0 %	340783210
46042	NC_015850	TCG	2	6	2524828	2524833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783210
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46044	NC_015850	TGC	2	6	2530598	2530603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783211
46045	NC_015850	GCT	2	6	2530830	2530835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783211
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46047	NC_015850	CGGG	2	8	2530934	2530941	0 %	0 %	75 %	25 %	340783211
46048	NC_015850	TCC	2	6	2530961	2530966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783211
46049	NC_015850	CTG	2	6	2530996	2531001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783211
46050	NC_015850	CCG	2	6	2531034	2531039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783211
46051	NC_015850	GC	4	8	2531074	2531081	0 %	0 %	50 %	50 %	340783211
46052	NC_015850	CTC	2	6	2531097	2531102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783211
46053	NC_015850	TC	3	6	2531109	2531114	0 %	50 %	0 %	50 %	340783211
46054	NC_015850	CAC	2	6	2531152	2531157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783211
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46056	NC_015850	C	6	6	2531237	2531242	0 %	0 %	0 %	100 %	340783211
46057	NC_015850	TGGC	2	8	2531304	2531311	0 %	25 %	50 %	25 %	340783211
46058	NC_015850	T	7	7	2531452	2531458	0 %	100 %	0 %	0 %	340783212
46059	NC_015850	GCC	2	6	2531568	2531573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783212
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46062	NC_015850	CGC	2	6	2531685	2531690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783212
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46107	NC_015850	GCCTC	2	10	2533775	2533784	0 %	20 %	20 %	60 %	340783213
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46111	NC_015850	CCGC	2	8	2533995	2534002	0 %	0 %	25 %	75 %	340783214
46112	NC_015850	CGA	2	6	2534082	2534087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783214
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46116	NC_015850	TGC	2	6	2534388	2534393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783214
46117	NC_015850	GAC	2	6	2534443	2534448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783214
46118	NC_015850	CGG	2	6	2534458	2534463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783214
46119	NC_015850	AGT	2	6	2534466	2534471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783214
46120	NC_015850	GC	3	6	2534479	2534484	0 %	0 %	50 %	50 %	340783214
46121	NC_015850	G	7	7	2534518	2534524	0 %	0 %	100 %	0 %	340783214
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46123	NC_015850	GGC	2	6	2534593	2534598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783214
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46215	NC_015850	CCCA	2	8	2538222	2538229	25 %	0 %	0 %	75 %	340783218
46216	NC_015850	TAG	2	6	2538238	2538243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783218
46217	NC_015850	CCAACG	2	12	2538250	2538261	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340783218
46218	NC_015850	GCT	3	9	2538336	2538344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783218
46219	NC_015850	CCG	2	6	2538404	2538409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783218
46220	NC_015850	GC	3	6	2538473	2538478	0 %	0 %	50 %	50 %	340783218
46221	NC_015850	CAG	2	6	2538525	2538530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783218
46222	NC_015850	GCT	2	6	2538588	2538593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783218
46223	NC_015850	CCCT	2	8	2538621	2538628	0 %	25 %	0 %	75 %	340783218
46224	NC_015850	TGG	2	6	2538647	2538652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783218
46225	NC_015850	CAG	2	6	2538699	2538704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783218
46226	NC_015850	GCA	2	6	2538847	2538852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783219
46227	NC_015850	CCT	2	6	2538949	2538954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783219
46228	NC_015850	CAG	2	6	2538962	2538967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783219
46229	NC_015850	CCTTGA	2	12	2539000	2539011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783219
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46231	NC_015850	CTG	2	6	2539094	2539099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783219
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46464	NC_015850	GCA	2	6	2549950	2549955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783228
46465	NC_015850	GAG	2	6	2550064	2550069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783228
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46467	NC_015850	TCG	2	6	2550140	2550145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783229
46468	NC_015850	GCA	2	6	2550146	2550151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783229
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46482	NC_015850	CGG	2	6	2550830	2550835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783229
46483	NC_015850	CTGGAC	2	12	2550883	2550894	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783229
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46486	NC_015850	CTG	2	6	2550994	2550999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783229
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46490	NC_015850	GC	3	6	2551116	2551121	0 %	0 %	50 %	50 %	340783229
46491	NC_015850	CGG	2	6	2551146	2551151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783229
46492	NC_015850	GCC	2	6	2551159	2551164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783229
46493	NC_015850	CAA	2	6	2551273	2551278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783230
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