MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_015850	GGCT	2	8	2303467	2303474	0 %	25 %	50 %	25 %	340782986
41503	NC_015850	GCC	2	6	2303547	2303552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782986
41504	NC_015850	GCA	3	9	2303574	2303582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782986
41505	NC_015850	GCC	2	6	2303593	2303598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782986
41506	NC_015850	CCT	2	6	2303625	2303630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782986
41507	NC_015850	TGG	2	6	2303642	2303647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782986
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41509	NC_015850	GCC	3	9	2303833	2303841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782986
41510	NC_015850	TGGG	2	8	2303858	2303865	0 %	25 %	75 %	0 %	340782986
41511	NC_015850	TGCCGG	2	12	2303937	2303948	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	340782986
41512	NC_015850	TGC	2	6	2303952	2303957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782986
41513	NC_015850	GAG	2	6	2304034	2304039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782986
41514	NC_015850	GCC	2	6	2304100	2304105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782986
41515	NC_015850	G	7	7	2304117	2304123	0 %	0 %	100 %	0 %	340782986
41516	NC_015850	GCCATC	2	12	2304145	2304156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782986
41517	NC_015850	CTG	2	6	2304199	2304204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782986
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41519	NC_015850	TCG	3	9	2304302	2304310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782986
41520	NC_015850	TGG	3	9	2304320	2304328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782986
41521	NC_015850	CAT	2	6	2304336	2304341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782986
41522	NC_015850	TGGT	2	8	2304373	2304380	0 %	50 %	50 %	0 %	340782986
41523	NC_015850	GCGG	2	8	2304390	2304397	0 %	0 %	75 %	25 %	340782986
41524	NC_015850	GC	3	6	2304430	2304435	0 %	0 %	50 %	50 %	340782986
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41553	NC_015850	CTTT	2	8	2305614	2305621	0 %	75 %	0 %	25 %	340782987
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41731	NC_015850	GTC	2	6	2314497	2314502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782996
41732	NC_015850	GTC	2	6	2314637	2314642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782996
41733	NC_015850	CAC	2	6	2314670	2314675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782996
41734	NC_015850	GC	3	6	2314684	2314689	0 %	0 %	50 %	50 %	340782996
41735	NC_015850	ACC	2	6	2314752	2314757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782996
41736	NC_015850	GGGTC	2	10	2314802	2314811	0 %	20 %	60 %	20 %	340782996
41737	NC_015850	CTGA	2	8	2314842	2314849	25 %	25 %	25 %	25 %	340782996
41738	NC_015850	TGG	2	6	2314874	2314879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782996
41739	NC_015850	GCA	2	6	2315024	2315029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782996
41740	NC_015850	GTA	2	6	2315034	2315039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782996
41741	NC_015850	CCG	2	6	2315093	2315098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782996
41742	NC_015850	GAC	2	6	2315121	2315126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782996
41743	NC_015850	CGA	2	6	2315153	2315158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782996
41744	NC_015850	CTC	2	6	2315169	2315174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782996
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41746	NC_015850	AAT	2	6	2315237	2315242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782996
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41750	NC_015850	TTG	2	6	2315644	2315649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782996
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41753	NC_015850	CTG	2	6	2316178	2316183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782997
41754	NC_015850	GAG	2	6	2316193	2316198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782997
41755	NC_015850	GTG	2	6	2316207	2316212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782997
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41757	NC_015850	ATC	2	6	2316274	2316279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782997
41758	NC_015850	GC	4	8	2316282	2316289	0 %	0 %	50 %	50 %	340782997
41759	NC_015850	TCCCG	2	10	2316292	2316301	0 %	20 %	20 %	60 %	340782997
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41762	NC_015850	TGC	2	6	2316356	2316361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782997
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41765	NC_015850	TGG	2	6	2316476	2316481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782997
41766	NC_015850	TCT	2	6	2316501	2316506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782997
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41832	NC_015850	CCT	2	6	2320998	2321003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
41833	NC_015850	TCG	2	6	2321072	2321077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783004
41834	NC_015850	GCA	2	6	2321079	2321084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783004
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41837	NC_015850	TCC	2	6	2321243	2321248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
41838	NC_015850	GCGCA	2	10	2321257	2321266	20 %	0 %	40 %	40 %	340783004
41839	NC_015850	CAG	2	6	2321323	2321328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340783004
41840	NC_015850	GTT	2	6	2321334	2321339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340783004
41841	NC_015850	TGCC	2	8	2321364	2321371	0 %	25 %	25 %	50 %	340783004
41842	NC_015850	GCAAG	2	10	2321376	2321385	40 %	0 %	40 %	20 %	340783004
41843	NC_015850	GGC	2	6	2321410	2321415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783004
41844	NC_015850	CCT	2	6	2321430	2321435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
41845	NC_015850	TCC	2	6	2321477	2321482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783004
41846	NC_015850	TCCTCG	2	12	2321486	2321497	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340783004
41847	NC_015850	CGG	2	6	2321523	2321528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340783004
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41852	NC_015850	CG	3	6	2321717	2321722	0 %	0 %	50 %	50 %	340783004
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41957	NC_015850	GGA	2	6	2326503	2326508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340783007
41958	NC_015850	GATCTC	2	12	2326519	2326530	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340783007
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41960	NC_015850	ACC	2	6	2326561	2326566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340783007
41961	NC_015850	CTG	2	6	2326576	2326581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783007
41962	NC_015850	GCT	2	6	2326596	2326601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783007
41963	NC_015850	TGA	2	6	2326602	2326607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783007
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41973	NC_015850	CTTGCG	2	12	2326845	2326856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783008
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41983	NC_015850	TGG	2	6	2327566	2327571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340783009
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41988	NC_015850	CTC	2	6	2327899	2327904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340783009
41989	NC_015850	TGA	2	6	2327924	2327929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340783009
41990	NC_015850	GC	3	6	2328027	2328032	0 %	0 %	50 %	50 %	340783009
41991	NC_015850	CTG	2	6	2328034	2328039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340783009
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