MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_015850	TCA	2	6	1524519	1524524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782227
28002	NC_015850	GCA	2	6	1524537	1524542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782227
28003	NC_015850	TCC	2	6	1524549	1524554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782227
28004	NC_015850	GCG	2	6	1524599	1524604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
28005	NC_015850	T	6	6	1524623	1524628	0 %	100 %	0 %	0 %	340782227
28006	NC_015850	GC	3	6	1524643	1524648	0 %	0 %	50 %	50 %	340782227
28007	NC_015850	GAC	2	6	1524665	1524670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782227
28008	NC_015850	GGC	2	6	1524709	1524714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782227
28009	NC_015850	TCC	2	6	1524726	1524731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782227
28010	NC_015850	GGT	2	6	1524776	1524781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782227
28011	NC_015850	CGC	3	9	1524821	1524829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
28012	NC_015850	ATC	2	6	1524832	1524837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340782228
28013	NC_015850	CCG	2	6	1524839	1524844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
28014	NC_015850	ATCCGC	2	12	1524849	1524860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340782228
28015	NC_015850	CCTGG	2	10	1524913	1524922	0 %	20 %	40 %	40 %	340782228
28016	NC_015850	CCG	2	6	1524934	1524939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
28017	NC_015850	CAC	2	6	1524966	1524971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782228
28018	NC_015850	GCG	2	6	1525000	1525005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782228
28019	NC_015850	GAG	2	6	1525006	1525011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782228
28020	NC_015850	CAG	2	6	1525039	1525044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782228
28021	NC_015850	GCAG	2	8	1525065	1525072	25 %	0 %	50 %	25 %	340782228
28022	NC_015850	GCC	2	6	1525141	1525146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
28023	NC_015850	ACC	2	6	1525210	1525215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782228
28024	NC_015850	GTC	2	6	1525274	1525279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
28025	NC_015850	GCT	2	6	1525284	1525289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
28026	NC_015850	TGC	2	6	1525316	1525321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
28027	NC_015850	GGAG	2	8	1525413	1525420	25 %	0 %	75 %	0 %	340782228
28028	NC_015850	CGT	2	6	1525425	1525430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782228
28029	NC_015850	CCG	2	6	1525437	1525442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782228
28030	NC_015850	TGG	2	6	1525660	1525665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
28031	NC_015850	GCC	2	6	1525725	1525730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
28032	NC_015850	GGT	2	6	1525754	1525759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
28033	NC_015850	GGC	2	6	1525790	1525795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
28034	NC_015850	GC	4	8	1526053	1526060	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
28035	NC_015850	TTG	2	6	1526100	1526105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340782229
28036	NC_015850	ATG	2	6	1526109	1526114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340782229
28037	NC_015850	TCG	3	9	1526140	1526148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782229
28038	NC_015850	GCG	2	6	1526216	1526221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
28039	NC_015850	GTG	2	6	1526226	1526231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
28040	NC_015850	GCC	2	6	1526235	1526240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
28041	NC_015850	CCG	2	6	1526242	1526247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782229
28042	NC_015850	GTG	2	6	1526272	1526277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340782229
28043	NC_015850	GCA	2	6	1526321	1526326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782229
28044	NC_015850	TGC	3	9	1526329	1526337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782229
28045	NC_015850	ACCC	2	8	1526419	1526426	25 %	0 %	0 %	75 %	340782229
28046	NC_015850	GC	3	6	1526436	1526441	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
28047	NC_015850	GCCC	2	8	1526444	1526451	0 %	0 %	25 %	75 %	340782229
28048	NC_015850	CAG	2	6	1526532	1526537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782229
28049	NC_015850	GC	5	10	1526554	1526563	0 %	0 %	50 %	50 %	340782229
28050	NC_015850	CGG	2	6	1526761	1526766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
28051	NC_015850	GCAG	2	8	1526864	1526871	25 %	0 %	50 %	25 %	340782229
28052	NC_015850	GGC	2	6	1526876	1526881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782229
28053	NC_015850	CAC	2	6	1526915	1526920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340782229
28054	NC_015850	GAA	2	6	1526969	1526974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340782230
28055	NC_015850	GCT	2	6	1526977	1526982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
28056	NC_015850	GCCA	2	8	1526996	1527003	25 %	0 %	25 %	50 %	340782230
28057	NC_015850	TGC	2	6	1527018	1527023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
28058	NC_015850	GCTC	2	8	1527031	1527038	0 %	25 %	25 %	50 %	340782230
28059	NC_015850	CAG	2	6	1527044	1527049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782230
28060	NC_015850	GC	3	6	1527119	1527124	0 %	0 %	50 %	50 %	340782230
28061	NC_015850	GCG	2	6	1527166	1527171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782230
28062	NC_015850	CGG	3	9	1527230	1527238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340782230
28063	NC_015850	CTG	2	6	1527248	1527253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782230
28064	NC_015850	TCC	2	6	1527300	1527305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340782230
28065	NC_015850	GCA	3	9	1527322	1527330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782230
28066	NC_015850	GGA	2	6	1527676	1527681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782231
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28071	NC_015850	CGC	2	6	1527790	1527795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
28072	NC_015850	G	6	6	1527822	1527827	0 %	0 %	100 %	0 %	340782231
28073	NC_015850	GCC	2	6	1527919	1527924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
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28076	NC_015850	CAG	2	6	1528100	1528105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782231
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28082	NC_015850	GCT	2	6	1528334	1528339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782231
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28087	NC_015850	GGCCA	2	10	1528595	1528604	20 %	0 %	40 %	40 %	340782231
28088	NC_015850	GTGC	2	8	1528634	1528641	0 %	25 %	50 %	25 %	340782231
28089	NC_015850	GCC	2	6	1528652	1528657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340782231
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28115	NC_015850	GGA	2	6	1530059	1530064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782233
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28231	NC_015850	TCG	2	6	1535493	1535498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782239
28232	NC_015850	GGA	2	6	1535509	1535514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340782239
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28344	NC_015850	CTCCC	2	10	1541142	1541151	0 %	20 %	0 %	80 %	340782244
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28347	NC_015850	TGC	2	6	1541425	1541430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340782244
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28450	NC_015850	CGA	2	6	1546832	1546837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340782249
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