MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_015850	GAC	2	6	2355134	2355139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783038
42503	NC_015850	TCG	2	6	2355162	2355167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783038
42504	NC_015850	GC	4	8	2355202	2355209	0 %	0 %	50 %	50 %	340783038
42505	NC_015850	GCCG	2	8	2355247	2355254	0 %	0 %	50 %	50 %	340783038
42506	NC_015850	CCCG	2	8	2355294	2355301	0 %	0 %	25 %	75 %	340783038
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42509	NC_015850	GCG	2	6	2355363	2355368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783038
42510	NC_015850	CCCGGC	2	12	2355372	2355383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783038
42511	NC_015850	CGC	2	6	2355404	2355409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783038
42512	NC_015850	CAG	2	6	2355410	2355415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783038
42513	NC_015850	GCT	2	6	2355418	2355423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783038
42514	NC_015850	GCC	2	6	2355453	2355458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783038
42515	NC_015850	CGA	2	6	2355493	2355498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783038
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42518	NC_015850	TCG	2	6	2355719	2355724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783039
42519	NC_015850	GCT	2	6	2355726	2355731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783039
42520	NC_015850	CCA	2	6	2355774	2355779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783039
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42522	NC_015850	CGA	2	6	2355828	2355833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783039
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42524	NC_015850	GCCC	2	8	2355912	2355919	0 %	0 %	25 %	75 %	340783039
42525	NC_015850	CGC	2	6	2355938	2355943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783039
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42532	NC_015850	CGTC	2	8	2356291	2356298	0 %	25 %	25 %	50 %	340783040
42533	NC_015850	TCG	2	6	2356306	2356311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783040
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42543	NC_015850	GC	3	6	2356725	2356730	0 %	0 %	50 %	50 %	340783040
42544	NC_015850	TCG	2	6	2356741	2356746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783040
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42552	NC_015850	CGA	2	6	2357112	2357117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783041
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42592	NC_015850	GGTG	2	8	2358463	2358470	0 %	25 %	75 %	0 %	340783042
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42596	NC_015850	GTA	2	6	2358853	2358858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783043
42597	NC_015850	CGA	2	6	2358885	2358890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783043
42598	NC_015850	GCCC	2	8	2359071	2359078	0 %	0 %	25 %	75 %	340783044
42599	NC_015850	CGA	2	6	2359144	2359149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783044
42600	NC_015850	TGT	2	6	2359192	2359197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783044
42601	NC_015850	CAT	2	6	2359211	2359216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783044
42602	NC_015850	GAT	2	6	2359283	2359288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783044
42603	NC_015850	GCC	2	6	2359301	2359306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783044
42604	NC_015850	TGG	2	6	2359327	2359332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783044
42605	NC_015850	GCCCT	2	10	2359352	2359361	0 %	20 %	20 %	60 %	340783044
42606	NC_015850	ATG	2	6	2359515	2359520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783044
42607	NC_015850	CCG	2	6	2359539	2359544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783044
42608	NC_015850	TTG	2	6	2359593	2359598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783044
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42610	NC_015850	ATC	2	6	2359632	2359637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783044
42611	NC_015850	AGC	2	6	2359695	2359700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783044
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42616	NC_015850	AAAC	2	8	2359820	2359827	75 %	0 %	0 %	25 %	340783044
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42618	NC_015850	CTT	2	6	2359974	2359979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783045
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42632	NC_015850	GGTG	2	8	2360578	2360585	0 %	25 %	75 %	0 %	340783045
42633	NC_015850	TGA	2	6	2360592	2360597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783045
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42646	NC_015850	CAC	2	6	2361154	2361159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783045
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42720	NC_015850	CGGCGC	2	12	2364897	2364908	0 %	0 %	50 %	50 %	340783049
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42727	NC_015850	TGC	2	6	2365229	2365234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783049
42728	NC_015850	GCC	2	6	2365255	2365260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783049
42729	NC_015850	CTG	2	6	2365273	2365278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783049
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42731	NC_015850	CG	5	10	2365407	2365416	0 %	0 %	50 %	50 %	340783049
42732	NC_015850	CAGCA	2	10	2365453	2365462	40 %	0 %	20 %	40 %	340783049
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42735	NC_015850	GCG	2	6	2365516	2365521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783049
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