MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_015850	CTG	2	6	1549265	1549270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782250
28503	NC_015850	ACG	2	6	1549329	1549334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782250
28504	NC_015850	CTGG	2	8	1549395	1549402	0 %	25 %	50 %	25 %	340782250
28505	NC_015850	CAGC	2	8	1549473	1549480	25 %	0 %	25 %	50 %	340782250
28506	NC_015850	CGC	2	6	1549537	1549542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782250
28507	NC_015850	CCAGGG	2	12	1549654	1549665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340782250
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28509	NC_015850	GCG	2	6	1549698	1549703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782250
28510	NC_015850	CGGCAT	2	12	1549767	1549778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782251
28511	NC_015850	CACCGG	2	12	1549918	1549929	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340782251
28512	NC_015850	GC	3	6	1549945	1549950	0 %	0 %	50 %	50 %	340782251
28513	NC_015850	CCT	2	6	1549956	1549961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782251
28514	NC_015850	AGG	2	6	1550006	1550011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782251
28515	NC_015850	GGC	2	6	1550032	1550037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782251
28516	NC_015850	CCG	2	6	1550059	1550064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782251
28517	NC_015850	CCG	2	6	1550077	1550082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782251
28518	NC_015850	CGC	2	6	1550166	1550171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782251
28519	NC_015850	AGC	2	6	1550204	1550209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782251
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28521	NC_015850	CCA	2	6	1550388	1550393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782251
28522	NC_015850	CG	3	6	1550414	1550419	0 %	0 %	50 %	50 %	340782251
28523	NC_015850	CGC	2	6	1550486	1550491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782251
28524	NC_015850	TCAG	2	8	1550554	1550561	25 %	25 %	25 %	25 %	340782252
28525	NC_015850	GCCA	2	8	1550595	1550602	25 %	0 %	25 %	50 %	340782252
28526	NC_015850	AGAT	2	8	1550755	1550762	50 %	25 %	25 %	0 %	340782252
28527	NC_015850	G	6	6	1550777	1550782	0 %	0 %	100 %	0 %	340782252
28528	NC_015850	TC	3	6	1550807	1550812	0 %	50 %	0 %	50 %	340782252
28529	NC_015850	GCG	2	6	1550846	1550851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782252
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28531	NC_015850	CGC	2	6	1550926	1550931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782252
28532	NC_015850	TGC	2	6	1550965	1550970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782252
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28534	NC_015850	ATGGCC	2	12	1551031	1551042	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782252
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28541	NC_015850	CCG	2	6	1551457	1551462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782253
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28550	NC_015850	ACG	2	6	1551962	1551967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782254
28551	NC_015850	CCT	2	6	1552006	1552011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782254
28552	NC_015850	CCA	2	6	1552022	1552027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782254
28553	NC_015850	CGA	2	6	1552057	1552062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782254
28554	NC_015850	GGC	2	6	1552100	1552105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782254
28555	NC_015850	CGG	2	6	1552152	1552157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782254
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28558	NC_015850	TGC	2	6	1552302	1552307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782254
28559	NC_015850	AGGCG	2	10	1552402	1552411	20 %	0 %	60 %	20 %	340782254
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28561	NC_015850	GC	3	6	1552562	1552567	0 %	0 %	50 %	50 %	340782254
28562	NC_015850	CAG	2	6	1552580	1552585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782254
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28565	NC_015850	CATC	2	8	1552624	1552631	25 %	25 %	0 %	50 %	340782254
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28567	NC_015850	GCACG	2	10	1552657	1552666	20 %	0 %	40 %	40 %	340782254
28568	NC_015850	GTA	2	6	1552787	1552792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782254
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28599	NC_015850	CGG	2	6	1554234	1554239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
28600	NC_015850	TCG	2	6	1554252	1554257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782256
28601	NC_015850	CGG	2	6	1554340	1554345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
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28604	NC_015850	CAC	2	6	1554433	1554438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782256
28605	NC_015850	TCG	2	6	1554444	1554449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782256
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28608	NC_015850	TGG	2	6	1554594	1554599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782256
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28610	NC_015850	GCA	2	6	1554700	1554705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782256
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28612	NC_015850	CGG	3	9	1554804	1554812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782256
28613	NC_015850	GC	3	6	1554896	1554901	0 %	0 %	50 %	50 %	340782256
28614	NC_015850	TCA	2	6	1554903	1554908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782256
28615	NC_015850	GGCG	2	8	1554919	1554926	0 %	0 %	75 %	25 %	340782256
28616	NC_015850	AAG	2	6	1554963	1554968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782256
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28627	NC_015850	CGC	2	6	1555621	1555626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782257
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28963	NC_015850	CTG	2	6	1575261	1575266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782272
28964	NC_015850	GC	4	8	1575277	1575284	0 %	0 %	50 %	50 %	340782272
28965	NC_015850	GAT	2	6	1575384	1575389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782272
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28967	NC_015850	CATCGT	2	12	1575533	1575544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340782272
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28969	NC_015850	GGGT	2	8	1575707	1575714	0 %	25 %	75 %	0 %	340782272
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28974	NC_015850	CGC	2	6	1575969	1575974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782272
28975	NC_015850	GATCGC	2	12	1576049	1576060	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340782272
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28981	NC_015850	CAG	2	6	1576356	1576361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782272
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28990	NC_015850	GAC	2	6	1576853	1576858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782273
28991	NC_015850	CGC	3	9	1576871	1576879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782273
28992	NC_015850	GGC	2	6	1576964	1576969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782273
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28994	NC_015850	CG	3	6	1577029	1577034	0 %	0 %	50 %	50 %	340782273
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