MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_015850	GCG	2	6	2377905	2377910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783060
43003	NC_015850	GGC	2	6	2377921	2377926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783060
43004	NC_015850	TGG	2	6	2377950	2377955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783060
43005	NC_015850	TCG	2	6	2378010	2378015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783060
43006	NC_015850	ATG	2	6	2378016	2378021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783060
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43012	NC_015850	GC	3	6	2378132	2378137	0 %	0 %	50 %	50 %	340783060
43013	NC_015850	CG	3	6	2378191	2378196	0 %	0 %	50 %	50 %	340783060
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43017	NC_015850	TGC	2	6	2378368	2378373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783060
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43100	NC_015850	CCACT	2	10	2384511	2384520	20 %	20 %	0 %	60 %	340783067
43101	NC_015850	CAG	2	6	2384623	2384628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783067
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43103	NC_015850	CA	3	6	2384676	2384681	50 %	0 %	0 %	50 %	340783067
43104	NC_015850	GGA	2	6	2384868	2384873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783067
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43231	NC_015850	CG	3	6	2390440	2390445	0 %	0 %	50 %	50 %	340783074
43232	NC_015850	CGGC	2	8	2390466	2390473	0 %	0 %	50 %	50 %	340783074
43233	NC_015850	CAC	2	6	2390490	2390495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783074
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43235	NC_015850	CCACC	2	10	2390508	2390517	20 %	0 %	0 %	80 %	340783074
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43240	NC_015850	GTG	2	6	2390725	2390730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783074
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43464	NC_015850	CG	3	6	2400797	2400802	0 %	0 %	50 %	50 %	340783084
43465	NC_015850	GC	4	8	2400828	2400835	0 %	0 %	50 %	50 %	340783084
43466	NC_015850	GATC	2	8	2400836	2400843	25 %	25 %	25 %	25 %	340783084
43467	NC_015850	GAT	2	6	2400863	2400868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783084
43468	NC_015850	AC	3	6	2400887	2400892	50 %	0 %	0 %	50 %	340783084
43469	NC_015850	CCA	2	6	2400902	2400907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783084
43470	NC_015850	CA	3	6	2401008	2401013	50 %	0 %	0 %	50 %	340783084
43471	NC_015850	TGC	2	6	2401032	2401037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783084
43472	NC_015850	GCC	4	12	2401048	2401059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783084
43473	NC_015850	ACC	2	6	2401078	2401083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783084
43474	NC_015850	TCC	2	6	2401112	2401117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783085
43475	NC_015850	CAA	2	6	2401137	2401142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783085
43476	NC_015850	CCA	2	6	2401170	2401175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783085
43477	NC_015850	GCG	2	6	2401181	2401186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783085
43478	NC_015850	TCC	2	6	2401205	2401210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783085
43479	NC_015850	GC	3	6	2401237	2401242	0 %	0 %	50 %	50 %	340783085
43480	NC_015850	CCA	2	6	2401251	2401256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783085
43481	NC_015850	GGCTG	2	10	2401263	2401272	0 %	20 %	60 %	20 %	340783085
43482	NC_015850	CCG	2	6	2401335	2401340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43483	NC_015850	CG	3	6	2401339	2401344	0 %	0 %	50 %	50 %	340783085
43484	NC_015850	TCC	2	6	2401391	2401396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783085
43485	NC_015850	GCAC	2	8	2401430	2401437	25 %	0 %	25 %	50 %	340783085
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43488	NC_015850	GCA	2	6	2401578	2401583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783085
43489	NC_015850	CGC	2	6	2401811	2401816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43490	NC_015850	CGC	4	12	2401822	2401833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43491	NC_015850	GCAG	2	8	2401887	2401894	25 %	0 %	50 %	25 %	340783085
43492	NC_015850	CTGG	2	8	2401912	2401919	0 %	25 %	50 %	25 %	340783085
43493	NC_015850	GCC	2	6	2401936	2401941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43494	NC_015850	C	6	6	2401940	2401945	0 %	0 %	0 %	100 %	340783085
43495	NC_015850	CGC	2	6	2401952	2401957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43496	NC_015850	TGG	2	6	2402015	2402020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783085
43497	NC_015850	CGC	2	6	2402080	2402085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783085
43498	NC_015850	TCG	2	6	2402123	2402128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783085
43499	NC_015850	CGA	2	6	2402330	2402335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783086
43500	NC_015850	AGC	2	6	2402342	2402347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783086

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