MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_015850	CAC	2	6	2277186	2277191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782964
41003	NC_015850	AG	3	6	2277231	2277236	50 %	0 %	50 %	0 %	340782964
41004	NC_015850	TCA	2	6	2277397	2277402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782965
41005	NC_015850	TGC	2	6	2277525	2277530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782965
41006	NC_015850	AAT	2	6	2277613	2277618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782965
41007	NC_015850	ATCA	2	8	2277692	2277699	50 %	25 %	0 %	25 %	340782965
41008	NC_015850	A	6	6	2277719	2277724	100 %	0 %	0 %	0 %	340782965
41009	NC_015850	CAC	2	6	2277779	2277784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782965
41010	NC_015850	GATA	2	8	2277820	2277827	50 %	25 %	25 %	0 %	340782965
41011	NC_015850	GA	3	6	2277957	2277962	50 %	0 %	50 %	0 %	340782965
41012	NC_015850	GGCGAC	2	12	2277965	2277976	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782965
41013	NC_015850	GAA	2	6	2277995	2278000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782965
41014	NC_015850	CCTCCA	2	12	2278041	2278052	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	340782965
41015	NC_015850	ATG	2	6	2278086	2278091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782965
41016	NC_015850	ATC	2	6	2278131	2278136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782965
41017	NC_015850	CCA	2	6	2278184	2278189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782965
41018	NC_015850	GC	4	8	2278199	2278206	0 %	0 %	50 %	50 %	340782965
41019	NC_015850	CAG	2	6	2278229	2278234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782965
41020	NC_015850	T	7	7	2278267	2278273	0 %	100 %	0 %	0 %	340782965
41021	NC_015850	CTT	2	6	2280029	2280034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782966
41022	NC_015850	CGAT	2	8	2280111	2280118	25 %	25 %	25 %	25 %	340782966
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41026	NC_015850	GAT	2	6	2280281	2280286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782966
41027	NC_015850	GGC	2	6	2280344	2280349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782966
41028	NC_015850	CGA	2	6	2280463	2280468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782966
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41041	NC_015850	CGA	2	6	2281197	2281202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782967
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41050	NC_015850	CGA	2	6	2281554	2281559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782967
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41461	NC_015850	AGG	2	6	2301205	2301210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782984
41462	NC_015850	CG	3	6	2301271	2301276	0 %	0 %	50 %	50 %	340782984
41463	NC_015850	CG	3	6	2301284	2301289	0 %	0 %	50 %	50 %	340782984
41464	NC_015850	CGC	2	6	2301302	2301307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782984
41465	NC_015850	GTCC	2	8	2301315	2301322	0 %	25 %	25 %	50 %	340782984
41466	NC_015850	CAC	2	6	2301399	2301404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782984
41467	NC_015850	CGA	2	6	2301461	2301466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782984
41468	NC_015850	GGC	2	6	2301486	2301491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782984
41469	NC_015850	ATG	2	6	2301550	2301555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782984
41470	NC_015850	CA	3	6	2301558	2301563	50 %	0 %	0 %	50 %	340782984
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41472	NC_015850	GCTCAC	2	12	2301638	2301649	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782984
41473	NC_015850	GCG	2	6	2301662	2301667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782984
41474	NC_015850	GCA	2	6	2301676	2301681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782984
41475	NC_015850	CTGCC	2	10	2301707	2301716	0 %	20 %	20 %	60 %	340782984
41476	NC_015850	CAC	2	6	2301720	2301725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782984
41477	NC_015850	CGA	2	6	2301728	2301733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782984
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41480	NC_015850	GTC	2	6	2301777	2301782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782984
41481	NC_015850	CAG	2	6	2301807	2301812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782984
41482	NC_015850	TGG	2	6	2301953	2301958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782984
41483	NC_015850	CTC	2	6	2301967	2301972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782984
41484	NC_015850	TCG	2	6	2302296	2302301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782985
41485	NC_015850	CCT	2	6	2302336	2302341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782985
41486	NC_015850	TCG	2	6	2302347	2302352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782985
41487	NC_015850	GGT	2	6	2302373	2302378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782985
41488	NC_015850	CGA	3	9	2302414	2302422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782985
41489	NC_015850	CTG	2	6	2302433	2302438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782985
41490	NC_015850	GCC	2	6	2302443	2302448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782985
41491	NC_015850	GCCCT	2	10	2302511	2302520	0 %	20 %	20 %	60 %	340782985
41492	NC_015850	G	6	6	2302627	2302632	0 %	0 %	100 %	0 %	340782985
41493	NC_015850	GTGGCG	2	12	2302646	2302657	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340782985
41494	NC_015850	CG	3	6	2302656	2302661	0 %	0 %	50 %	50 %	340782985
41495	NC_015850	AGCG	2	8	2302764	2302771	25 %	0 %	50 %	25 %	340782985
41496	NC_015850	TGC	2	6	2302807	2302812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782985
41497	NC_015850	GGC	2	6	2302898	2302903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782986
41498	NC_015850	GCAG	2	8	2302995	2303002	25 %	0 %	50 %	25 %	340782986
41499	NC_015850	CGG	2	6	2303016	2303021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782986
41500	NC_015850	GCCGC	2	10	2303128	2303137	0 %	0 %	40 %	60 %	340782986

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