MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_015850	GCC	2	6	2223646	2223651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782915
40003	NC_015850	CCG	2	6	2223697	2223702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782915
40004	NC_015850	CG	3	6	2223768	2223773	0 %	0 %	50 %	50 %	340782916
40005	NC_015850	TGAA	2	8	2223781	2223788	50 %	25 %	25 %	0 %	340782916
40006	NC_015850	CGC	2	6	2223833	2223838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782916
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40008	NC_015850	CCGC	2	8	2223904	2223911	0 %	0 %	25 %	75 %	340782916
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40012	NC_015850	CGTC	2	8	2224112	2224119	0 %	25 %	25 %	50 %	340782916
40013	NC_015850	TCG	2	6	2224120	2224125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782916
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40019	NC_015850	CGG	3	9	2224319	2224327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782916
40020	NC_015850	GCA	2	6	2224370	2224375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782916
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40228	NC_015850	T	6	6	2233421	2233426	0 %	100 %	0 %	0 %	340782925
40229	NC_015850	ACG	2	6	2233491	2233496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782926
40230	NC_015850	CGT	2	6	2233506	2233511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782926
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40233	NC_015850	CGGC	2	8	2233604	2233611	0 %	0 %	50 %	50 %	340782926
40234	NC_015850	AAT	2	6	2233700	2233705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782926
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40348	NC_015850	CGA	2	6	2241301	2241306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782934
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40462	NC_015850	GTC	2	6	2246979	2246984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782938
40463	NC_015850	A	7	7	2247098	2247104	100 %	0 %	0 %	0 %	340782938
40464	NC_015850	CAG	2	6	2247105	2247110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782938
40465	NC_015850	TCT	2	6	2247169	2247174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782938
40466	NC_015850	CCA	2	6	2247275	2247280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782938
40467	NC_015850	A	6	6	2247327	2247332	100 %	0 %	0 %	0 %	340782938
40468	NC_015850	GCC	2	6	2247419	2247424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782938
40469	NC_015850	CCA	2	6	2247440	2247445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782938
40470	NC_015850	GCG	2	6	2247458	2247463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782938
40471	NC_015850	GTC	2	6	2247490	2247495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782938
40472	NC_015850	GC	3	6	2247523	2247528	0 %	0 %	50 %	50 %	340782938
40473	NC_015850	ATG	3	9	2247586	2247594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782938
40474	NC_015850	ATC	2	6	2247654	2247659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782938
40475	NC_015850	GGA	2	6	2247662	2247667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782938
40476	NC_015850	CTG	2	6	2247719	2247724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782939
40477	NC_015850	AGC	2	6	2247753	2247758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
40478	NC_015850	GAG	2	6	2247827	2247832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782939
40479	NC_015850	CAG	2	6	2247869	2247874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
40480	NC_015850	GC	3	6	2247906	2247911	0 %	0 %	50 %	50 %	340782939
40481	NC_015850	ATA	2	6	2247977	2247982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340782939
40482	NC_015850	CGA	2	6	2247997	2248002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782939
40483	NC_015850	GGA	2	6	2248025	2248030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782939
40484	NC_015850	CAA	2	6	2248259	2248264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782940
40485	NC_015850	CAG	2	6	2248282	2248287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782940
40486	NC_015850	TGG	2	6	2248356	2248361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782940
40487	NC_015850	CGG	2	6	2248369	2248374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782940
40488	NC_015850	GTGGC	2	10	2248424	2248433	0 %	20 %	60 %	20 %	340782940
40489	NC_015850	CGG	2	6	2248549	2248554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782940
40490	NC_015850	GGC	2	6	2248564	2248569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782940
40491	NC_015850	C	6	6	2248569	2248574	0 %	0 %	0 %	100 %	340782940
40492	NC_015850	T	6	6	2248589	2248594	0 %	100 %	0 %	0 %	340782940
40493	NC_015850	CTG	2	6	2248862	2248867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782940
40494	NC_015850	GGC	2	6	2248874	2248879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782940
40495	NC_015850	CCG	2	6	2248887	2248892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782940
40496	NC_015850	CGCC	2	8	2248909	2248916	0 %	0 %	25 %	75 %	340782940
40497	NC_015850	CAG	2	6	2248945	2248950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782940
40498	NC_015850	TGG	2	6	2248959	2248964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782940
40499	NC_015850	TCGCCA	2	12	2249085	2249096	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782940
40500	NC_015850	CGC	2	6	2249113	2249118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782940

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