MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30005	NC_015850	GCGA	2	8	1637130	1637137	25 %	0 %	50 %	25 %	340782333
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30222	NC_015850	TTC	2	6	1653167	1653172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782348
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30230	NC_015850	GCG	2	6	1653654	1653659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782348
30231	NC_015850	TCT	2	6	1653774	1653779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782348
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30348	NC_015850	GGCG	2	8	1659873	1659880	0 %	0 %	75 %	25 %	340782356
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30350	NC_015850	CTG	2	6	1660024	1660029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782356
30351	NC_015850	CA	3	6	1660034	1660039	50 %	0 %	0 %	50 %	340782356
30352	NC_015850	TGG	2	6	1660061	1660066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782356
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30354	NC_015850	G	6	6	1660196	1660201	0 %	0 %	100 %	0 %	340782356
30355	NC_015850	TGG	2	6	1660274	1660279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782356
30356	NC_015850	ACT	2	6	1660355	1660360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782356
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30455	NC_015850	ATC	2	6	1666214	1666219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782366
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30457	NC_015850	CAG	2	6	1666402	1666407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782366
30458	NC_015850	CT	3	6	1666453	1666458	0 %	50 %	0 %	50 %	340782366
30459	NC_015850	AT	3	6	1666513	1666518	50 %	50 %	0 %	0 %	340782366
30460	NC_015850	GGA	2	6	1666560	1666565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782366
30461	NC_015850	CGT	2	6	1666768	1666773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782366
30462	NC_015850	CAA	2	6	1666819	1666824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340782366
30463	NC_015850	T	6	6	1666918	1666923	0 %	100 %	0 %	0 %	340782366
30464	NC_015850	TTC	2	6	1668130	1668135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782367
30465	NC_015850	GAA	2	6	1668239	1668244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782368
30466	NC_015850	CAG	2	6	1668272	1668277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782368
30467	NC_015850	CGA	2	6	1668313	1668318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782368
30468	NC_015850	GCG	2	6	1668325	1668330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782368
30469	NC_015850	GC	3	6	1668388	1668393	0 %	0 %	50 %	50 %	340782368
30470	NC_015850	CAT	2	6	1668439	1668444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782368
30471	NC_015850	TGG	2	6	1668460	1668465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782368
30472	NC_015850	GCTG	2	8	1668481	1668488	0 %	25 %	50 %	25 %	340782368
30473	NC_015850	GTC	2	6	1668534	1668539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782368
30474	NC_015850	CGG	2	6	1668549	1668554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782368
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30477	NC_015850	TCC	2	6	1668668	1668673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782369
30478	NC_015850	CAG	2	6	1668729	1668734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782369
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30480	NC_015850	GCA	2	6	1668746	1668751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782369
30481	NC_015850	GCTG	2	8	1668785	1668792	0 %	25 %	50 %	25 %	340782369
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30483	NC_015850	CAG	2	6	1668876	1668881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782369
30484	NC_015850	AGC	3	9	1668883	1668891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782369
30485	NC_015850	ACCGCA	2	12	1668971	1668982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	340782369
30486	NC_015850	G	6	6	1669016	1669021	0 %	0 %	100 %	0 %	340782369
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30488	NC_015850	AAAG	2	8	1669434	1669441	75 %	0 %	25 %	0 %	340782370
30489	NC_015850	CT	3	6	1669529	1669534	0 %	50 %	0 %	50 %	340782370
30490	NC_015850	CGC	2	6	1669595	1669600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782370
30491	NC_015850	CGT	2	6	1669636	1669641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782370
30492	NC_015850	CTT	2	6	1669663	1669668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340782370
30493	NC_015850	C	6	6	1669729	1669734	0 %	0 %	0 %	100 %	340782370
30494	NC_015850	GGCGC	2	10	1669813	1669822	0 %	0 %	60 %	40 %	340782370
30495	NC_015850	GCG	2	6	1669825	1669830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782370
30496	NC_015850	TCGC	2	8	1669904	1669911	0 %	25 %	25 %	50 %	340782370
30497	NC_015850	GCCG	2	8	1669972	1669979	0 %	0 %	50 %	50 %	340782370
30498	NC_015850	TCG	2	6	1670154	1670159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782370
30499	NC_015850	GGT	2	6	1670837	1670842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782371
30500	NC_015850	CAC	2	6	1670926	1670931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782371

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