MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42117	NC_015850	GGCG	2	8	2335838	2335845	0 %	0 %	75 %	25 %	340783017
42118	NC_015850	GGA	2	6	2335883	2335888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783017
42119	NC_015850	TACC	2	8	2335889	2335896	25 %	25 %	0 %	50 %	340783017
42120	NC_015850	CAT	2	6	2335911	2335916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783017
42121	NC_015850	ATG	2	6	2335948	2335953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783017
42122	NC_015850	ACC	2	6	2335969	2335974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783017
42123	NC_015850	TTG	2	6	2336038	2336043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783017
42124	NC_015850	GAC	2	6	2336048	2336053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783017
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42126	NC_015850	TGC	2	6	2336170	2336175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783017
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42128	NC_015850	GC	3	6	2336331	2336336	0 %	0 %	50 %	50 %	340783017
42129	NC_015850	GTCAGC	2	12	2336413	2336424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340783017
42130	NC_015850	GTG	2	6	2336460	2336465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783017
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42132	NC_015850	GCA	2	6	2336492	2336497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783017
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42134	NC_015850	ACGC	2	8	2336591	2336598	25 %	0 %	25 %	50 %	340783018
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42138	NC_015850	GC	3	6	2336801	2336806	0 %	0 %	50 %	50 %	340783018
42139	NC_015850	CATCGC	2	12	2336815	2336826	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340783018
42140	NC_015850	TGCG	2	8	2336922	2336929	0 %	25 %	50 %	25 %	340783018
42141	NC_015850	CGAG	2	8	2337007	2337014	25 %	0 %	50 %	25 %	340783018
42142	NC_015850	CCT	2	6	2337101	2337106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783019
42143	NC_015850	GTA	2	6	2337123	2337128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783019
42144	NC_015850	GTCC	2	8	2337237	2337244	0 %	25 %	25 %	50 %	340783019
42145	NC_015850	CCG	2	6	2337288	2337293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783019
42146	NC_015850	AGGT	2	8	2337398	2337405	25 %	25 %	50 %	0 %	340783019
42147	NC_015850	TGG	2	6	2337546	2337551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783019
42148	NC_015850	TCC	2	6	2337665	2337670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783019
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42150	NC_015850	GCCATT	2	12	2337760	2337771	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783019
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42152	NC_015850	CGC	2	6	2337828	2337833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783019
42153	NC_015850	TGG	2	6	2337906	2337911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783019
42154	NC_015850	CCACCG	2	12	2337915	2337926	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	340783019
42155	NC_015850	TGA	2	6	2337945	2337950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783019
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42213	NC_015850	GCTC	2	8	2341292	2341299	0 %	25 %	25 %	50 %	340783022
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42216	NC_015850	CG	3	6	2341518	2341523	0 %	0 %	50 %	50 %	340783022
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42222	NC_015850	CGG	2	6	2341822	2341827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783022
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42228	NC_015850	TGC	2	6	2342045	2342050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783022
42229	NC_015850	CGG	2	6	2342075	2342080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783022
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42231	NC_015850	CCG	2	6	2342142	2342147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783022
42232	NC_015850	GCA	2	6	2342156	2342161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783022
42233	NC_015850	CCA	2	6	2342186	2342191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783022
42234	NC_015850	TGG	2	6	2342195	2342200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783022
42235	NC_015850	TCG	2	6	2342203	2342208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783022
42236	NC_015850	TCG	2	6	2342263	2342268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783022
42237	NC_015850	GATC	2	8	2342282	2342289	25 %	25 %	25 %	25 %	340783022
42238	NC_015850	CGTGGA	2	12	2342306	2342317	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340783022
42239	NC_015850	TGC	2	6	2342323	2342328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783022
42240	NC_015850	GCC	2	6	2342453	2342458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783022
42241	NC_015850	GCA	2	6	2342498	2342503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783022
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42243	NC_015850	AAC	2	6	2342563	2342568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340783022
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42254	NC_015850	TGCGGG	2	12	2343115	2343126	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340783023
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42259	NC_015850	GCA	2	6	2343427	2343432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783023
