MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_015850	GCG	2	6	2428473	2428478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783114
44003	NC_015850	GAA	2	6	2428531	2428536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783114
44004	NC_015850	GGT	2	6	2428609	2428614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783114
44005	NC_015850	CGG	2	6	2428674	2428679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783114
44006	NC_015850	CCG	2	6	2428748	2428753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783114
44007	NC_015850	AAG	2	6	2428762	2428767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340783114
44008	NC_015850	TTACCA	2	12	2428853	2428864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783114
44009	NC_015850	TCG	2	6	2428907	2428912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783114
44010	NC_015850	CCG	2	6	2428942	2428947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783114
44011	NC_015850	TCA	2	6	2429024	2429029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783114
44012	NC_015850	GGA	2	6	2429031	2429036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783114
44013	NC_015850	TG	3	6	2429077	2429082	0 %	50 %	50 %	0 %	340783114
44014	NC_015850	GC	3	6	2429083	2429088	0 %	0 %	50 %	50 %	340783114
44015	NC_015850	GGC	2	6	2429089	2429094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783114
44016	NC_015850	GGGC	2	8	2429095	2429102	0 %	0 %	75 %	25 %	340783114
44017	NC_015850	GGA	2	6	2429106	2429111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783114
44018	NC_015850	GAC	2	6	2429140	2429145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783114
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44020	NC_015850	CTG	2	6	2429207	2429212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783115
44021	NC_015850	ACCC	2	8	2429264	2429271	25 %	0 %	0 %	75 %	340783115
44022	NC_015850	CAG	2	6	2429275	2429280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783115
44023	NC_015850	GTG	2	6	2429531	2429536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783115
44024	NC_015850	TGG	2	6	2429626	2429631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783115
44025	NC_015850	GGT	2	6	2429644	2429649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783115
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44027	NC_015850	GTCC	2	8	2429711	2429718	0 %	25 %	25 %	50 %	340783115
44028	NC_015850	TTG	2	6	2429738	2429743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783115
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44031	NC_015850	CGG	2	6	2429865	2429870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783115
44032	NC_015850	GCT	2	6	2430031	2430036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783116
44033	NC_015850	CGA	2	6	2430044	2430049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783116
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44035	NC_015850	CTG	2	6	2430100	2430105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783116
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44039	NC_015850	C	6	6	2430274	2430279	0 %	0 %	0 %	100 %	340783116
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44042	NC_015850	TGTGGC	2	12	2430332	2430343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340783116
44043	NC_015850	GAC	2	6	2430351	2430356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783116
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44048	NC_015850	GC	3	6	2430494	2430499	0 %	0 %	50 %	50 %	340783117
44049	NC_015850	CTT	2	6	2430500	2430505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783117
44050	NC_015850	GCT	2	6	2430515	2430520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783117
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44054	NC_015850	CGA	2	6	2430740	2430745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783117
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44056	NC_015850	GGA	2	6	2430791	2430796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783117
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44062	NC_015850	CG	4	8	2431004	2431011	0 %	0 %	50 %	50 %	340783117
44063	NC_015850	GCG	2	6	2431099	2431104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783117
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44116	NC_015850	GGC	2	6	2433480	2433485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783119
44117	NC_015850	CGC	2	6	2433494	2433499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783119
44118	NC_015850	CCG	2	6	2433530	2433535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783119
44119	NC_015850	ATC	2	6	2433574	2433579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783119
44120	NC_015850	GCC	2	6	2433580	2433585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783119
44121	NC_015850	TGA	2	6	2433629	2433634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783119
44122	NC_015850	GGC	2	6	2433721	2433726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783119
44123	NC_015850	GCCTG	2	10	2433744	2433753	0 %	20 %	40 %	40 %	340783119
44124	NC_015850	GCT	2	6	2433771	2433776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783119
44125	NC_015850	ACG	2	6	2433803	2433808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783119
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44127	NC_015850	CGG	2	6	2433834	2433839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783119
44128	NC_015850	TGA	2	6	2433863	2433868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783119
44129	NC_015850	TGC	2	6	2433873	2433878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783119
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44132	NC_015850	CGCAG	2	10	2434049	2434058	20 %	0 %	40 %	40 %	340783119
44133	NC_015850	CGA	2	6	2434116	2434121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783119
44134	NC_015850	GGGC	2	8	2434185	2434192	0 %	0 %	75 %	25 %	340783119
44135	NC_015850	GCA	2	6	2434205	2434210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783119
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44138	NC_015850	GCCG	2	8	2434410	2434417	0 %	0 %	50 %	50 %	340783119
44139	NC_015850	GCG	2	6	2434439	2434444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783119
44140	NC_015850	GGCT	2	8	2434528	2434535	0 %	25 %	50 %	25 %	340783119
44141	NC_015850	CG	3	6	2434536	2434541	0 %	0 %	50 %	50 %	340783119
