MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_015850	GCC	3	9	1848025	1848033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782530
34003	NC_015850	GCA	2	6	1848050	1848055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782530
34004	NC_015850	CGC	2	6	1848082	1848087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782530
34005	NC_015850	GAT	2	6	1848194	1848199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782530
34006	NC_015850	GGC	2	6	1848245	1848250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782530
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34008	NC_015850	GCT	2	6	1848449	1848454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782530
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34010	NC_015850	GAC	2	6	1848504	1848509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782530
34011	NC_015850	TAGGG	2	10	1848524	1848533	20 %	20 %	60 %	0 %	340782530
34012	NC_015850	GCA	2	6	1848584	1848589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782530
34013	NC_015850	CTG	2	6	1848600	1848605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782530
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34016	NC_015850	C	8	8	1848650	1848657	0 %	0 %	0 %	100 %	340782530
34017	NC_015850	GCC	2	6	1848705	1848710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782530
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34019	NC_015850	GCC	2	6	1848901	1848906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782531
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34022	NC_015850	TCA	2	6	1849000	1849005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782531
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34024	NC_015850	GCA	2	6	1849261	1849266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782531
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34030	NC_015850	CGA	2	6	1849577	1849582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782531
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34058	NC_015850	TGGG	2	8	1851068	1851075	0 %	25 %	75 %	0 %	340782533
34059	NC_015850	GCA	3	9	1851103	1851111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782533
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34117	NC_015850	GGT	2	6	1854414	1854419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782535
34118	NC_015850	AGA	2	6	1854457	1854462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782535
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34132	NC_015850	GCC	2	6	1855093	1855098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782535
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34147	NC_015850	GCC	2	6	1856258	1856263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782537
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34213	NC_015850	GT	3	6	1862365	1862370	0 %	50 %	50 %	0 %	340782543
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34229	NC_015850	CAG	2	6	1863147	1863152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782543
34230	NC_015850	TGCA	2	8	1863337	1863344	25 %	25 %	25 %	25 %	340782543
34231	NC_015850	GCG	2	6	1863407	1863412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782544
34232	NC_015850	GAT	2	6	1863437	1863442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782544
34233	NC_015850	TGCG	2	8	1863570	1863577	0 %	25 %	50 %	25 %	340782544
34234	NC_015850	TGA	2	6	1863586	1863591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782544
34235	NC_015850	GGC	2	6	1863681	1863686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782544
34236	NC_015850	GGA	2	6	1863703	1863708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782544
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34238	NC_015850	GCCA	2	8	1863786	1863793	25 %	0 %	25 %	50 %	340782545
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34242	NC_015850	GCT	2	6	1864020	1864025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782545
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34247	NC_015850	CAT	2	6	1865519	1865524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782547
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34249	NC_015850	TCT	2	6	1865585	1865590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782547
34250	NC_015850	GT	4	8	1865669	1865676	0 %	50 %	50 %	0 %	340782547
34251	NC_015850	ATC	2	6	1865711	1865716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782547
34252	NC_015850	GTT	2	6	1865816	1865821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782547
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34254	NC_015850	GTA	2	6	1865903	1865908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782547
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34257	NC_015850	CATG	2	8	1865980	1865987	25 %	25 %	25 %	25 %	340782547
34258	NC_015850	TGT	2	6	1866010	1866015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782547
34259	NC_015850	CGA	2	6	1866222	1866227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782548
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34261	NC_015850	CGTC	2	8	1866804	1866811	0 %	25 %	25 %	50 %	340782549
34262	NC_015850	CCT	2	6	1866828	1866833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782549
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34270	NC_015850	GA	3	6	1867233	1867238	50 %	0 %	50 %	0 %	340782550
34271	NC_015850	TCT	2	6	1867255	1867260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782550
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34332	NC_015850	CCG	2	6	1872360	1872365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782557
34333	NC_015850	CTG	2	6	1872395	1872400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782557
34334	NC_015850	CCGTG	2	10	1872418	1872427	0 %	20 %	40 %	40 %	340782557
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34339	NC_015850	GCCTCG	2	12	1872660	1872671	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340782557
34340	NC_015850	GGT	2	6	1872672	1872677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782557
34341	NC_015850	GTGG	2	8	1872725	1872732	0 %	25 %	75 %	0 %	340782557
34342	NC_015850	CGA	2	6	1872733	1872738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782557
34343	NC_015850	CGA	2	6	1872799	1872804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782557
34344	NC_015850	AGT	2	6	1872820	1872825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782557
34345	NC_015850	G	6	6	1872891	1872896	0 %	0 %	100 %	0 %	340782557
34346	NC_015850	GCA	2	6	1872913	1872918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782557
34347	NC_015850	GTG	2	6	1872963	1872968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782557
34348	NC_015850	GCT	2	6	1873012	1873017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782557
34349	NC_015850	GTCCCG	2	12	1873028	1873039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340782557
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34448	NC_015850	AGGGAA	2	12	1880969	1880980	50 %	0 %	50 %	0 %	340782562
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34459	NC_015850	AGAA	2	8	1881781	1881788	75 %	0 %	25 %	0 %	340782563
34460	NC_015850	GAG	2	6	1881831	1881836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782563
34461	NC_015850	CAT	2	6	1881852	1881857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782563
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34463	NC_015850	CGC	2	6	1881996	1882001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782564
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