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42261	NC_015850	A	6	6	2343474	2343479	100 %	0 %	0 %	0 %	340783023
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42303	NC_015850	GCG	3	9	2345479	2345487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783025
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42322	NC_015850	CGGTG	2	10	2346568	2346577	0 %	20 %	60 %	20 %	340783026
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42333	NC_015850	CG	3	6	2347063	2347068	0 %	0 %	50 %	50 %	340783028
42334	NC_015850	TGC	2	6	2347080	2347085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783028
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42338	NC_015850	CTG	2	6	2347235	2347240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783028
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42340	NC_015850	CTC	2	6	2347323	2347328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783029
42341	NC_015850	TCC	2	6	2347336	2347341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783029
42342	NC_015850	CTG	2	6	2347350	2347355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783029
42343	NC_015850	CTGA	2	8	2347377	2347384	25 %	25 %	25 %	25 %	340783029
42344	NC_015850	CA	3	6	2347409	2347414	50 %	0 %	0 %	50 %	340783029
42345	NC_015850	TCG	2	6	2347459	2347464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783029
42346	NC_015850	GC	3	6	2347530	2347535	0 %	0 %	50 %	50 %	340783029
42347	NC_015850	CGG	2	6	2347589	2347594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783029
42348	NC_015850	GGC	2	6	2347599	2347604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783029
42349	NC_015850	CCGTA	2	10	2347691	2347700	20 %	20 %	20 %	40 %	340783029
42350	NC_015850	GGT	2	6	2347761	2347766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783029
42351	NC_015850	CTT	2	6	2347814	2347819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340783029
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42354	NC_015850	CGT	2	6	2348000	2348005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783029
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42366	NC_015850	GCCC	2	8	2348527	2348534	0 %	0 %	25 %	75 %	340783029
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42414	NC_015850	CTA	2	6	2351054	2351059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340783033
42415	NC_015850	GATC	2	8	2351063	2351070	25 %	25 %	25 %	25 %	340783033
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42443	NC_015850	CGCGC	2	10	2352404	2352413	0 %	0 %	40 %	60 %	340783035
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42445	NC_015850	AGGA	2	8	2352461	2352468	50 %	0 %	50 %	0 %	340783035
42446	NC_015850	CCGT	2	8	2352489	2352496	0 %	25 %	25 %	50 %	340783035
42447	NC_015850	ATA	2	6	2352516	2352521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340783035
42448	NC_015850	CGG	2	6	2352542	2352547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783035
42449	NC_015850	GCA	2	6	2352641	2352646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783035
42450	NC_015850	CCG	2	6	2352673	2352678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783035
42451	NC_015850	CAG	2	6	2352753	2352758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783035
42452	NC_015850	TGC	2	6	2352778	2352783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783035
42453	NC_015850	GGC	2	6	2352822	2352827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783036
42454	NC_015850	CGA	3	9	2352869	2352877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783036
42455	NC_015850	CGG	2	6	2352881	2352886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783036
42456	NC_015850	GCCA	2	8	2352920	2352927	25 %	0 %	25 %	50 %	340783036
42457	NC_015850	CGGG	2	8	2353000	2353007	0 %	0 %	75 %	25 %	340783036
42458	NC_015850	GTG	2	6	2353008	2353013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783036
42459	NC_015850	GCT	2	6	2353097	2353102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783036
42460	NC_015850	CGC	2	6	2353103	2353108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340783036
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42462	NC_015850	CAC	2	6	2353143	2353148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783036
42463	NC_015850	GTCCC	2	10	2353206	2353215	0 %	20 %	20 %	60 %	340783036
42464	NC_015850	CCA	2	6	2353223	2353228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783036
42465	NC_015850	CACC	2	8	2353268	2353275	25 %	0 %	0 %	75 %	340783036
42466	NC_015850	AGC	2	6	2353306	2353311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783036
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42469	NC_015850	GCT	3	9	2353406	2353414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783036
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42475	NC_015850	GC	3	6	2353548	2353553	0 %	0 %	50 %	50 %	340783036
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42483	NC_015850	GC	3	6	2353961	2353966	0 %	0 %	50 %	50 %	340783037
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42491	NC_015850	CGA	2	6	2354556	2354561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783037
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42493	NC_015850	TCCT	2	8	2354599	2354606	0 %	50 %	0 %	50 %	340783037
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