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44143	NC_015850	CAC	2	6	2434788	2434793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783120
44144	NC_015850	GCCGG	2	10	2434836	2434845	0 %	0 %	60 %	40 %	340783120
44145	NC_015850	TGG	2	6	2434875	2434880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783120
44146	NC_015850	CGA	2	6	2434885	2434890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783120
44147	NC_015850	CCTGTG	2	12	2434939	2434950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783120
44148	NC_015850	GCT	2	6	2434970	2434975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783121
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44151	NC_015850	GCA	2	6	2435096	2435101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783121
44152	NC_015850	GTC	2	6	2435119	2435124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783121
44153	NC_015850	CGG	2	6	2435160	2435165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783121
44154	NC_015850	GTC	2	6	2435197	2435202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783121
44155	NC_015850	TCA	2	6	2435249	2435254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783121
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44168	NC_015850	CTGT	2	8	2435776	2435783	0 %	50 %	25 %	25 %	340783122
44169	NC_015850	GAG	2	6	2435784	2435789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783122
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44174	NC_015850	CGA	2	6	2435993	2435998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783122
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44176	NC_015850	GCGCA	2	10	2436013	2436022	20 %	0 %	40 %	40 %	340783122
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44179	NC_015850	CG	3	6	2436102	2436107	0 %	0 %	50 %	50 %	340783122
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44186	NC_015850	GCC	2	6	2436477	2436482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783122
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44192	NC_015850	GCC	2	6	2436691	2436696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783123
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44203	NC_015850	CG	3	6	2437244	2437249	0 %	0 %	50 %	50 %	340783123
44204	NC_015850	CTAT	2	8	2437250	2437257	25 %	50 %	0 %	25 %	340783123
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44212	NC_015850	CCA	2	6	2437634	2437639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783124
44213	NC_015850	GC	3	6	2437642	2437647	0 %	0 %	50 %	50 %	340783124
44214	NC_015850	CCA	2	6	2437727	2437732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783124
44215	NC_015850	GTCG	2	8	2437739	2437746	0 %	25 %	50 %	25 %	340783124
44216	NC_015850	AGC	2	6	2437817	2437822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44217	NC_015850	GAT	2	6	2437853	2437858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783124
44218	NC_015850	CGG	2	6	2437929	2437934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783124
44219	NC_015850	T	7	7	2437963	2437969	0 %	100 %	0 %	0 %	340783124
44220	NC_015850	GAT	2	6	2438025	2438030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783124
44221	NC_015850	GTG	2	6	2438035	2438040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783124
44222	NC_015850	TTCC	2	8	2438049	2438056	0 %	50 %	0 %	50 %	340783124
44223	NC_015850	AGT	2	6	2438114	2438119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783124
44224	NC_015850	CGA	3	9	2438141	2438149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44225	NC_015850	GGC	2	6	2438167	2438172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783124
44226	NC_015850	CAC	2	6	2438193	2438198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783124
44227	NC_015850	CGA	2	6	2438246	2438251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44228	NC_015850	TCG	2	6	2438254	2438259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44229	NC_015850	CAG	2	6	2438289	2438294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44230	NC_015850	TCG	2	6	2438299	2438304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783124
44231	NC_015850	CGAC	2	8	2438329	2438336	25 %	0 %	25 %	50 %	340783124
44232	NC_015850	CGA	2	6	2438387	2438392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783124
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44234	NC_015850	TCG	2	6	2438640	2438645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783125
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44238	NC_015850	GC	3	6	2438806	2438811	0 %	0 %	50 %	50 %	340783125
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44240	NC_015850	CGC	2	6	2438890	2438895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783125
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44262	NC_015850	ATC	2	6	2439701	2439706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783126
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44347	NC_015850	TCA	2	6	2442944	2442949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783129
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44454	NC_015850	TGGC	2	8	2448215	2448222	0 %	25 %	50 %	25 %	340783134
44455	NC_015850	GCC	2	6	2448260	2448265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
44456	NC_015850	AG	3	6	2448278	2448283	50 %	0 %	50 %	0 %	340783134
44457	NC_015850	GCC	2	6	2448299	2448304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
44458	NC_015850	GCATCG	2	12	2448311	2448322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783134
44459	NC_015850	GC	4	8	2448364	2448371	0 %	0 %	50 %	50 %	340783134
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44461	NC_015850	TCC	2	6	2448515	2448520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783134
44462	NC_015850	CTG	2	6	2448526	2448531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783134
44463	NC_015850	GCC	2	6	2448534	2448539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783134
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44473	NC_015850	GGC	2	6	2448876	2448881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783135
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44484	NC_015850	ACCA	2	8	2449331	2449338	50 %	0 %	0 %	50 %	340783136
44485	NC_015850	CAC	2	6	2449346	2449351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783136
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